수염풍뎅이(Polyphylla laticollis manchurica)는 과거에는 흔히 발견되었으나, 1970년대 이후 한반도 내 개체수 가 급격히 감소하여 2005년 환경부에 의해 멸종위기 야생생물 Ⅰ급으로 지정되었다. 또한 해당종의 분자생물학적 연구는 멸종위기종이라는 특성으로 인해 제한적으로 진행되었다. 그로 인해 NCBI 등 공공 데이터베이스에서 제공되는 서열정보들 또한 부족한 실정이다. 이 연구는 이러한 한계를 극복하고 수염풍뎅이의 유전적 특성을 규명하기 위해 생물정보학적 기술을 활용하여 전사체 분석을 진행하였다. Illumina HiSeq 2500 플랫폼을 사용하여 53,433,048개의 RNA reads를 얻었으며, Trinity와 TGICL을 이용한 De novo 어셈블리 분석을 통해 18,172개의 unigenes를 생성하였다. 생성된 unigenes는 GO, KOG, KEGG, PANM DB를 활용하여 annotation을 진행하였다. 그 결과, GO 분석에서는 ‘binding and catalytic activities’와 관련된 항목이 높은 발현을 보였으며, KOG 분석의 경우 ‘Cellular Processes and Signals’ 범주가 높은 비율을 나타내었다. KEGG 분석을 통해 2,118개의 unigenes가 metabolic 카테고리에 annotation된 것을 확인하였다. SSR 모티프 분석에서는 AT/AT (42.90%) 모티프, AAT/ATT (13.13%) 모티프 순으로 많이 나타나는 것을 확인하였다. 이 연구를 통해 분석한 결과 들을 이용하여 유전자원 및 종 정보를 실시간 제공 및 정보 공유가 가능하도록 Database 및 web-interface를 구축하 였으며, 이러한 자료들은 국내 멸종위기종인 수염풍뎅이의 고유한 유전적 특성을 발굴 및 확보할 수 있는 기반자 료로써 활용될 수 있을 것으로 사료된다.

장내 미생물 군집은 소화 과정, 면역 시스템, 질병 발생 등 숙주의 다양한 면에 광범위한 영향을 주는 것으로 알려져 있으며, 주요 장내 미생물 종은 숙주의 생리 기능에 핵심적인 역할을 수행한다고 발표된 바 있다. 곤충의 장내 미생물 군집에 관한 연구가 최근 활발히 이루어지고 있으며, 이들 연구는 주로 장내 미생물 군집과 기생충, 병원체 간의 상호작용, 종간의 신호 전달 네트워크, 먹이의 소화 과정 등을 중심으로 이루어지고 있다. 이러한 연구들은 대부분 Illumina MiSeq을 활용하여 16S rRNA 유전자의 V1부터 V9 영역 중 선택된 특정 부분을 대상으로 짧은 서열 정보를 대상으로 진행되었다. 그러나, 최근에는 PacBio HiFi 기술이 상용화되면서 16S rRNA의 전장 분석이 가능할 수 있게 되었다. 이번 연구는 장수말벌(Vespa mandarinia)의 해부를 통해 gut과 carcass 부분을 분리한 뒤, 각 샘플을 Illumina MiSeq과 PacBio HiFi 기술을 활용하여 미생물 군집 간의 차이점을 확인하기 위하여 수행되었다.

단백질의 구조 예측은 생명 과학 및 의약학 분야의 핵심적인 연구 주제 중 하나로, 단백질의 기능 및 상호작용을 이해하기 위한 주요 정보를 제공할 수 있어 다양한 연구가 수행되고 있다. 이러한 연구의 일환으로 최근 Google DeepMind의 AlphaFold2가 등장하였으며, 단백질 구조 예측 성능을 대폭 향상시켜 CASP(Critical Assessment of Protein Structure Prediction)에서 뛰어난 평가점수를 받아 단백질 구조 예측 분야의 최신 기술을 크게 향상시켰다. 이러한 컴퓨터 기반의 단백질의 구조 예측 방법은, 고전적인 방법을 사용하여 직접 단백질 구조를 결정하는 방법 에 비해 매우 정확하고 빠르며 경제적인 비용으로 수행될 수 있어 단백질 구조 예측 및 생리학 연구를 수행하는 연구자들에게 유용한 방법론이 될 것으로 사료된다. 따라서 본 연구소에서는 곤충을 포함한 무척추 자생동물을 연구하는 연구자들을 위해 단백질 구조 예측을 수행할 수 있도록 64Core/128Threads의 CPU, 256GB의 RAM과 6장의 GeForce RTX 3090으로 이루어진 GPU(Graphical Processing Unit) 고성능 컴퓨터 시스템에 AlphaFold2 program을 구축하였다. 최근 인간을 대상으로 한 단백질 구조 예측 연구는 상당한 진전을 보이고 있지만, 곤충을 포함한 자연계의 동물을 대상으로 한 연구는 여전히 미비한 상황이다. 이러한 자생동물자원연구의 확대를 위해 본 연구소에서 구축한 GPU 시스템 및 생물정보학적 분석 방법이 많이 활용되어야 하며, 이를 위해서는 연구자들 의 협력과 참여가 필요하다.

