수염풍뎅이(Polyphylla laticollis manchurica)는 과거에는 흔히 발견되었으나, 1970년대 이후 한반도 내 개체수 가 급격히 감소하여 2005년 환경부에 의해 멸종위기 야생생물 Ⅰ급으로 지정되었다. 또한 해당종의 분자생물학적 연구는 멸종위기종이라는 특성으로 인해 제한적으로 진행되었다. 그로 인해 NCBI 등 공공 데이터베이스에서 제공되는 서열정보들 또한 부족한 실정이다. 이 연구는 이러한 한계를 극복하고 수염풍뎅이의 유전적 특성을 규명하기 위해 생물정보학적 기술을 활용하여 전사체 분석을 진행하였다. Illumina HiSeq 2500 플랫폼을 사용하여 53,433,048개의 RNA reads를 얻었으며, Trinity와 TGICL을 이용한 De novo 어셈블리 분석을 통해 18,172개의 unigenes를 생성하였다. 생성된 unigenes는 GO, KOG, KEGG, PANM DB를 활용하여 annotation을 진행하였다. 그 결과, GO 분석에서는 ‘binding and catalytic activities’와 관련된 항목이 높은 발현을 보였으며, KOG 분석의 경우 ‘Cellular Processes and Signals’ 범주가 높은 비율을 나타내었다. KEGG 분석을 통해 2,118개의 unigenes가 metabolic 카테고리에 annotation된 것을 확인하였다. SSR 모티프 분석에서는 AT/AT (42.90%) 모티프, AAT/ATT (13.13%) 모티프 순으로 많이 나타나는 것을 확인하였다. 이 연구를 통해 분석한 결과 들을 이용하여 유전자원 및 종 정보를 실시간 제공 및 정보 공유가 가능하도록 Database 및 web-interface를 구축하 였으며, 이러한 자료들은 국내 멸종위기종인 수염풍뎅이의 고유한 유전적 특성을 발굴 및 확보할 수 있는 기반자 료로써 활용될 수 있을 것으로 사료된다.

• Jun Yang Jeong(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
• Chan-Eui Hong(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
• Yong Tae Kim(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
• Ziwei Liu(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
• Hyeonjun Shin(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute)
• Lee Hyeok(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea)
• Min Kyu Sang(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Jie eun Park(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Dae Kwon Song(Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Hongray Howrelia Patnaik(Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Bharat Bhusan Patnaik(Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Heon Cheon Jeong(Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)
• Yong Seok Lee(Department of Biology, College of Natural Sciences, Soonchunhyang University, Korea, Korea Native Animal Resources Utilization Convergence Research Institute, Research Support Center(Core-Facility) for Bio-Bigdata Analysis and Utilization of Biological Resources)