The identification of non-synonymous SNP in the Enoyl-CoA delta isomerase 2 (ECI2) gene and its Association with Meat Quality Traits in Berkshire pigs
본 연구는 돼지 농가의 생산성 향상 및 수익성 증대를 위한 분자 육종 기술에 적용할 유전자 마커를 개발하기 위해 수행 되었다. 분석 결과에 따르면, 돼지의 간 조직을 이용하여 RNA-Sequencing을 수행한 결과 ECI2 유전자의 SNP를 발견 하였고 발견된 SNP chr 7:g.2302809는 c.608로 608번째 C가 G로 변환되어 Threonine에서 Serine으로 아미노산이 치환되는 단일염기다형성임을 확인하였다. Berkshire 돼지 430으로 ECI2 유전자형과 육질 형질과의 연관성 분석 결과 도 체중, 적색도, 육즙 손실, 수분 함량 및 pH24hr에서 유의성을 확인할 수 있었다. 그중 GG 유전자형은 pH24hr에서 다른 유전자형에 비해 수치가 증가시키는 경향을 확인하였다. 성별에 따른 유전자형과 육질 형질과의 연관성은 거세돈에서 GG 유전자형이 육즙 손실의 감소와 pH24hr에서 유의성이 확인되었고, 암퇘지의 GG 유전자형도 수분함량이 증가되었다. 따라서 ECI2 유전자의 GG 유전자형을 가진 돼지가 육질이 더 좋은 것으로 판단된다. 이러한 결과를 바탕으로 ECI2의 GG 유전자형을 고정시킨다면 육질이 우수한 돼지고기 생산이 가능할 것이다. 또한 ECI2 유전자를 이용하여 품종개량 및 조기 선발 기술에 바이오마커로 활용한다면 농가의 경쟁력 강화 효과에 도움이 될 것으로 사료된다.
Meat quality has always been one of the most important factors that controls the choice of pork consumers and is of great interest in the pig industry. In this study, we identified a single nucleotide polymorphism (SNP) in the enoyl-CoA delta isomerase 2 (ECI2) gene in Berkshire pigs (n = 430) by analyzed the association between the SNP and meat quality traits. The non-synonymous SNP in the ECI2 gene is located at c.608 C > G and resulted in an amino acid change from threonine to serine. Significant associations between the SNP and meat quality traits, such as redness (CIE a), and the pH24hr, were revealed in both the dominant and co-dominant models, whereas carcass weight, drip loss, and fat content and moisture content were significantly associated only with the dominant model. In barrow, the SNP was significantly associated with CIE a, drip loss, and pH24hr, whereas in gilt, only a significant relationship with moisture content was observed. GG genotype pigs had a higher pH24hr and lower drip loss. Because pH24hr and drip loss are considered the most important meat quality traits, GG genotype pork is high-quality meat compared to that from other genotypes. In conclusion, the SNP in the ECI2 gene is significantly associated with several meat quality traits. These traits and could be as genetic markers in molecular breeding programs for improving meat quality.