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동물플랑크톤 연구에 있어 DNA 분석 기법의 활용 방법과 과제: 개체 동정에서 군집 분석, 생물학적 상호작용 분석까지 KCI 등재

Review and Suggestions for Applying DNA Sequencing to Zooplankton Researches: from Taxonomic Approaches to Biological Interaction Analysis.

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/410175
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생태와 환경 (Korean Journal of Ecology and Environment)
초록

동물플랑크톤 군집 연구에 DNA 바코딩과 같은 DNA 분 석 기법의 적용은 분류형태학을 기반으로 하는 전통적인 종 동정 시 발생할 수 있는 문제 (e.g. 개체의 표현형 가소성에 의한 오동정, 유사종 및 자매종, 유생 시기의 종 동정의 어려움)를 보완할 수 있다. 최근 DNA 시퀀싱 기술의 발전으로 다양한 수생태계의 동물플랑크톤 군집은 물론, 육안 및 현미경을 통해 구분하는 데 한계가 있는 동물플랑크톤의 위 내용물에 대한 DNA 기반 군집 분석 또한 가능하게 되었으며, 이는 동물플랑크톤의 섭식 먹이원 분석을 통한 생물학적 상호 작용을 이해를 돕는다. 본 논문은 동물플랑크톤 연구에 DNA 분석 기법이 활용된 사례 (e.g. DNA 바코딩을 이용한 계통분 류학적 연구, 메타바코딩을 이용한 군집 분석, 위 내용물 분석)를 소개하고 분석 방법을 요약하여, 최종적으로 향후 이를 활용하고자 하는 연구자들에게 연구 접근성을 높일 수 있도록 방법론적인 기초 지식을 제공하고자 하였다.

Traditional morphological identification difficulties, such as phenotypic plasticity, misidentification of cryptic species, and larval stage species, can be compensated for by using DNA analysis techniques, such as DNA barcoding, in surveying zooplankton populations, including species identification. Recently, the rapid development of DNA sequencing techniques has allowed DNA-based community analysis not only for zooplankton assemblages in various aquatic ecosystems but also for the gut contents of zooplankton that are limited by conventional methods such as visual and microscopic identification. Therefore, the application of DNA sequencing can help understand biological interactions through the analysis of zooplankton food sources. The present paper introduces the major DNA-based approaches in zooplankton research topics, including taxonomic approaches by DNA barcoding, community-level approaches by metabarcoding, and gut content analyses, summarizes the analysis methods, and finally suggests the methodological topics that need to be considered for future applications.

목차
Abstract
서 론
DNA 바코딩 (DNA barcoding)을이용한 동물플랑크톤 연구
    1. 동물플랑크톤 DNA 바코딩을 위한시료의 채집 및 보존 방법
    2. 동물플랑크톤 표본으로부터 DNA 추출 방법
    3. 추출한 DNA의 PCR 증폭
    4. PCR 증폭 산물의 염기서열 분석
메타바코딩 (metabarcoding)을 통한동물플랑크톤 군집 분석
메타바코딩 (metabarcoding)을 통한동물플랑크톤 섭식 먹이원 분석
결 론
적 요
REFERENCES
저자
  • 오혜지(경희대학교 환경학및환경공학과) | Hye-Ji Oh (Department of Environmental Science and Engineering, Kyung Hee University) Corresponding author
  • 채연지(경희대학교 환경학및환경공학과) | Yeon-Ji Chae (Department of Environmental Science and Engineering, Kyung Hee University)
  • 최예림(경희대학교 환경학및환경공학과) | Yerim Choi (Department of Environmental Science and Engineering, Kyung Hee University)
  • 구도영(경희대학교 환경학및환경공학과) | Doyeong Ku (Department of Environmental Science and Engineering, Kyung Hee University)
  • 허유지(순천대학교 환경교육과) | Yu-Ji Heo (Department of Environmental Education, Sunchon National University)
  • 곽인실(전남대학교 수산과학연구소) | Ihn-Sil Kwak (Fisheries Science Institute, Chonnam National University)
  • 조현빈(부산대학교 환경·에너지연구소) | Hyunbin Jo (Institute for Environment and Energy, Pusan National University)
  • 박영석(경희대학교 생물학과) | Young-Seuk Park (Department of Biology, Kyung Hee University)
  • 장광현(경희대학교 환경학및환경공학과) | Kwang- Hyeon Chang (Department of Environmental Science and Engineering, Kyung Hee University) Corresponding author
  • 김현우(순천대학교 환경교육과) | Hyun-Woo Kim (Department of Environmental Education, Sunchon National University) Corresponding author