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전장유전체 관련성 분석을 통한 순종 랜드레이스 생시체중 형질의 위치상 후보유전자 탐색 KCI 등재

Genome-wide Association Study Identifies Positional Candidate Genes Affecting Birth Weight Trait in Purebred Landrace

  • 언어KOR
  • URLhttps://db.koreascholar.com/Article/Detail/350528
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농업생명과학연구 (Journal of Agriculture & Life Science)
경상대학교 농업생명과학연구원 (Institute of Agriculture & Life Science, Gyeongsang National University)
초록

돼지의 생시체중은 생존율과 폐사율에 밀접한 관련이 있어 양돈산업에서 자돈 관리와 직결된 중요한 경제형질이다. 본 연구는 Genome-Wide Association Study(GWAS) 분석을 통해 순종 랜드레이스의 생 시체중과 관련된 위치상 후보유전자 탐색을 실시하였다. 생시체중의 유의적 관련 분석 결과, genomewide suggestive level에서 유의성 있는 single nucleotide polymorphism(SNP) marker는 3번 염색체 (ASGA0098921, P=2.41×10-5)와 4번 염색체(H3GA0013451, P=2.47×10-5)에서 각각 1개씩 동정되었다. 이들 SNP marker가 위치한 3개의 유전자(LOC110260055, LOC100156472, LOC100157689)들은 순종 랜드레이스 생시체중의 위치상 후보 유전자이며, 이들 유전자 정보를 이용해서 순종 랜드레이스 생시 체중을 선발할 수 있는 기초 연구 자료가 될 것으로 사료된다.

Birth weight represents an important trait that has an economic value because it is closely associated with survival and mortality. This study aimed to identify positional candidate genes associated with birth weight of purebred Landrace pigs using genome-wide association study(GWAS). Based on the analysis of genes significantly associated with birth weight, a single nucleotide polymorphism(SNP) marker that is significant at genome-wide suggestive level was identified on chromosome 3(ASGA0098921, P=2.41×10-5) and 4(H3GA0013451, P=2.47×10-5), respectively. These three genes(LOC110260055, LOC100156472, LOC100157689) containing each SNP marker individually are positional candidate genes associated with birth weight of purebred Landrace pigs. Therefore, the results of this study can be used for fundamental studies required to select an optimal birth weight range for the purebred Landrace pigs.

목차
초록
 ABSTRACT
 서론
 재료 및 방법
  1 공시 동물 및 DNA 추출
  2 생시체중 형질 측정
  3 데이터 기초분석 및 GWAS
 결과 및 고찰
 감사의 글
 References
저자
  • 강호찬(경상대학교 응용생명과학부(BK21 plus), Division of Applied Life Science(BK21 plus), Gyeongsang National University) | Ho-Chan Kang
  • 이재봉(전북대학교 인수공통전염병연구소, Korea Zoonosis Research Institute(KoZRI), Chonbuk National University) | Jae-Bong Lee
  • 유채경(경상대학교 부속 농업생명과학연구원, Institute of Agriculture and Life Science, Gyeongsang National University) | Chae-Kung Yoo
  • 최태정(농촌진흥청 국립축산과학원 양돈과, Swine Science Division, National Institute of Animal Science, RDA) | Tae-Jeong Choi
  • 임현태(경상대학교 응용생명과학부(BK21 plus), Division of Applied Life Science(BK21 plus), Gyeongsang National University, 경상대학교 부속 농업생명과학연구원, Institute of Agriculture and Life Science, Gyeongsang National University) | Hyun-Tae Lim Corresponding author