검색결과

검색조건
좁혀보기
검색필터
결과 내 재검색

간행물

    분야

      발행연도

      -

        검색결과 15

        1.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        수염풍뎅이(Polyphylla laticollis manchurica)는 과거에는 흔히 발견되었으나, 1970년대 이후 한반도 내 개체수 가 급격히 감소하여 2005년 환경부에 의해 멸종위기 야생생물 Ⅰ급으로 지정되었다. 또한 해당종의 분자생물학적 연구는 멸종위기종이라는 특성으로 인해 제한적으로 진행되었다. 그로 인해 NCBI 등 공공 데이터베이스에서 제공되는 서열정보들 또한 부족한 실정이다. 이 연구는 이러한 한계를 극복하고 수염풍뎅이의 유전적 특성을 규명하기 위해 생물정보학적 기술을 활용하여 전사체 분석을 진행하였다. Illumina HiSeq 2500 플랫폼을 사용하여 53,433,048개의 RNA reads를 얻었으며, Trinity와 TGICL을 이용한 De novo 어셈블리 분석을 통해 18,172개의 unigenes를 생성하였다. 생성된 unigenes는 GO, KOG, KEGG, PANM DB를 활용하여 annotation을 진행하였다. 그 결과, GO 분석에서는 ‘binding and catalytic activities’와 관련된 항목이 높은 발현을 보였으며, KOG 분석의 경우 ‘Cellular Processes and Signals’ 범주가 높은 비율을 나타내었다. KEGG 분석을 통해 2,118개의 unigenes가 metabolic 카테고리에 annotation된 것을 확인하였다. SSR 모티프 분석에서는 AT/AT (42.90%) 모티프, AAT/ATT (13.13%) 모티프 순으로 많이 나타나는 것을 확인하였다. 이 연구를 통해 분석한 결과 들을 이용하여 유전자원 및 종 정보를 실시간 제공 및 정보 공유가 가능하도록 Database 및 web-interface를 구축하 였으며, 이러한 자료들은 국내 멸종위기종인 수염풍뎅이의 고유한 유전적 특성을 발굴 및 확보할 수 있는 기반자 료로써 활용될 수 있을 것으로 사료된다.
        2.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        장내 미생물 군집은 소화 과정, 면역 시스템, 질병 발생 등 숙주의 다양한 면에 광범위한 영향을 주는 것으로 알려져 있으며, 주요 장내 미생물 종은 숙주의 생리 기능에 핵심적인 역할을 수행한다고 발표된 바 있다. 곤충의 장내 미생물 군집에 관한 연구가 최근 활발히 이루어지고 있으며, 이들 연구는 주로 장내 미생물 군집과 기생충, 병원체 간의 상호작용, 종간의 신호 전달 네트워크, 먹이의 소화 과정 등을 중심으로 이루어지고 있다. 이러한 연구들은 대부분 Illumina MiSeq을 활용하여 16S rRNA 유전자의 V1부터 V9 영역 중 선택된 특정 부분을 대상으로 짧은 서열 정보를 대상으로 진행되었다. 그러나, 최근에는 PacBio HiFi 기술이 상용화되면서 16S rRNA의 전장 분석이 가능할 수 있게 되었다. 이번 연구는 장수말벌(Vespa mandarinia)의 해부를 통해 gut과 carcass 부분을 분리한 뒤, 각 샘플을 Illumina MiSeq과 PacBio HiFi 기술을 활용하여 미생물 군집 간의 차이점을 확인하기 위하여 수행되었다.
        3.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        Haemaphysalis longicornis는 사람과 동물에게 여러 심각한 병원체를 전달하는 주요 매개체로, 한반도에 널리 분포하고 있다. H. longicornis는 Rickettsia spp., Borrelia spp., Francisella spp., Coxiella spp., 그리고 중증열성혈소판 감소증후군 바이러스 (SFTS virus) 등을 매개하는 것으로 알려져 있다. 국내에 서식하는 H. longicornis의 미생물 군집과 관련된 연구는 많이 진행되지 않은 것으로 확인되었다. 이 연구는 한반도 내 다양한 지역에서 채집된 H. longicornis의 미생물군집 다양성을 지역별, 성장 단계 및 성별에 따라 분석하였다. 2019년 6월부터 7월까지 질병관리청 권역별기후변화매개체감시거점센터 16개 지역에서 채집한 H. longicornis의 16S rRNA 유전자 V3-V4 영역을 PCR로 증폭 후 Illumina MiSeq 플랫폼으로 시퀀싱하였다. Qiime2를 활용한 미생물 다양성 분석을 통해 총 46개의 샘플에서 1,754,418개의 non-chimeric reads를 얻었으며, 평균 126개 의 operating taxonmic unit (OTU) 을 식별하여 총 1,398개의 OTU를 확인하였다. 대부분의 지역에서 Coxiella spp.가 우점종으로 나타났으며, 특히 Coxiella endosymbiont는 가장 높은 우점도를 보이며, Coxiella burnetii와 계통 발생 학적으로 유사한 것으로 확인되었다. 이 연구를 통해 분석된 결과는 각 지역의 H. longicornis 미생물군집 데이터 베이스 구축에 활용되었으며, 이를 통해 지역별 미생물군집의 특이성을 식별할 수 있게 하였다. 이는 한반도의 H. longicornis에 의한 질병 전파 연구와 이를 통한 공중보건 개선에 기여할 것으로 기대된다.
        4.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        단백질의 구조 예측은 생명 과학 및 의약학 분야의 핵심적인 연구 주제 중 하나로, 단백질의 기능 및 상호작용을 이해하기 위한 주요 정보를 제공할 수 있어 다양한 연구가 수행되고 있다. 이러한 연구의 일환으로 최근 Google DeepMind의 AlphaFold2가 등장하였으며, 단백질 구조 예측 성능을 대폭 향상시켜 CASP(Critical Assessment of Protein Structure Prediction)에서 뛰어난 평가점수를 받아 단백질 구조 예측 분야의 최신 기술을 크게 향상시켰다. 이러한 컴퓨터 기반의 단백질의 구조 예측 방법은, 고전적인 방법을 사용하여 직접 단백질 구조를 결정하는 방법 에 비해 매우 정확하고 빠르며 경제적인 비용으로 수행될 수 있어 단백질 구조 예측 및 생리학 연구를 수행하는 연구자들에게 유용한 방법론이 될 것으로 사료된다. 따라서 본 연구소에서는 곤충을 포함한 무척추 자생동물을 연구하는 연구자들을 위해 단백질 구조 예측을 수행할 수 있도록 64Core/128Threads의 CPU, 256GB의 RAM과 6장의 GeForce RTX 3090으로 이루어진 GPU(Graphical Processing Unit) 고성능 컴퓨터 시스템에 AlphaFold2 program을 구축하였다. 최근 인간을 대상으로 한 단백질 구조 예측 연구는 상당한 진전을 보이고 있지만, 곤충을 포함한 자연계의 동물을 대상으로 한 연구는 여전히 미비한 상황이다. 이러한 자생동물자원연구의 확대를 위해 본 연구소에서 구축한 GPU 시스템 및 생물정보학적 분석 방법이 많이 활용되어야 하며, 이를 위해서는 연구자들 의 협력과 참여가 필요하다.
        11.
        2005.03 KCI 등재 서비스 종료(열람 제한)
