Evaluation of Direct Multiplex Real-Time PCR Using FS Finder SL for Detection of Salmonella spp. in Ready-To-Eat Foods
Salmonella spp.는 식중독의 주요 원인균으로, 신속하고 정확한 검출 방법이 요구된다. 본 연구에서는 간소화된 direct multiplex real-time PCR 방법인 FS Finder SL키트 의 분석법 활용 가능성을 평가하고, 평판배지법과의 검출 성능을 비교하였다. 또한, real-time PCR의 검출 효율을 평 가하기 위해 FS Finder SL 키트에서 제공하는 세 가지 전 처리 방법(Method 1, 2, 3)을 비교 분석하였다. 실험 결과, 세 가지 전처리 방법을 이용한 direct multiplex real-time PCR 방법은 Salmonella spp.를 100% 검출할 수 있었으며, Ct 값 비교를 통한 통계적 분석에서도 세 방법 간 유의한 차이가 없는 것으로 나타났다(P>0.05). 반면, 선택 배지를 이용한 검출에서는 2 log CFU/g 이상으로 접종된 샘플에 서만 Salmonella spp.가 검출되었으나 real-time PCR법의 경우 0-3 log CFU/g 범위의 샘플에서 모두 검출이 가능 하였다. 또한, 실험에 사용된 세 가지 즉석섭취식품군(알 가공품, 닭가슴살 제품, 편의점 도시락)에서 자연균총의 영 향을 평가한 결과, 도시락 샘플의 일반세균수가 3.56±0.18 log CFU/g으로 가장 높았으며, 알가공품과 닭가슴살 제품 에서는 검출되지 않았다. 결론적으로 FS Finder SL 키트 를 활용한 real-time PCR 방법은 기존의 평판배지법보다 높은 검출 감도를 보였으며, 검출까지의 소요 시간을 대 폭 단축할 수 있었다. 특히, 복합적인 식품 매트릭스에서 도 신속하고 정밀한 검출이 가능함을 확인하였다. 본 연 구는 즉석섭취식품 중 Salmonella spp. 검출을 위한 효율 적인 direct multiplex real-time PCR 분석법의 적용 가능 성을 제시하며, 향후 식품안전 관리 시스템에서 활용될 수 있는 기초 자료를 제공한다.
Salmonella spp. is one of the predominant food- and water-borne pathogens associated with acute gastrointestinal diseases around the worldwide. Conventional cultural detection methods for Salmonella spp. are based on cultures using selective media and characterization of suspicious colonies by biochemical and serological tests, which are generally time-consuming and labor-intensive. This study evaluated the efficacy of real-time polymerase chain reaction (PCR) using FS Finder SL, which is a Salmonella spp. gene detection kit developed by Shimadzu. Three pre-treatment methods (Methods 1, 2, and 3) which were provided by the manufacturers were compared to evaluate the detection efficiency using real-time PCR. As a result, all methods were able to detected Salmonella spp. at 100%, and no statistical differences in cycle threshold (Ct) values were found among the three methods (P>0.05). In addition, real-time PCR method using the FS Finder SL showed more sensitive detection performance than the conventional cultureal method using xylose lysine deoxycholate agar (XLD) for the detection of Salmonella spp. in various foods (processed eggs, chicken breast products, and convenience store lunch boxes). In addition, there were reliable detection levels shown at low concentrations (0-3 log CFU/g). In conclusion, the real-time PCR method using the FS Finder SL kit showed higher detection sensitivity and more rapid detection than the conventional culture method, even in complex food matrices.