After the major radioactivation structures (RPV, Core, SG, etc.) due to neutron irradiation from the nuclear fuel in the reactor are permanently shut down, numerous nuclides that emit alpha-rays, beta-rays, gamma-rays, etc. exist within the radioactive structures. In this study, nuclides were selected to evaluate the source term for worker exposure management (external exposure) at the time of decommissioning. The selection of nuclides was derived by sequentially considering the four steps. In the first stage, the classification of isotopes of major nuclides generated from the radiation of fission products, neutron-radiated products, coolant-induced corrosion products, and other impurities was considered as a step to select evaluation nuclides in major primary system structures. As a second step, in order to select the major radionuclides to be considered at the time of decommissioning, it is necessary to select the nuclides considering their half-life. Considering this, nuclides that were less than 5 years after permanent suspension were excluded. As a third step, since the purpose of reducing worker exposure during decommissioning is significant, nuclides that emit gamma rays when decaying were selected. As a final step, it is a material made by radiation from the fuel rod of the reactor and is often a fission product found in the event of a Severe accident at a nuclear power plant, and is excluded from the nuclide for evaluation at the time of decommissioning is excluded. The final selected Co-60 is a nuclide that emits high-energy gamma rays and was classified as a major nuclide that affects the reduction of radiation exposure to decommissioning workers. In the future, based on the nuclide selection results derived from this study, we plan to study the evaluation of worker radiation exposure from crud to decommissioning workers by deriving evaluation results of crud and radioactive source terms within the reactor core.

In Natural Analogue Study, Concrete is one of the important engineering barrier components in the Multi-thin wall concept of radioactive waste disposal and plays the most important role in disposal sites. The concrete barrier at the disposal site loses its role as a barrier due to various deterioration phenomena such as settlement, earthquake, and ground movement, causing the disposed waste to leak into the natural ecosystem. Some of the key factor is deterioration triggered by sulfate attack. Concrete deterioration induced by sulfate is commonly manifested in an extensive scale when a concrete structure makes contact with soil or water, aggravating its performance. In this study, an accelerated concrete deterioration evaluation experiment was performed using a total of three experimental methods to evaluate the reaction between concrete and water. The first experiment was a deterioration evaluation using Demi. Water, the second was a deterioration evaluation using KURT groundwater after extraction, and the last experiment was a concrete deterioration evaluation using KURT groundwater and sodium sulfate. For all of these experiments, accelerated concrete deterioration experiments were conducted after immersion for a total of 365 days, and specimens were taken out at 30-day intervals and characterization analysis such as SEM and EDS was performed. Experimental analyzes have shown that various chemical species are generated or destroyed over time. In the future, we plan to continue to conduct a total of three concrete deterioration evaluation experiments above, and additionally evaluate the chemical reaction between bentonite and concrete.

Antioxidants partially ameliorated the detrimental effects of reactive oxygen species (ROS) on sperm characteristics during in vitro storage. The objective of the present study was to investigate the single or synergetic antioxidative effect of curcumin and Vit. E on the characteristics of fresh boar sperm during in vitro storage. The sperm viability in curcumin, Vit. E supplementation and curcumin+Vit. E+H2O2 groups remained over 85.0% in 3 hr incubation period, but in 6 hr incubation period, curcumin+Vit. E+H2O2 groups was sharply dropped than those of curcumin and Vit. E group. The membrane intergrity in all evaluated groups except for H2O2 group did not significantly difference in 3 hr incubation period. The viability in curcumin or Vit. E supplementation were significantly increased than in curcumin+H2O2 and Vit. E+H2O2 group in 6 hr incubation period. The percentage of mitochondrial activity and acrosome intergrity obtained similar trends within same incubation periods irrespective of treatment. The lipid peroxidation of spermatozoal plasma membrane ranged from 11.6∼17.5 nM/l×106 and 14.0∼ 19.0 nM/l×106 in 3 hr and 6 hr incubation periods. In conclusion, curcumin or Vit. E rpplementation alone or cooperatively improved sperm viability index (motility, membrane intergrity, viability and survival rates) and fertility index (mitochondria activity, acrosome intergrity and lipid peroxidation) of fresh boar sperm, indicating that curcumin and Vit. E have a antioxidative properties through its scavenging activity against hydrogen peroxide.