김정문 알로에 제주농·공장에서는 알로에 베라와 알로에 아보레센스를 중심으로 450여종의 알로에가 보존되어 져 오고 있으며, 알로에 종 일부는 전시용으로도 활용되고 있다. 전세계 500여종의 알로에가 알려져 있는 가운데 제주농·공장의 알로에 보존 현황은 원산지가 아님에도 불구하고 많은 종수를 보유하고 있으며 보존 또한 잘 이루 어지고 있다. 또한 변종 및 아종과 더불어 교잡종 등의 분류가 제대로 이루어진다면 분류군은 증가하리라 예상된 다. 따라서 제주농·공장에 보존되고 있는 다양한 알로에 종을 김정문 알로에의 경제적 자원으로서 활용하기 위해 서 이들의 유연관계를 분자생물학 기술을 활용하여 분석하고 품종 구분에 대한 기술을 확보하는 것이 필요하다. 이에 따라 김정문 알로에 제주농·공장에 보존되어 있는 품종 중 경제성이 있을 것으로 판단되는 35종의 품종을 대 상으로 하여 Operon 사의 OPF 프라이머 5종, OPD 프라이머 15종을 사용하여 RAPD 분석을 수행하였다. 이를 통해 품종별 유연관계를 분석하였고, 10개의 그룹으로 알로에가 분류될 수 있음을 확인하였다. 이와 같은 연구를 통해 품종판별용 RAPD 마커 제작도 가능할 것으로 기대된다.