열대거세미나방의 저온 내성에 관여하는 분자적 기작을 규명하기 위하여, 4°C 저온 처리 후 뇌 조직을 대상으로 전사체 분석을 수행하였 다. 그 결과 총 266,051개의 유니진(unigene)이 확보되었으며, 저온 처리군에서 6,917개의 유전자가 차등발현을 보였다. 저온 반응에서는 상향 조절 유전자보다 하향 조절 유전자가 전반적으로 더 많이 나타났다. 차등발현 유전자 중에서는 저온 스트레스 반응과 관련있는 단백질 안정화, 세포막 안정성, 및 에너지 대사 관련 유전자들이 다수 확인되었다. 특히 Hsp와 PGPEP1은 50배 이상 상향 조절되었고, RN7SK는 저온 처리군에 서 175배 수준으로 현저히 하향 조절되었다. 주요 차등발현 유전자에 대한 정량적 RT-PCR 분석 결과, RNA-Seq 분석과 일치하는 발현 경향이 확인되었다. 본 연구는 열대거세미나방의 저온 적응에 대한 분자생리학적 이해를 확장하며, 저온 저항성 및 환경 적응 연구를 위한 후보 분자마커 를 제시한다.