한국에서 개발된 팽이버섯 균주 Fv 3-6과 일본에서 수집한 팽이버섯 균주 Fv 0-1, Fv 1-5 및 Fv 11-4의 핵형을CHEF gel electrophoresis 방법으로 분석 하였다. 그 결과4종류의 균주 모두 chromosome의 전체 길이가 달랐으며,chromosome의 개수 또는 특정 chromosome의 길이가 다른 것을 확인하였다. 특히 Fv 3-6의 경우에는 다른 3 종의 균주와 비교했을 때 Fv 0-1, Fv 11-4 보다는 2개의chromosome이 더 존재하였고 Fv 1-5 보다는 1개의chromosome이 더 존재하였으며 핵형패턴이 유사한 일본수집 균주들과는 다른 핵형패턴을 나타내었다. 이러한 CHEF gel electrophoresis 방법은 품종간의 차이를 SSR이나 ITS 정보를 이용한 방법보다 더 정확하게 구분할 수있을 것이라고 생각한다.