본 연구는 Yorkshire종, Landrace종 및 Duroc종에 대한 유전체자료를 이용하여 수퇘지의 웅취를 유발하는 세 가지 호르몬인 androstenone, indole 및 skatole 호르몬에 대한 유의적인 유전자영역, SNP 마커 및 후보유전자를 발굴하여 최종적으로 저웅취 종돈을 육종하는데 그 목적이 있다. Genomoe-Wide Association Study를 수행하기 위한 참조집단으로 수집한 유전체 정보는 Yorkshire, Landrace 및 Duroc종에서 각각 3,858 두, 472두 및 1,029두로 총 5,359두에 대한 유전체자료를 분석에 이용하였다. 추정되는 육종가의 정확도를 평가하기 위하여 REML방법을 ASREML 4.1 소프트웨어를 이용하여 분석하였고 세 가지 호르몬에 대하여 다형질 개체모형을 적용하였으며 추정된 육종가로부터 산출한 deregreessed DEBVincPA를 반응변수로 이용하여 연구를 수행하였다. 세 가지 호르몬에 대하여 BayesB와 C의 방법론을 통하여 분석한 결과 BayesB에서 세 가지 호르몬과 연관될 것으로 예상되는 SNP marker 9개, 즉 androstenone에서 3개, indole에서 1개 및 skatole에서 5개가 발굴되었다. BayesC에 서는 이보다 적은 SNP marker 3개가 발굴되었다. 수퇘지의 웅취 호르몬에 영향을 미칠 것으로 예상되는 후보유전자는 총 6개로 각각 LMAN2L, ABLI, NRG3, CDH12, TRAPPC9, MAN1A2로 나타났다

Several studies on the correlation between temperament and genetic diversity are conducted in animals as well as human. Horse temperament is especially important because it is important factor for horse riding and racing. In this study, we performed targeted exome sequencing to find single nucleotide polymorphisms (SNPs) served as genetic markers that can evaluate the aggressive and docile levels of horses. We selected 71 candidate genes related to animal and human temperament through previous researches and verified it on the human reference genome (hg38) and horse reference genome (equCab2). We found that 16 orthologous genes were present in horse reference genome and 17 homologous genes found in horses based on the human reference genome. Finally, we designed probes to find the genetic variation in selected 33 genes. The sequencing libraries were constructed using the designed probe and DNA samples extracted from the blood of 8 aggressive and 8 docile horses. The constructed libraries were sequenced using the Illumina Hiseq2500 platform. SNPs data obtained from targeted exome sequencing will be used for genome wide association study (GWAS) and Sanger sequencing validation. This study will help to assess the horse temperament and to select superior horses for riding or racing.