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유채 균핵병 약제저항성 검정 및 유전적 변이 분석 KCI 등재

Fungicide resistance and analysis of genetic variation of sclerotinia stem rot in Brassica napus L.

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/409808
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한국국제농업개발학회지 (The Journal of the Korean Society of International Agriculture)
한국국제농업개발학회 (The Korean Society Of International Agriculture)
초록

본 연구는 지역별로 수집한 유채 균핵병 균주에 대해 등록 된 3종의 약제를 사용하여 저항성 검정을 실시하였고, 저항성 발생 가능성이 있는 약제의 작용 기작과 관련한 유전자를 분석하여 변이 유무를 확인하였다. 1. Carbendazim-diethofencarb 약제배지의 경우, 0.1 ppm 농도에서 균사 생장 억제율은 13.3~41.9% 범위로 나타났으며, 1 ppm 이상의 농도에서는 모든 균주에서 96.1% 억제율을 보여 균주의 저항성이 확인되지 않았다. 2. Fludioxonil 약제배지는 0.1 ppm 농도에서 균사의 생장이 94.2% 이상 억제되었으며, 1 ppm 농도에서부터 100%의 억제 율을 보여 가장 약제 효과가 우수한 것으로 나타나 수집한 모든 균주에서 약제의 감수성을 확인하였다. 3. Boscalid 약제배지는 앞선 2종의 약제에 비해 균주의 균사 생장 억제가 뚜렷하지 않았다. 특히 10 ppm 농도에서 무안 수집 균주는 93.9%, 나주 수집 균주는 79.3%로 지역 간 차이가 있었으며, 1000 ppm의 높은 약제 농도에서도 균사의 생장을 100%까지 억제하지 못해 약제에 대한 균주의 저항성 발생 가능성을 추측하였다. 4. 3종의 시험 약제 농도별 균핵병 균주의 균사 생장을 50% 억제하는 농도(EC50)를 분석한 결과, Fludioxonil, Carbendazim-diethofencarb, Boscalid 약제순이었으며, 그 값은 각각 0.06, 0.16, 0.43 ppm으로 나타났다. 5. 또한, 3종의 시험 약제 농도별 발생한 균주의 균핵 형성 능력은 1 ppm 농도에서 Carbendazim-diethofencarb는 5.6개, Fludioxonil은 0개로 나타난 반면, Boscalid는 최대 11.3개의 균핵이 형성되어 차이를 확인할 수 있었다. 6. Boscalid 약제에 대한 균주의 저항성을 확인하기 위해 해당 약제의 작용 기작인 SDHI와 관련된 유전자 SdhB를 염기 서열 분석하였다. 염기서열 분석 결과 무안 및 부산에서 수집 한 균주의 경우 SdhB 표준 염기서열과 일치하여 감수성이었으나, 나주, 당진, 제주, 영암에서 수집한 균주는 32번째 염기 가 C→T로 치환되어 GCA(Alanine)→GTA(Valine) 점 돌연변이를 확인하였다.

Sclerotinia stem rot (SSR) is the most common disease that seriously affects the yield and quality of rapeseed (Brassica napus L.). Recently, with increasing interest in rapeseed oil, better disease control methods are needed to secure stable seeds. However, the risk of the occurrence of resistant strains poses a threat as some fungicides used in preceding crop of rapeseed cultivation have the same active compounds as those used for SSR control. Studies on the occurrence of fungicide resistance during SSR control in Korea are insufficient. Therefore, SSR samples were collected from six locations (Muan, Naju, Yeongam, Busan, Jeju, and Dangjin) to screen their resistance to registered fungicides. For each type of fungicide, potato dextrose agar media with six concentrations of 0, 0.1, 1, 10, 100, and 1000 ppm were prepared, on which the collected strain was inoculated to examine mycelial growth inhibition rate and the number of sclerotia. EC50 values for various fungicides ranged from 0.06 ppm (fludioxonil) to 0.16 ppm (carbendazim-diethofencarb) and 0.43 ppm (boscalid). Carbendazim-diethofencarb and fludioxonil fungicides showed very low mycelial growth at concentrations above 1 ppm. In the case of boscalid, mycelia grew even at high concentrations, suggesting resistance to this fungicide. To determine the genetic cause of this resistance, sdhB (succinate dehydrogenase B) DNA sequence of this strain was analyzed. Results showed that in four (Naju, Yeongam, Jeju, and Dangjin) of six regions, a point mutation occurred at the 32nd base of the sdhB gene from C to T. This resulted in the replacement of GCA (alanine) by GTA (valine), leading to resistance. These findings suggest that alternate treatment of fungicides is necessary for effective control in regions where strains might be resistant to boscalid fungicide.

목차
ABSTRACT
서 론
재료 및 방법
    병원균의 분리 및 배양
    실험약제
    약제저항성 검정
    Genomic DNA 분리 및 PCR
    약제 저항성 유전자의 염기서열 분석
    통계분석
결과 및 고찰
    병원균의 수집 및 분리 결과
    약제 종류에 따른 유채 균핵병 균주의 균사생장 억제효과
    지역별 수집 균핵병 균주별 균핵 형성 평가
    숙신산 탈수소효소 유전자(Sdh B) 염기서열 분석
적 요
REFERENCES
저자
  • 박진천(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Jin Cheon Park (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration)
  • 황엄지(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Um Ji Hwang (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration)
  • 김광수(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Kwang Soo Kim (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration)
  • 김태화(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Tae Hwa Kim (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration)
  • 박원(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Won Park (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration)
  • 이영훈(농촌진흥청 국립식량과학원 바이오에너지작물연구소) | Yeong Hoon Lee (Bioenergy Crop Research Institute, National Institute of Crop Sciences, Rural Development Administration) Corresponding author