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식품에서 분리된 살모넬라(Salmonella enterica Enteritidis MFDS1022168)의 유전체 서열 분석 KCI 등재

Complete Genome Sequence of Salmonella enterica Enteritidis MFDS1022168 Isolated from Food

  • 언어ENG
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/438515
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한국식품위생안전성학회지 (Journal of Food Hygiene and Safety)
한국식품위생안전성학회 (Korean Society of Food Hygiene and Safety)
초록

Salmonella enterica는 세계적으로 가장 널리 알려진 식 중독균이다. Salmonella enterica Enteritidis MFDS1022168 은 인천보건환경연구원에서 계란에서 분리된 균주로, 이 균 주가 지니고 있는 병원성에 대한 genome 수준의 메커니즘을 이해하기 위하여 whole genome sequencing을 진행 하여 유전체를 분석하였다. PacBio Sequel 장비를 이용하 여 유전체염기서열 분석을 진행한 결과 invA를 비롯한 여 러 종류의 병원성유전자를 갖고 있는 것으로 확인됐다. 이 에 따라 해당 균주의 독성을 파악하기 위해 유전체분석을 진행하였다. 유전자 총 수 예측 결과, 4,776개의 CDSs, 84 개의 tRNA, 22개의 rRNA를 보유한 것으로 나타났다.

Salmonella enterica is an infectious foodborne pathogen causing major public health problems worldwide. We present here the complete genome sequence of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis isolate MFDS1022168, that was isolated from a gimbap in Gyeonggi-do, South Korea, in 2022. The complete genome sequence of MFDS1022168 consists of a circular chromosome of 4,771,958 bp with a G + C content of 52.0%, and a plasmid of 59,372 bp with a G + C content of 51.9%. The chromosome is characterized by the presence of Salmonella pathogenicity islands containing virulence factor-encoding genes such as invA. Gene prediction analysis showed that the chromosome possesses 4,776 coding sequence (CDS) as well as 84 tRNA and 22 rRNA genes.

목차
ABSTRACT
Body
Nucleotide sequence accession number(s)
Acknowledgements
국문요약
Conflict of interests
ORCID
References
저자
  • 김예은(식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) | Yeeun Kim (Food Microbiology Division, Ministry of Food and Drug Safety, Cheongju, Korea)
  • 이우정(식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) | Woojung Lee (Food Microbiology Division, Ministry of Food and Drug Safety, Cheongju, Korea)
  • 안은숙(식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) | Eun Sook An (Food Microbiology Division, Ministry of Food and Drug Safety, Cheongju, Korea)
  • 김승환(식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) | Seung Hwan Kim (Food Microbiology Division, Ministry of Food and Drug Safety, Cheongju, Korea)
  • 주인선(식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) | Insun Joo (Food Microbiology Division, Ministry of Food and Drug Safety, Cheongju, Korea) Corresponding author