오이총채벌레(Thrips palmi Karny)는 동남아시아지역이 원산으로 국내 침입 외래해충이다. 주로 노지와 하우스에서 재배되는 박과(Cucurbitaceae)와 가지과(Solanaceae) 작물에 직접 섭식과 바이러스 매개에 의한 피해가 크다. 본 연구에서는 차세대염기서열분석기술(NGS)을 통해 오이총채벌레의 미토콘드리아 전장 게놈을 해독하였으며 염기서열 신규 조립(de novo assembly) 결과 전체 길이가 16,414bp인 원형의 유전체로 추정되었다. 미토콘드리아 게놈 전체에서 뉴클레오티드는 A와 T가 78.5%를 차지는 특징을 보였다. 동물의 미토콘드리아 게놈에서 일반적으로 발견되는 37개 유전자 영역에 대해 BLAST 검색을 한 결과 trnV는 탐색되지 않았다. 본 발표에서는 신규 조립된 오이총채벌레 미토콘드리아 게놈 유전체에 포함된 유전자의 종류와 배열 등에 대한 기초 통계자료를 정리하였다.