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Simple Sequence Repeat (SSR) 마커를 이용한 장미 품종 식별 KCI 등재

Identification of Rose (Rosa x hybrida) Varieties Using Simple Sequence Repeat (SSR) Markers

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/241295
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한국육종학회지 (Korea Journal of Breeding Science)
한국육종학회 (The Korean Breeding Society)
초록

본 연구는 국내외에서 육성 및 수집된 장미품종에 대하여 SSR 마커를 이용하여 품종식별 연구를 수행하였다. 장미 품종식별에 적합한 SSR 마커를 선정하기 위하여 112개의 SSR 마커를 12개의 주요품종을 대상으로 분석하였다. 최종 선발된 22개의 SSR 마커를 대상으로 69품종을 이용하여 분석하였을 때 대립유전자의 수는 2~10개의 분포를 나타내었으며 총 114개의 대립유전자가 분석되었다. PIC 값은 0.211~ 0.813의 범위에 속하였으며 평균값은 0.621로 나타났다. SSR 마커를 이용하여 작성된 장미 69품종의 품종간 유전적 거리는 0.41~0.87의 범위로 나타났고, 공시 품종 모두 SSR 마커의 유전자형에 의해 구분되었다. 본 연구결과는 장미 품종의 식별과 유전적 다양성 연구를 위한 기초 자료로 유용하게 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

The objective of this study was to evaluate the suitability of simple sequence repeat markers for variety identification in 69 rose (Rosa x hybrida) varieties. A set of 112 SSR primer pairs was evaluated and 43 primer pairs showed polymorphism in 12 varieties. Twenty-two primer pairs out of 43 primer pairs showed high levels of polymorphism and reproducibility. The genetic relationship of 69 varieties was analyzed based on the marker genotypes of 22 SSRs. A total of 114 polymorphic amplified fragments were obtained by using 22 SSR markers. Two to ten SSR alleles were detected for each locus with an average of 5.18 alleles per locus. Average polymorphism information content (PIC) was 0.621, ranging from 0.211 to 0.813. A total of 114 marker loci were used to calculate Jaccard’s distance coefficients for cluster analysis using unweighted pair-group method with arithmetical average (UPGMA). Cluster analysis of genetic diversity revealed that these SSR marker sets identified each genotypes of 69 rose varieties. These SSR markers may be used for wide range of practical application in variety identification of rose.

저자
  • 홍지화(농림수산식품부 국립종자원 재배시험과) | Jee-Hwa Hong Corresponding author
  • 권용삼(농림수산식품부 국립종자원 재배시험과) | Yong-Sham Kwon
  • 서정남(농림수산식품부 국립종자원 재배시험과) | Jung-Nam Suh
  • 최근진(농림수산식품부 국립종자원 재배시험과) | Keun-Jin Choi