일본은 기후적으로도 쌀의 생산에 적합하며 쌀은 일본의 주곡이다. 1893년 국립농업연구소가 설치된 이래로 쌀은 품질과 단보당 생산량이 꾸준히 개선 되어와 1/6의 노동시간으로 생산량은 2.5배의 증가 를 가져왔다. 이러한 진전은 재배방법의 개선, 비료, 농약, 재배기술, 기계화, 관개배수, 농지개량 등의 요인들로 볼 수 있다. 현재 일본에서 생산되고 있는 주요 쌀 품종으로 는 묘시히카리 (35.5%), 히토메보레 (9.7%), 히노히카 리 (9.0%), 아키다코마치 (8 .5%), 키라라(4.8%) 등 10 여 품종이며 최근에는 형질전환 품종의 연구와 함 께 생물공학적 연구, 생리, 품질, 곤충과 잡초, 토양, 식품가공 등 기본적인 연구에 심혈을 기울이고 있 다. 새로운 형태의 쌀 품종으로는 냉동조리쌀밥, 초밥, 레토르트룡 쌀 등 가공용으로 적합하도록 하기 위하여 아밀로오즈의 함량을 5-15%로 낮춘 쌀이나 카레, 필라프, 튀김 쌀 등의 용도에 적합하도록 아 밀로오스의 함량을 30% 이상으로 높인 쌀 뿐만 아니 라 곡립의 크기와 길이 등을 변형시킨 쌀, 유색미, 향미(香米), 단백질 함량 조절 쌀, 거대 배아미, lipxygenase 활성을 없앤 쌀, 단맛나는 쌀 등이 연 구, 생산되고 있다. 일본에서의 쌀이용은 먼저 가공용 쌀을 들 수 있 다. 밥, 청주, 스댁, 쌀가루, 미소발효 등 다양하게 이용이 되고 있으며 parboiled rice와 이의 색과 향을 개선한 converted rice, 현미를 이용한 가공쌀, 쌀빵, 현미가루,세척미,쌀국수,쌀스댁,당과,죽,짧은 채소아 함께하는 타키코미고한, 초밥, 냉동쌀밥, 무 균포장밥, 건조밥, 즉석밥 등 매우 다양하다.