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복숭아심식나방 유충의 전사체 분석에 의한 종 동정 marker 탐색

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/289541
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한국응용곤충학회 (Korean Society Of Applied Entomology)
초록

복숭아심식나방의 신속한 동정을 위한 간이진단킷트용 marker 개발을 위하여 유충의 전사체를 454 NGS를 통하여 분석하였다. 그 결과 총 237,000개의 서열을 확보하였으며, 약 160,000개의 서열이 복숭아심식나방 유충의 전사체 정보를 포함하였다. 이 전사체 정보는 약 3,000개의 contigs를 구성하였으며 singleton의 수는 17,000개로서, 이들을 genome 서열이 밝혀진 B. mori의 유전자와 BlastX로서 상동성유전자를 탐색하였을 때 68%, 44%의 서열들이 각각 B. mori, D. melanogaster의 유전자와 상동성을 나타내었다. 그 중 기능이 알려진 유전자의 수는 총 4500여개로서 중복을 고려하였을 때 약 2000개의 유전자에 대한 annotation이 가능하였다. 서열이 밝혀진 유전자의 64%가 B. mori의 유전자와 70% 이상의 상동성을 나타내었으며 60% 이하의 상동성을 나타내는 서열은 약 20%를 차지하였다. 이들 서열로부터 유충의 진단에 사용 가능할 것으로 예상되는 다수의 후보 단백질을 선정하였으며 이들의 서열 상동성을 비교하였다.

저자
  • 박두상(한국생명공학연구원 생명자원센터)
  • 김석원(한국생명공학연구원 생명자원센터)
  • 권용국(한국생명공학연구원 생명자원센터)
  • 최경희(농촌진흥청 국립원예특작과학원 사과시험장)
  • 오현우(산업바이오소재연구센터)