본 실험은 SSR marker를 이용하여 밀 자원의 근연관계 및 유전자연관지도 작성의 기초 자료가 되는 anchor marker를 탐색하고자 수행되었다. 실험재료는 금강밀 등 41개 국내육성 품종 및 계통과 Genaro81 등 외국품종 7개 등 총 48개 자원을 사용하였고, SSR marker는 밀의 21개 염색체에서 각각의 short arm에 존재하는 3개와 long arm에 존재하는 5개 SSR marker를 선발하여 총 168개의 SSR primer set을 구성하였다. 이 중 108개의 SSR marker에 대한 PCR 실험결과 92개에서 다형성을 보였으며, 국내외 밀 자원은 SSR marker에 따라 1~7개의 loci에서 유전자다형성을 보였다. 선발된 SSR marker들은 국내외 밀 자원의 분류 및 mapping 집단의 anchor marker로서 이용될 수 있을 것이다.