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SSR 분자마커를 이용한 튀김옥수수 자식계통 집단의 구조 및 association 분석 KCI 등재

Analysis of Population Structure and Association Mapping among Popcorn Inbred Lines using SSR markers

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/242801
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한국육종학회지 (Korea Journal of Breeding Science)
한국육종학회 (The Korean Breeding Society)
초록

본 연구는 강원도 농업기술원 옥수수연구소에서 튀김옥 수수 품종개발을 위하여 육성한 79개의 자식계통들에 대하 여 대표적인 분자마커인 SSR마커를 이용하여 집단구조 및 association mapping 분석을 실시하였다. 집단구조에 대한 분 석 결과에서 79개의 튀김옥수수 자식계통들은 groups I, II, III, IV, admixed group으로 구분되었다. 4개의 옥수수 자식 계통은 group I에 포함되었고, Group II는 총 17개의 자식계 통들이 포함되었다. 그리고 6개의 자식계통들은 Group III에 포함되었으며, 22개의 자식계통들은 Group IV에 포함되었 다. 그리고 admixed group에는 30개 옥수수 자식계통들이 포함되었다. 튀김옥수수 자식계통들에 대하여 50개 SSR 마 커와 10개의 양적 형질 사이에서 association mapping 분석 을 하였다. Q GLM 분석에서는 0.01의 유의수준에서 92개의 marker-trait association을 확인하였으며, 반면에 Q+K MLM 분석에서는 0.01의 유의수준에서 6개의 marker-trait association 을 확인되었다. 본 연구에서 79개의 튀김옥수수 자식계통들 에 대한 집단구조 및 association mapping 분석의 결과는 앞 으로 강원도농업기술원 옥수수연구소에서 튀김옥수수 품종개 발을 위한 계통 육성 및 교배조합 구성 등에 유용한 정보를 제공할 것으로 기대한다.

In this study, genetic diversity and population structure among 79 popcorn inbred lines were investigated using 10 morphological traits and 50 simple sequence repeat (SSR) markers. From population structure analysis, the 79 maize inbred lines were divided into five groups: I, II, III, IV, and admixed. Among them, 4 inbred lines were assigned to group I, 17 inbred lines were assigned to group II, and 6 and 22 inbred lines were respectively assigned to groups III and IV. The rest 30 inbred lines were contained in the admixed group. Association mapping analysis for popcorn inbred lines was performed to assess the marker-trait associations between the 50 SSR markers and the 10 morphological traits. At a significance level of 0.01, we found 92 marker-trait associations using the Q GLM model. While, using the Q+K MLM model, we found 6 marker-trait associations at a significance level of 0.01. Finally, this study's assessment of population structure and association mapping of 79 popcorn inbred lines will be helpful useful for popcorn breeding programs such activities as planning crosses for hybrid and line development at Maize Experiment Station, Gangwon Agricultural Research and Extension Services.

저자
  • 장진선(강원도 농업기술원) | Jin-Sun Jang
  • 장은하(강원도 농업기술원) | Eun-Ha Chang
  • 사규진(강원대학교 농업생명과학대학 식물자원응용공학과) | Kyu Jin Sa
  • 김병완(강원대학교 농업생명과학대학 식물자원응용공학과) | Byeong Wan Kim
  • 김종화(강원대학교 농업생명과학대학 원예학과, 강원대학교 한방바이오연구소) | Jong-Hwa Kim
  • 이주경(강원대학교 농업생명과학대학 식물자원응용공학과) | Ju Kyong Lee Corresponding author