목적: 제 5기 국민건강영양조사(2011년, 2012년) 자료를 기반으로 우리나라 나이관련황반변성(age-related macular degeneration)과 비타민과 무기질의 섭취의 상관성을 분석하였다.
방법: 국민건강영양조사 제 5기 과정 중 2011, 2012년도 조사대상자 중 건강 검진, 안과 검진과 영양검진 조사를 받은 45세 이상 성인을 대상으로 나이관련황반변성과 비타민, 무기질섭취량의 상관성을 분석하였다. 나이관련황반변성의 연관성은 교차분석과 카이제곱 검정으로 분석하고, 위험비(odds ratio)는 로지스틱 회귀분석으로 구하고 유의수준은 0.05 이하로 하였다.
결과: 국민건강영양조사를 받은 45세 이상의 한국인 6,219명 중 나이관련황반변성 유병률은 9.6%로 나타 났다. 초기 나이관련황반변성은 비타민 A, B1, B2, B3 및 C와 칼슘, 인, 철, 나트륨, 칼륨의 섭취와 상관성이 있었으며, 비타민 B3 섭취량이 평균 미만인 경우는 평균이상인 경우보다 초기 나이관련황반변성의 발생 위험이 1.35배(95% 신뢰구간:1.03~1.78) 높았다. 나이관련황반변성 말기 환자 군에서는 칼륨과 비타민 B2 섭취량이 평균보다 적으면 유병률이 높았으며, 칼륨 섭취량이 평균 미만인 경우는 발병 위험이 4.3배(95% 신뢰구간:1.76~10.59) 높았다.
결론: 비타민과 무기질의 섭취는 나이관련황반변성의 발병 위험과 병의 진행을 억제하는 것으로 사료된다.
목 적: 2011, 2012년도 국민건강영양조사 내용을 기반으로 우리나라 나이관련황반변성(Age-related macular degeneration, AMD)의 위험요인을 분석하고자 하였다.
방 법: 국민건강영양조사 제5기 과정 중 2011년, 2012년도 조사대상자의 건강 검진과 안과 검진을 받은 45세 이상의 성인을 대상으로 AMD와 상관성이 있는 위험요인인 성별과 연령 통제 전과 후로 구분하여 로지 스틱 회귀분석으로 통계처리를 하였으며 유의수준은 0.05 이하로 하였다.
결 과: 인구·보건학적인 요인에서는 성별과 연령을 통제하기 전에는 여성, 연령이 많을수록, 교육정도 가 낮을수록, 읍/면 거주자에서 발병률이 높게 나타났으나, 성별과 연령을 통제한 경우에는 거주지는 상관 성이 없고 여성과 연령이 많을수록, 교육정도가 낮을수록 발병률이 높게 나타났다. 신체·질병학적인 요인 에서는 성별과 연령 통제하기 전에는 고혈압, 중성지방 및 가족력이 위험요인이었으나 성별과 연령 통제 후 에는 모든 요인들이 AMD와 상관성이 없었다. 성별과 연령을 통제하기 전에는 난시, 근시, 원시, 백내장 및 안질환 가족력이 AMD와 상관성이 있었으나, 성별과 연령을 통제 후에는 원시안과 백내장이 AMD 위험요인 으로 나타났고 근시안은 AMD 위험요인이 낮은 것으로 나타났다. 건강·행태학적인 요인에서는 성별과 연령 을 통제하기 전에는 햇볕 노출 5시간 이상만 상관성이 있었으나, 성별과 연령을 통제한 후에는 흡연, 햇볕 노출 5시간 이상이 AMD 발병을 높이는 위험요인으로 분석되었다.
결 론: AMD 발병은 나이와 성별에 연관이 있고, 성별과 연령을 통제한 경우에는 원시, 백내장, 흡연 및 햇볕 노출 시간이 상관성이 있음을 확인하였다.
GWAS (Genome-wide association study) provides a useful to associate phenotypic variation to genetic variation. It has emerged as a powerful approach for identifying genes underlying complex diseases or morphological traits at an unprecedented rate. Despite benefits, there are only a few examples applied in crop plants due to lack of effective genotyping techniques and well prepared resources for developing high density haplotype maps. In this study, 350 core accessions selected from almost 5,000 Capsicum accessions were used for GWAS. We are planning to construct a high-density haplotype map using GBS platform and perform GWAS for various agronomic traits including fruit traits and metabolites related to pungency to identify genes controlling the traits. These results will not only provide a list of candidate loci but also a powerful tools for finding genetic variants that can be directly used for crop improvement and deciphering the genetic architecture of complex traits.
Capsicum diversity is getting lower in modern crops because of the genetic erosion. In Capsicum, breeders have been mainly focused on agriculturally important traits such as disease resistances, high yield and pungency. This narrow breeding pool hampered to develop improved cultivars. It has become a hot issue to conservation of genetic diversity and exploitation of wild germplasm in Capsicum. However, although a large number of accessions are maintained in Capsicum germplasm collections, their use for crop improvement is limited by the scarcity of information on genetic diversity, population structure and proper phenotypic assessment. The identification of representative and manageable subset of accessions would facilitate access to the diversity available in large collections. A genome wide germplasm characterization using molecular markers can offer reliable tools for adjusting the quality and representativeness of core samples. We investigated patterns of molecular diversity at 48 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 4056 accessions from 11 Capsicum species from 89 different countries. Using these genetic variations and 32 different morphological traits, 250 core set was selected in whole Capsicum germplasm. The core collection could be a primary source for distributing germplasm to pepper breeders and other national programs as well as for evaluation
Capsicum diversity is getting lower in modern crops because of the genetic erosion. In Capsicum, breeders have been mainly focused on agriculturally important traits such as disease resistances, high yield and pungency. However, this narrow breeding pool hampered to develop improved cultivars. It has become a hot issue to conservation of genetic diversity and exploitation of wild germplasm in Capsicum. Analysis of genetic diversity and construction of core collection is the first step to make efficient use of germplasm. Although there have been several attempts to construct core collections in Capsicum, most of these works were limited due to handling small number of samples, relying mainly on the characterization of morphological traits or focusing only C. annuum species. To expand understanding of the structure and genetic diversity of germplasm in Capsicum, we need to have a highly efficient genotyping tool to handle large number of samples. Toward this end, we are analyzing 3,599 germplasm accessions including other cultivated species and wild species in Capsicum with 48 single nucleotide polymorphism (SNP) markers.