논문 상세보기

Comparison of microbial communities of Vespa mandarinia according to sequencing platforms (Illumina MiSeq and PacBio HiFi)

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/433506
모든 회원에게 무료로 제공됩니다.
한국응용곤충학회 (Korean Society Of Applied Entomology)
초록

장내 미생물 군집은 소화 과정, 면역 시스템, 질병 발생 등 숙주의 다양한 면에 광범위한 영향을 주는 것으로 알려져 있으며, 주요 장내 미생물 종은 숙주의 생리 기능에 핵심적인 역할을 수행한다고 발표된 바 있다. 곤충의 장내 미생물 군집에 관한 연구가 최근 활발히 이루어지고 있으며, 이들 연구는 주로 장내 미생물 군집과 기생충, 병원체 간의 상호작용, 종간의 신호 전달 네트워크, 먹이의 소화 과정 등을 중심으로 이루어지고 있다. 이러한 연구들은 대부분 Illumina MiSeq을 활용하여 16S rRNA 유전자의 V1부터 V9 영역 중 선택된 특정 부분을 대상으로 짧은 서열 정보를 대상으로 진행되었다. 그러나, 최근에는 PacBio HiFi 기술이 상용화되면서 16S rRNA의 전장 분석이 가능할 수 있게 되었다. 이번 연구는 장수말벌(Vespa mandarinia)의 해부를 통해 gut과 carcass 부분을 분리한 뒤, 각 샘플을 Illumina MiSeq과 PacBio HiFi 기술을 활용하여 미생물 군집 간의 차이점을 확인하기 위하여 수행되었다.

저자
  • Min Kyu Sang(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
  • Jie eun Park(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
  • Dae Kwon Song(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
  • Jun Yang Jeong(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Chan-Eui Hong(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Yong Tae Kim(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Ziwei Liu(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Hyeonjun Shin(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Heon Cheon Jeong(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
  • Yong Hun Jo(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)
  • Yeon Soo Han(College of Agriculture and Life Science, Chonnam National University)
  • Moon Bo Choi(Department of Plant Protection and Quarantine, Kyungpook National University)
  • Yong Seok Lee(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources, Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University)