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EST(Expressed Sequence Tags)를 이용한 느타리버섯의 성장단계별 유전발현 분석

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/277085
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한국버섯학회 (The Korean Society of Mushroom Science)
초록

느타리버섯은 시중의 재배기술이 발전하여 느타리와 큰느타리의 전체 생산 및 소비가 버섯전체생산의 약 50%를 차지하여 재배품종의 주류를 형성하고 있다. 하지만 UPOV 및 FTA 등의 문호개방에 따라 로열티 지불 등에 대응할 수 있는 품종육성이나 신기술 개발이 시급한 실정이다. 본 연구에서는 느타리버섯의 성장단계별 유전적 발현을 분석하기 위해 cDNA 라이브러리를 성장단계별 10단계로 구분하여 12,342 ESTs를 구축하였다. 기존에 등록된 29,211 EST와 함께 분석한 결과 contig 4,939로 40%를 보여주었다. 이것을 기능별로 분류하였을 때 생물학적 과정 (Biological process) 27%, 세포 요소 (Cellular component) 35%, 분자 기능 (Molecular function) 38%로 분포하였다. 생물학적 과정에서는 생리학적 과정과 세포 과정이 각각 50%와 46%, 세포 요소에서는 세포와 세포부분이 각각 35%, 분자 기능에서는 촉매활성과 결합력이 각각 44%와 40%를 차지하였다. 유전자군별로 다양한 발현 패턴을 보여주었으며 조직특이적 발현은 약 13%를 나타내었다.

저자
  • 신평균(농촌진흥청, 국립원예특작과학원)
  • 유영복( 농촌진흥청, 국립원예특작과학원) | 유영복
  • 공원식( 농촌진흥청, 국립원예특작과학원) | 공원식
  • 장갑열( 농촌진흥청, 국립원예특작과학원) | 장갑열
  • 오연이( 농촌진흥청, 국립원예특작과학원) | 오연이
  • 이승호( 농촌진흥청, 국립원예특작과학원 인삼특작부 인삼과) | 이승호
  • 이강효( 국립원예특작과학원 기획조정과) | 이강효
  • 김범기( 국립농업과학원 농업생명자원부 신작물개발과) | 김범기