자가사리 정자는 체외수정을 하는 일반적인 수중형의 형태를 하고 있으나 미토콘드리아의 많은 수, 핵 돌기 및 두 개의 편모를 가지는 구조적 차이를 보여주었다. 핵의 기부에는 두 개의 깊이 함입된 핵와에 각각 말단부중심립을 포함하고 두 개의 중심립은 축사를 형성할 기저체로서의 기능을 하며 서로 평행하게 배열되어 있었다. 부수체는 중심립에서부터 핵막 사이의 공간에 있으며 이들 사이의 공간적 관계를 안정화시키는 역할을 하는 것으로 여겨진다. 미토콘드리아는 중편세포질에서 2층 또는 3층으로 배열되어 있으며 그 수는 40개 정도가 있었다. 정자는 두 개의 편모를 가지며 각 편모에 2개씩 즉 4개의 axonemal fins가 나있고 이들은 축사의 이중미세소관 3번과 8번 양쪽의 원형질막이 돌출되어 나타났다. 세포질관을 덮고있는 외벽은 원형질막과 소포체 수조로 구성 되며 이들 사이에 수많은 결합구조가 발달되어 있었다. 이와같이 자가사리의 정자는 구형의 핵, 깊은 핵와, 미토콘드리아의 배열 및 편모의 구성에 있어서 메기과와 동자개과의 정자와 유사하나 이들 두 과와는 핵 돌기, 핵와, 축사 및 axonemal fins의 수에 있어서는 차이를 보여주었다. 정자의 중편과 꼬리의 구성에서 메기목 4과 중 퉁가리과와 동자개과의 계통적 유연관계가 가장 밀접한 것으로 나타났다.