본 연구에서는 분자마커를 이용한 목표형질분리의 효용성을 검토하였다. Ivory seed(IVS) 유전자는 bHLH 단백질을 암호화하고 있고, 꽃의 안토시아닌과 종자의 프로안토시아닌의 발현에 관여하는 애기장대의 TT8 및 페튜니아의 AN1유전자와 상동성을 가지는 유 전자로 나팔꽃의 꽃과 종자의 착색을 촉진하는 것으로 알려져 있다. 아이보리 종자로부터 화색이 full purple(FP), pale purple(PP), magenta(M) 및 pale red(PR)인 4가지 계통의 식물체가 분리되었다. 분자분 석을 통해 이 식물체 모두 ivs 유전자의 변이형질을 지니는 것으로 확인되었다. 분자마커 선발을 위해 고안 된 프라이머를 사용하여 IVS 유전자의 exon 2와 intron 5 영역을 증폭하여, ivs 대립형질인 ivs-stb 및 ivs-pwt을 야생형 IVS로부터 구분할 수 있었다. PCR 결과로 예측한 IVS 유전자의 대립형질 구성 상태는 Southern blot 분석 결과와 정확하게 일치하였다. PP 와 PR은 ivs-stb에 의한 열성 변이체였으며, M과 FP 계통은 ivs-stb 대립형질에 더하여 각각 야생형 IVS 및 ivs-pwt와의 이형접합체로 확인되었다. 본 연구에서 선발된 분자마커는 IVS 유전자의 대립형질 구분에 매 우 유용하였다.

In rice (Oryza sativa L.), there is a diversity in flowering time that is strictly genetically regulated. The floral transition from vegetative to reproductive development is a very important step in the life cycle of a flowering plant. Although the genetic pathway for short-day flowering in rice is relatively well understood, the naturally occurring molecular mechanisms underlying flowering time diversity of the cultivated rice are still not clear. Resequencing of 295 rice accessions including 137 HS and 158 KB rice accessions, was recently finished with an average of approximately 10x depth and > 90% coverage. A wide range of variation in flowering time was observed within a diversity research set of 295 accessions ranging from 28 to 72 days. GWAS was performed using the resequencing data to investigate the candidate genes associated with flowering time in rice. Our GWAS result suggests that two SNPs in the promoter or 3’ UTR of the ‘Arabidopsis CO’ homolog FBH1 are potentially associated with early flowering. The new SNPs found in the FBH1 locus would be useful in developing markers to screen the varieties with early flowering time in the future molecular breeding.