        In this paper, we will consider the status of two types of PP subjects in [Spec, TP]: inverted PP in locative inversion and non-inverted PP in PP subject constructions. On the basis of the assumption that the syntactic expression can be determinable under the meaning of the verb (Levin & Rappaport 1995), we will propose Unaccusativity Condition in order to explain the status of PP subjects. This condition claims that PPs in [Spec, TP] that denote a time, place, or manner are restricted to unaccusativity status of the verb. This functional approach provides us with a unified analysis of two kinds of PP subjects in [Spec, TP].
        12.
        2003.06 KCI 등재 서비스 종료(열람 제한)
        Kiyang Kwon. 2003. `That-t` Effects and the C-T Relation. Studies in Modern Grammar 32, 89-110. In this paper, we will consider the account of subject extraction out of `that`-clauses based on the split C strategy (Szczegielniak 1999) and the C-T Agree relation (Pesetsky and Torrego 2001) and point our their problems. According to Pesetsky and Torrego (2001), the C-T Agree relation is morphologically expressed in two ways: by merging `that` or merging the feature content of T (along with Agr) in C. However, we have assumed that if `do` in English is associated with a question, it is not independently attested as the realization of T but the realization of Q in c, serving as the interrogative morpheme. To obtain this argument, we have proposed the Q-feature of C as a property to determine the type of a clause. The Q-feature of C plays a role of distinguishing an interrogative C from a declarative C and can serve as a probe to seek the element with the interrogative morpheme, such as `-ni` in Korean.
        13.
        2002.03 KCI 등재 서비스 종료(열람 제한)
        Ki - y ang Kw on . 2002. Loc ativ e Inv ers ion and EPP . S t ud ie s in M od e rn Gramma r 27, 37- 56 . In this paper, we will analyze locative inversion constructions under the framework of Agree theory in Chomsky (1998, 1999). We face two problems in locative inversion constructions with respect to Agree theory . First, the preposed PP does not agree with the verb. Second, what is the activated element of the preposed PP? To solve these problems, we will suggest that PP in locative inversion be moved not by the synt actic requirement but by the phonological requirement of the functional head. Given this, we may assume that EPP - feature is satisfied not by the syntactic move or merge but by the phonetic realization.
        14.
        2000.12 KCI 등재 서비스 종료(열람 제한)
        Ki-yang Kwon. 2000. Some Notes on the Intervention Effects of Feature Agree. Studies in Modern Grammar 22, 65-85. In this paper, we will canvass the locality effect on movement in the framework of the Agree strategy (Chomsky 1998, 1999). In the framework of the Agree theory of locality effect on movement, Chomsky (1998) proposes the possibility of Defective Intervention Constraints. Following Chomsky (1998), we will suggest that blocking effects on movement are induced not by inherently inactive element but by structurally inactive element. To support our suggestion, we will consider the intervention effect induced by `there`, and the opaque effect of an inherently case marked argument in English, French, and Georgian.
        15.
        1998.12 KCI 등재 서비스 종료(열람 제한)
        Ki-Yang. Kwon. 1998. Free-Rider and Independent Feature Checking. Studies in Modern Grammar 14, 47-61. In this paper, we will suggest that it is not required that when the operation move-F affects a FF, all FFs associated with F move to the target as free riders. Rather, we will assume that only the necessary formal feature of the moved element individually enters into a checking relation with the target that has matching features for a local convergence of derivation, and that the feature checking may hold between individual formal features that have matching features that can enter into checking relations. This suggestion is based on the inverse voice constructions in Bantu, there-construction involving wh-movement and the conjunct associate, and inalienable possession constructions of Japanese.