Real Time PCR을 이용한 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 수 있는 새로운 방법을 개발하였다. Real Time PCR을 이용하여 벼 흰잎마름병을 예찰하기 위하여 TaqMan MGB probe를 이용한 프라이머인 Xan_PahgeF & Xan_PahgeR primer와 Xan_Pahge FAM MGB probe를 제작하였으며, 높은 특이성이 인정되었다. 병원균 배양액, 벼 흰잎마름병원균의 DNA, 병원세균에 오염된 물에서도 효과적으로 검출이 되었다. 농수로물이나 관개수에서 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 때 정량 PCR의 저해인자 제거 후 신속하게 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 수 있다.

We developed a new measurement method for the density of Xanthomonas oryzae pv. oryzae(Xoo), a casual pathogen of bacterial leaf blight of rice. The new method used real time PCR with the highly characterized and specific Xan_PahgeF & Xan_PahgeR primer and Xan_Pahge FAM MGB probe primer pairs derived from phage-related integrase gene. The method was effective when tested with a variety of templates including isolated Xoo DNA, pure colonies or liquid culture sources, and could also work on contaminating water. A main advantage of this assay is to accurately and rapidly quantitate the population density of Xoo in paddy field water containing inhibitors.

• 노태환(농촌진흥청 국립식량과학원 간척지농업과) | Tae-Hwan Noh Corresponding author
• 강미형(농촌진흥청 국립식량과학원) | Mi-Hyung Kang
• 서수좌(농촌진흥청 국립식량과학원 간척지농업과) | Su-Joa Seo
• 심형권(농촌진흥청 국립식량과학원 간척지농업과) | Hyeong-Kwon Shim
• 최만영(농촌진흥청 국립식량과학원 간척지농업과) | Man-Young Choi
• 박종철(농촌진흥청 국립식량과학원 간척지농업과) | Jong-Chul Park
• 백채훈(농촌진흥청 국립식량과학원) | Chae-Hoon Paik
• 김형무(전북대학교 농업생명과학대학 식물의학연구센터) | Hyung-Moo Kim