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Characterization of Haemaphysalis longicornis microbiome collected from different regions of Korean Peninsula

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/433505
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한국응용곤충학회 (Korean Society Of Applied Entomology)
초록

Haemaphysalis longicornis는 사람과 동물에게 여러 심각한 병원체를 전달하는 주요 매개체로, 한반도에 널리 분포하고 있다. H. longicornis는 Rickettsia spp., Borrelia spp., Francisella spp., Coxiella spp., 그리고 중증열성혈소판 감소증후군 바이러스 (SFTS virus) 등을 매개하는 것으로 알려져 있다. 국내에 서식하는 H. longicornis의 미생물 군집과 관련된 연구는 많이 진행되지 않은 것으로 확인되었다. 이 연구는 한반도 내 다양한 지역에서 채집된 H. longicornis의 미생물군집 다양성을 지역별, 성장 단계 및 성별에 따라 분석하였다. 2019년 6월부터 7월까지 질병관리청 권역별기후변화매개체감시거점센터 16개 지역에서 채집한 H. longicornis의 16S rRNA 유전자 V3-V4 영역을 PCR로 증폭 후 Illumina MiSeq 플랫폼으로 시퀀싱하였다. Qiime2를 활용한 미생물 다양성 분석을 통해 총 46개의 샘플에서 1,754,418개의 non-chimeric reads를 얻었으며, 평균 126개 의 operating taxonmic unit (OTU) 을 식별하여 총 1,398개의 OTU를 확인하였다. 대부분의 지역에서 Coxiella spp.가 우점종으로 나타났으며, 특히 Coxiella endosymbiont는 가장 높은 우점도를 보이며, Coxiella burnetii와 계통 발생 학적으로 유사한 것으로 확인되었다. 이 연구를 통해 분석된 결과는 각 지역의 H. longicornis 미생물군집 데이터 베이스 구축에 활용되었으며, 이를 통해 지역별 미생물군집의 특이성을 식별할 수 있게 하였다. 이는 한반도의 H. longicornis에 의한 질병 전파 연구와 이를 통한 공중보건 개선에 기여할 것으로 기대된다.

저자
  • Min Kyu Sang(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)
  • Jie eun Park(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)
  • Dae Kwon Song(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)
  • Jun Yang Jeong(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)
  • Hee Ju Hwang( Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)
  • Hyun woo Kim(Division of Vectors and Parasitic Disease, Korea Disease Control and Prevention Agency, Osong Health Technology Administration Complex)
  • Tae Yun Kim(Division of Vectors and Parasitic Disease, Korea Disease Control and Prevention Agency, Osong Health Technology Administration Complex)
  • So Young Park(Performance Management Division, Strategic Planning Department, Nakdonggang National Institute of Biological Resources)
  • Se Won Kang(Biological Resource Center (BRC), Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB))
  • Bharat Bhusan Patnaik(P.G. Department of Bioscience and Biotechnology, Fakir Mohan University, Vyasa Vihar, Balasore, Odisha, India)
  • Sung-Jae Cha(Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Department of Molecular Microbiology and Immunology and Malaria)
  • Yeon Soo Han(College of Agriculture and Life Science, Chonnam National University)
  • Hee Il Lee(Division of Vectors and Parasitic Disease, Korea Disease Control and Prevention Agency, Osong Health Technology Administration Complex)
  • Yong Seok Lee(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute (KNAR), Soonchunhyang University)