고라니의 식이물 분석에 있어 Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis(PCR-DGGE)의 이용 가능성 연구 A Study of Potential of Diet Analysis in the Korean Water Deer(Hydropotes inermis argyropus) using Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis(PCR-DGGE)
pp.318-324
이 연구의 목적은 고라니(Hydropotes inermis argyropus)의 위내용물을 대상으로 PCR-DGGE 방법을 이용하여 그 식이습성을 조사하는데 있다. 이 연구를 위해, 강원도 철원과 전라남도 동부지역 등에서 자연사 혹은 로드킬에 의해 죽은 고라니 사체의 위에서 식이물 샘플을 채취하였다. 총 44개체의 위내용물에서 각각 DNA를 추출하였고, 두 가지의 프라이머(rbcLZ1과 rbcL19bR)를 이용하여 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit(rbcL) gene을 PCR 증폭하였다. 44개의 샘플 중 29 샘플에서 성공적으로 PCR을 수행하였다. 이 29개 partial rbcL gene의 PCR product는 PCR-DGGE에 이용되었다. 식이물에 대한 분석결과 총 6과의 식물이 확인되었다. 강원도 철원의 경우, 5과가 나타난 반면, 전라남도 동부의 경우, 3과만이 확인되었다. 이 연구에서는 종수준의 먹이식물의 구별에는 실패하였 지만, 차후 이 PCR-DGGE 기법은 고라니를 포함한 초식동물의 식이습성을 분석하는데 하나의 가능성 있는 방법이 될 것으로 생각된다.
The aim of this study is to examine feeding habits of the Korean water deer(Hydropotes inermis argyropus) from its rumen contents using a PCR-DGGE method. For this study, rumen contents were collected from water deer causalities by natural death or road-kill in two different sites(Cheorwon, Gangwon province and the Eastern part of Jeonnam province). DNA was extracted from rumen contents of a total of 44 individuals. Two primers, rbcLZ1aF(GC) and rbcL19bR, were used for PCR amplifications of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene. Among 44 samples, twenty-nine samples were successfully amplified by PCRs. The 29 PCR products of partial rbcL gene were applied for PCR-DGGE. Totally, six families of plants were detected from the diet analyses. Five families of plants were found in Cheorwon, Gangwon province, but only three families of plants were found in the Eastern part of Jeonnam province. The PCR-DGGE method will provide us with a potential tool to study feeding habits of ungulates including water deer, even though our results failed to identify the prey plants at the level of species.