Molecular genetic markers have been widely used as powerful tools for analyzing the genome. In particular, SSR markers have practical applications in breeding systems because they can be used in high-throughput analyses for genetic mapping, heritable diversity testing, purity analysis, and marker-assisted selection. Currently, due to technical advances in DNA sequencing, large sequence databases are available for large-scale SSR mining and marker development. Here, we describe an automated method, the SSR Finder program, for SSR discovery in the onion sequence database, and primer design for amplifying the detected SSRs. A total of 1,049 SSR primers were obtained for genetic purity testing, and 100 SSR sets were analyzed in 14 bulb onion breeding lines using clustering analysis. A total of 20 selected markers from screening of all 1,049 SSR primers, were finally applied for genetic purity testing in three breeding lines, NW1, NW9, and NW10. The initial tests showed that 15%, 71%, and 97% of individuals within NW1, NW9, and NW10, respectively, were genetically homogeneous. These markers produced using the SSR Finder will be useful for investigating the genetic purity of onion breeding lines.

유황 분석을 통해 산정된 갈수량, 저수량, 평수량, 풍수량은 수자원의 이용 및 관리에 있어서 매우 중요한 유량 지표이다. 하지만, 유황분석에 의해 유황에 따른 유량은 산정되어지고 있으나, 시설물 운영을 위한 유황에 따른 기간이 선정되어 있지 않기 때문에 실무자의 판단을 통해 유황 시기를 결정하여 보 및 댐의 운영이 이루어지고 있는 실정이다. 본 연구에서는 낙동강에 위치한 달성보 지점에 대하여 subtractive 기반 K-mean 클러스터링 기법과 클러스터 검증지수를 통해 실제 유황이 가지는 패턴을 분석하였다. 분석결과, 3개의 유황 패턴이 나타나고 있는 것으로 밝혀졌다. 이에 따라서, 각 유황 패턴이 나타나는 기간을 분석하여 유황 패턴별 시기를 결정하였다.

Rapid extension of genomic database leads to the remarkable advance of functional genomics. This study proposes a novel methodology of functional analysis using 5-methyltrytophan (5 MT) mutant together with their 2-DE analysis and public microarray database. A total of 24 proteins was changed in 5 MT mutant and four remarkably different expressed proteins were identified. Among them, three spots were converted to Affymetrix probe. A total of 155 microarray samples from Gene Expression Omnibus (GEO) in NCBI was retrieved and followed by constructing gene co-expression networks over a broad range of biological issues through Self-Organising Tree Algorithm. Three co-expressing gene clusters were retrieved and each functional categorization with differential expression pattern was exhibited from 5 MT resistance mutant rice. It was indicated new co-expression networks in the mutant. This study suggests that on investigating possibility which correspond 2-DE to microarray database with their full potential.

노후수도관 개량사업은 예산상, 시공상 등의 여러 제약조건에 의해서 장기적인 계획 하에 시행되게 된다. 본 연구에서는 연구대상지역에서 1992년부터 1997년 사이에 기록된 누수 위치좌표 약 8,000개를 이용하여 누수 위치들 간의 공간적 상관관계에 대한 계층적 군집분석을 수행한다. 계층적 군집분석방법 중 최단 연결법, 최장 연결법 및 평균 연결법을 적용하여 연구대상지역을 누수위치의 공간적 상관관계에 따라 분할하였으며, 각 군집 방법 별로 분할된 구역들을