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메타지놈 분석에 의한 두릅나무에서의 곰팡이 다양성 조사 KCI 등재

Investigation of Fungal Diversity on Aralia elata (Miq.) Seem. Based on Metagenomics

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/429150
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농업생명과학연구 (Journal of Agriculture & Life Science)
경상대학교 농업생명과학연구원 (Institute of Agriculture & Life Science, Gyeongsang National University)
초록

현재 주요 수목병해 방제는 육안조사 등을 기반으로 한 현장조사를 통해 실시 되고 있으나, 목적 달성에 있어 그 효율성 높지 않다. 수목병의 예찰 방법을 고도화하고 적기방제를 통해 그 피해를 저감시키기 위해, 본 연구는 메타지놈 분석을 이용하여 두릅나무에서의 곰팡이 다양성을 조사하였다. 속(Genus) 수준에서 메타지놈 분석결과 총 20개의 곰팡이 상이 해당 재배지 내 두릅나무에 분포하는 것으로 확인되었다. 그 중, Alternaria속과 Puccinia속이 우점하는 것으로 조사되었으며, 이는 두릅나무 재배지 내 전체에서 개체별로 일관되게 나타났으며, 특히 해당 재배지 내 두릅나무 녹병이 우점적으로 발생함이 확인되었다. 이러한 결과를 바탕으로 두릅나무에서의 주요 곰팡이 다양성에 대한 스크리닝과 함께 주요 또는 잠재적 수목병원균류를 대상으로 메타지놈 기법으로 확인할 수 있음을 본 연구결과를 통해 확인되었다.

Due to the inefficiency, there has been demand for advanced monitoring and control strategies for tree disease caused by pathogen, which have traditionally relied on visual inspection or field investigation. To reduce the economic losses caused by pathogens and improve the monitoring and control management for tree disease, fungal diversity on tree, with a particular focus on pathogens affecting Aralia elata, was investigated using metagenomic assessment. Based on the results retrieved from metagenomic analysis, two groups of fungal pathogens, including the genus Alternaria and Puccinia, which are the causal agents of leaf spot and rust disease, respectively, were consistently shown to be dominant on A. elata. In addition, the severe occurrence of rust disease on A. elata caused by Puccinia sp. was observed in the nursery. Based on these results, it was confirmed through this research that the major fungal pathogens within A. elata trees can be identified using metagenomic techniques, along with screening for key or potential tree pathogens.

목차
서론
재료 및 방법
    1. 조사 지점 및 시료 채취
    2. 핵산 추출 및 유전자 증폭
    3. 메타지놈 분석
결과 및 고찰
감사의 글
References
저자
  • 김철우(국립산림과학원 산림생명자원연구부 산림특용자원연구과, 임업연구사) | Chul Woo Kim (Senior Researcher, Division of Special Forest Resources, National Institute of Forest Science, Suwon, 16631, Korea)
  • 서상태(국립산림과학원 산림환경보전연구부 산림병해충연구과, 임업연구관) | Sang Tae Seo (Senior Researcher, Division of Forest Insect Pests and Diseases, National Institute of Forest Science, Seoul, 02455, Korea)
  • 신금철(경상국립대학교 환경산림과학부 산림환경자원학과, 조교수) | Keum Chul Shin (Assistant Professor, Department of Forest Environmental Resources, Gyeongsang National University, Jinju 52828, Korea)
  • 이동현(충남대학교 농업생명과학대학 산림환경자원학과 조교수) | Dong Hyeon Lee (Assistant Professor, Department of Environment and Forest Resources, Chungnam National University, 99 Daehak-ro, Daejeon 34134, Korea) Corresponding author