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이매패류 (Sinonovacula constricta) 먹이원 NGS 분석 적용에 대한 연구 KCI 등재

Application of NGS Analysis for the Food Source of Bivalve.

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/410184
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생태와 환경 (Korean Journal of Ecology and Environment)
초록

본 연구에서는 가리맛조개 (S. constricta)의 토사물을 현미경 검경과 차세대염기서열분석 (NGS) 기법으로 먹이원을 확인하고, 이를 통해 형태학적 및 분자학적 방법에 따른 먹이원 분석을 비교하였다. 가리맛조개 (S. constricta)의 먹이원은 분석방법에 따라 차이를 보였다. 먹이원생물은 위 내에서 분해되어 현미경 분석을 통한 생활사 확인과 정량적 분석이 가능하였으나 형태학적 및 해부학적 특성 파악이 불완전하였다. NGS 분석은 유기물 형태로 잔존하는 생물의 DNA 확인이 가능하여 현미경 검경 결과와의 상호보완적 적용 가능성을 확인하였다.

In this study, we analyzed the food components in the release product that sampled Sinonovacula constricta from the foreshore littoral at Byeongnyang-myeon, Suncheon Bay. We used microscopy and nextgeneration sequencing (NGS) to evaluate the applicability of morphological and molecular methods to analyze release products. The higher species diversity observed in the NGS method is due to the different levels of species identification, as microscopy displays morphological and anatomical levels of plankton species identification in S. constrita. Moreover, NGS can identify the level of species in the organic matter by using the 18s_V9 primer.

목차
Abstract
서 론
재료 및 방법
    1. 생물 시료 채집 및 먹이원생물 형태학적 동정
    2. NGS 분석
결 과
    1. 현미경을 이용한 가리맛조개 먹이원 분석
    2. NGS 기법을 이용한 가리맛조개 먹이원 분석
    3. 형태학적 동정과 NGS 기법을 이용한 먹이원 결과 비교
고 찰
적 요
REFERENCES
저자
  • 허유지(순천대학교 환경교육과) | Yu-Ji Heo (Department of Environmental Education, Sunchon National University)
  • 조현빈(부산대학교 환경·에너지연구소/부산대학교 생명과학과) | Hyunbin Jo (Institute for Environment and Energy, Pusan National University/Department of Integrated Biological Science, Pusan National University)
  • 정은송(부산대학교 생명과학과) | Eunsong Jung (Department of Integrated Biological Science, Pusan National University)
  • 김현우(순천대학교 환경교육과) | Hyun-Woo Kim (Department of Environmental Education, Sunchon National University) Corresponding author