본 연구는 농어, Lateolabrax japonicus에서 Carbonic anhydrase Ⅲ (CA Ⅲ)의 발현 양상을 관찰하고자 농어의 각 조직에서 Bradford 방법을 이용하여 가용성 단백질의 함량을 조사하였고, SDS-PAGE와 western blot analysis로 CA Ⅲ의 분자량을 조사하였으며 IEF와 western blot analysis로 CA Ⅲ의 등전점을 관찰하였다. 또한, 비교 분석을 위하여 동일한 방법으로 무지개송어, Oncorhynchus mykiss의 각 조직에서도 CA Ⅲ의 분자량과 등전점을 확인하였고 두 어류의 가용성 단백질을 ELISA법을 이용하여 CA Ⅲ의 상대농도를 비교 분석하였다. Bradford 분석에서 가용성 단백질의 함량은 상대적으로 무지개송어가 높게 나타났으며 ELISA분석에서도 CA Ⅲ의 상대농도가 무지개송어에서 높게 관찰되었다. SDS-PAGE와 western blot analysis 분석 결과 두 어류의 조직에서 분자량 30,000 (Da)의 band가 확인되었으며 IEF와 western blot analysis 분석 결과 등전점 (pI) 7.0에서 band가 확인되었다.