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고추바이러스들의 동시 검출을 위한 새로운 즙액 추출 용액의 개발 KCI 등재

Development of a Novel Sap Extraction Buffer for Simultaneous Detection of Pepper Viruses using VC/RT-PCR

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/268964
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한국국제농업개발학회지 (The Journal of the Korean Society of International Agriculture)
한국국제농업개발학회 (The Korean Society Of International Agriculture)
초록

바이러스 입자를 감지하는 역전사 핵산 연쇄 증폭법 (VC/RT-PCR)은 감염된 식물종들로부터 핵산 추출 없이 식물바이러스들을 검출 할 수 있다. 본 연구는 VC/RT-PCR 분석법을이용하여 고추를 감염시키는 바이러스들을 효과적으로 진단하기 위하여 새로운 즙액 추출 완충액들이 제작하였다.토마토반점위조바이러스 (Tomato spotted wilt virus;TSWV), 고추약한모틀바이러스 (Pepper mild mottle virus;PMMoV) 및 고추모틀바이러스 (Pepper mottle virus;PepMoV) 진단을 위한 가장 최적화된 추출 완충액은 0.5%sodium sulfate를 포함하는 1.0M Tris (pH 8.0) buffer 였다.고추 바이러스들은 담배 즙액 추출 후 7일까지 검출이 되었으며, 마쇄 직후와 검출 감도는 유의한 차이가 없었다. 반면에,3가지 고추 바이러스들은 고추 즙액 추출 후 2일까지만 바이러스들이 검출되었으며, 검출 감도는 크게 감소하였다.국내 고추 재배 농가들에서 수집한 고추 시료들에서 TSWV,PMMoV, PepMoV의 단독 감염 및 PMMoV와 PepMoV의중복 감염을 선발된 최적 즙액 완충액과 VC/RT-PCR의 조합을 이용하여 동시 진단이 가능하였다.

Virion-captured reverse transcription polymerase chain reaction (VC/RT-PCR) is able todetect plant viruses without extraction of total nucleic acids from infected plant species. Novel extractionbuffers were developed and optimized for the efficient diagnosis of pepper-infecting viruses using VC/RT-PCR analysis. The most optimal extraction buffer to detect Tomato spotted wilt virus (TSWV), Peppermild mottle virus (PMMoV), and Pepper mottle virus (PepMoV) was 1M Tris (pH8.0) buffer containing0.5% sodium sulfate. The three viruses in the optimal buffer could be detected from tobacco (Nicotianarustica) until 7 post-extraction, showing no significant difference in detection sensitivity of viruses. Mean-while, the three pepper-infecting viruses in the optimized buffer could be detected from pepper plantsuntil 2 post-extraction, showing significant decrease in detection sensitivity. Single infection of TSWV,PMMoV, or PepMoV and mixed infection of PMMoV and PepMoV were simultaneously detected frompepper plants collected from domestic farms using the combination of the optimal buffer and VC/RT-PCR.

저자
  • 윤주연(서울여자대학교 원예생명조경학과) | Ju-Yeon Yoon
  • 최국선(농촌진흥청 국립원예특작과학원 원예특작환경과) | Gug-Seoun Choi
  • 조인숙(농촌진흥청 국립원예특작과학원 원예특작환경과) | In-Sook Cho
  • 최승국(농촌진흥청 국립원예특작과학원 원예특작환경과) | Seung-Kook Choi Corresponding author