KOREASCHOLAR

큰느타리버섯의 저온성적응성 형질에 관련된 SCARmarker를 개발하기 위하여 저온성 계통의 8균주와 대조구 8균주의 genomic DNA를 30ug/ml의 농도로bulking한 것을 주형 DNA로 사용하고 operon 사의OPA(20개), OPB(20개), OPL(20개), OPP(20개),OPR(20개), OPS(20개) 등 총 120개 primer를 randomprimer(10mer)로 사용하여 RAPD를 수행하였으며 이중에서 OP-S3 primer를 사용한 PCR 산물들이 대조구와 가장 뚜렷한 차이를 나타내었다. OP-S3 primer를이용한 RAPD 결과, 약 480 bp 부근에서 저온성 계통에 특이적인 DNA band가 관찰되었으며 이 DNAband의 염기서열을 근거로 SCAR marker로 사용할specific primer인 OP-S3-1-F와 OP-S3-1-R를 디자인하였다. SCAR marker OP-S3-1 primer를 이용하여 PCR을 수행한 결과에서는 저온성 계통에서만 480 bp 부근에서 대조구와 구별되는 DNA band를 확인할 수 있었으며 random primer인 OP-S3 primer를 이용하여 PCR을 수행했을 때보다 재현성이 높고 진한 DNA band를확인할 수 있었다.

Genomic DNAs of psychrophilic strains of Pleurotus eryngii were analyzed by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) using OP-A, OP-B, OP-L, OP-P, OP-R and OP-S3 primers to develop the strain-specific DNA marker. A unique DNA fragment with the size of 480 bp was yielded by OP-S3 primer from the psychrophilic strain. A sequence characterized amplified region (SCAR) marker, designated as OP-S3-1, was designed on the basis of the determined sequence. The PCR analysis with the OP-S3-1 primer showed that this SCAR marker can clearly distinguish the psychrophilic strains from the control strains.

ABSTRACT
 공시균주 및 저온적응성 계통 선발
 마커 탐색을 위한 RAPD
 저온성 계통에 특이적인 PCR 산물의 Cloning 및 염기서열 분석
 SCAR marker 디자인
 적요
 감사의 글
 참고문헌

• 김수철(경남과학기술대학교 제약공학과) | Su Chul Kim
• 황혜성( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 황혜성
• 조윤진( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 조윤진
• 김혜수( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 김혜수
• 류재산( 경상남도농업기술원 친환경연구과) | 류재산
• 조수정( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 조수정