우리나라 참나리 2, 3배체 집단에서의 EST-SSR을 이용한 Analysis of Genetic Variation in Native Korean Tiger lily (Lilium lancifolium Thunb.) by EST-SSRs.
- 언어KOR
- URLhttp://db.koreascholar.com/Article/Detail/243696
pp.75-82
우리나라 참나리 2배체와 3배체 중 임의 선발된 56 개 지역의 참나리에 대하여 EST-SSR이용하여 각 genome 간의 유전적 변이와 유연관계를 분석하고자 수행되었다. 최근 백합속에서 개발된 19개의 EST-SSR 중에서 7개의 primer가 참나리 2, 3배체 종내 유전적 변이 분석에 적합한 것으로 나타났다. 서해안, 남해안 제주도의 원거리 지역에 분포하는 2배체 참나리들은 지역에 관계없이 다양한 유전적 변이를 나타내었으나, 소청도, 울릉도 및 내륙에 분포하는 3배체 참나리는 비교적 단순한 변이를 나타내었다. 다형성을 나타낸 총 121개의 SSR 밴드를 사용하여 UPGMA 방법으로 계 통도를 작성한 결과 2배체 집단에서는 유전적 변이가 다양한 반면 3배체 집단에서는 비교적 변이가 적은 것 으로 나타났다. 2배체 집단에서 아차도 계통들이 남해 안의 다른 2배체와 뚜렷이 구분되는 cluster를 형성하 였고, 3배체 집단에서는 소청도 참나리가 다른 지역과 는 구별되는 독특한 밴드패턴을 나타내었다. 본 연구에 서 선발된 EST-SSR마커들은 금후 참나리 2, 3배체 집단의 유연관계를 분석하는데 유용하게 사용될 수 있 을 것으로 생각된다.
Phylogenetic analysis was carried out among the 56 diploid and triploid accessions of Lilium lancifolium (L.) that were collected throughout the Korea using EST-SSRs. Of the 13 informative ESTSSRs, 7 primer sets were suitable for phylogenetic analysis of the diploid and triploid accessions. Diploid accessions collected from the islands in Yellow sea, South sea, and Jeju island showed high genetic variation regardless of the geographic distances, whereas the triploid accessions collected from Socheong island in Yellow sea, Ulreung island in East sea, and inland areas of Korean peninsula showed low genetic variation. The UPGMA phylogenetic tree with 121 polymorphic SSR bands revealed distinct clustering patterns from each other’s among the accession of the diploids from Acha-do (Yellow sea) and the diploids from islands of South sea, and the triploid accessions from Socheong island showed distinct grouping from others of Ulreung island and inland. Thus, the used EST-SSR markers can be utilized in the future for the analysis of demographic and identifying accessions among the diploid and triploid L. lancifolium accessions.