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Development of a High-Resolution Melting Marker for Selection of Pollination- Constant Non-Astringency in Persimmon (Diospyros kaki Thunb.) Breeding KCI 등재
감(Diospyros kaki Thunb.) 품종 육종에서 단감 선발용 High-Resolution Melting 분자표지 개발
- 언어ENG
- URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/400067
pp.213-217
최근에 감에서 떫은맛을 조절하는 AST에 연관된 지역에서 분자 표지들이 개발되었다. 이중에서 sequence characterized amplified region (SCAR) marker는 5R region에 인접한 지역에서 개발되었다. 하지만 이 SCAR마커는 분석 방법이 다소 복잡하고 해석이 어려워 많은 교배실생을 분석할 경우에는 적합하지 않다. 우리는 5R 지역의 sequences에 기반하여 high-resolution melting (HRM)-based 분자 표지를 개발하였다. 개발된 HRM preimer set을 8개 품종의 단감 및 떫은감에 대해 적용한 결과 단감 품종에서는 직선을 나타낸 반면 떫은감 품종에서는 다양한 크기의 곡선으로 나타나서 차이를 확인할 수 있었다. 결과적으로 이번 연구에서 개발된 HRM primer set은 분자 표지를 활용한 감 품종 육성 연구에 매우 효율적으 로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
A number of molecular markers linked to the AST locus that controls fruit astringency type in persimmon have been developed recently, among which, sequence characterized amplified region (SCAR) markers have been developed in the genomic region adjacent to the 5R region. However, these SCAR markers are difficult to use when analyzing large numbers of seedlings. Here, we developed new high-resolution melting (HRM)-based marker set that were forward and reverse primers Hrm1-F and Hrm1-R respectively designed based on sequences in the 5R region. When this primer set was applied by HRM analysis to distinguish eight pollination constant non-astringent (PCNA) and non-PCNA cultivars respectively, the results revealed that the PCNA cultivars showed a straight line, whereas the non-PCNA cultivars showed various-sized peaks within the temperature range of 68 to 72ºC. Consequentially, this HRM primer set is considered the most practical tool for marker-assisted selection in persimmon breeding.
INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
Plant materials
Direct Sequencing
Sequence alignment and HRM analysis
RESULT AND DISCUSSION
CONCLUSION
적 요
REFERENCES
