해상보안사고 리스크 저감을 위해서는 보안위협의 사전색출과 선제적 대비/대응이 중요하다. 다양해지는 해상보안사고의 예방/대비/대응/복구 단계를 입체적이고 통합적인 대응을 위해서 고강도 위협 대응에 집중된 군중심의 경계활동에서 해양경찰청으로 이관을 계획하고 있는 등 해상보안리스크 기반으로 대응전략이 바뀌고 있다. 해군과 해양경찰청이 운영하고 있는 해상 선박검색반은 보안위협의 사전인지를 위한 효과적인 방법으로 평가받고 있으며 선박의 활동으로 발생할 수 있는 해상보안사고를 차단하기위해 정선․검색․나포 등을 수행하고 있다. 본 연구에서는 선박검색반의 효과적인 직무 메카니즘 개발을 위한 기초연구로 선박검색반의 현황과 선박검색에 나타난 해상보안위협의 특성을 분석하였다.