논문 상세보기

큰느타리버섯의 저온적응성 형질에 관련된 SCAR Marker 개발 KCI 등재

Development of a psychrophilic-SCAR marker for Pleurotus eryngii

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/276509
구독 기관 인증 시 무료 이용이 가능합니다. 4,000원
한국버섯학회지 (Journal of Mushrooms (J. Mushrooms))
한국버섯학회 (The Korean Society of Mushroom Science)
초록

큰느타리버섯의 저온성적응성 형질에 관련된 SCARmarker를 개발하기 위하여 저온성 계통의 8균주와 대조구 8균주의 genomic DNA를 30ug/ml의 농도로bulking한 것을 주형 DNA로 사용하고 operon 사의OPA(20개), OPB(20개), OPL(20개), OPP(20개),OPR(20개), OPS(20개) 등 총 120개 primer를 randomprimer(10mer)로 사용하여 RAPD를 수행하였으며 이중에서 OP-S3 primer를 사용한 PCR 산물들이 대조구와 가장 뚜렷한 차이를 나타내었다. OP-S3 primer를이용한 RAPD 결과, 약 480 bp 부근에서 저온성 계통에 특이적인 DNA band가 관찰되었으며 이 DNAband의 염기서열을 근거로 SCAR marker로 사용할specific primer인 OP-S3-1-F와 OP-S3-1-R를 디자인하였다. SCAR marker OP-S3-1 primer를 이용하여 PCR을 수행한 결과에서는 저온성 계통에서만 480 bp 부근에서 대조구와 구별되는 DNA band를 확인할 수 있었으며 random primer인 OP-S3 primer를 이용하여 PCR을 수행했을 때보다 재현성이 높고 진한 DNA band를확인할 수 있었다.

Genomic DNAs of psychrophilic strains of Pleurotus eryngii were analyzed by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) using OP-A, OP-B, OP-L, OP-P, OP-R and OP-S3 primers to develop the strain-specific DNA marker. A unique DNA fragment with the size of 480 bp was yielded by OP-S3 primer from the psychrophilic strain. A sequence characterized amplified region (SCAR) marker, designated as OP-S3-1, was designed on the basis of the determined sequence. The PCR analysis with the OP-S3-1 primer showed that this SCAR marker can clearly distinguish the psychrophilic strains from the control strains.

목차
ABSTRACT
 공시균주 및 저온적응성 계통 선발
 마커 탐색을 위한 RAPD
 저온성 계통에 특이적인 PCR 산물의 Cloning 및 염기서열 분석
 SCAR marker 디자인
 적요
 감사의 글
 참고문헌
저자
  • 김수철(경남과학기술대학교 제약공학과) | Su Chul Kim
  • 황혜성( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 황혜성
  • 조윤진( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 조윤진
  • 김혜수( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 김혜수
  • 류재산( 경상남도농업기술원 친환경연구과) | 류재산
  • 조수정( 경남과학기술대학교 제약공학과) | 조수정