한국에서 개발된 팽이버섯 균주 Fv 3-6과 일본에서 수집한 팽이버섯 균주 Fv 0-1, Fv 1-5 및 Fv 11-4의 핵형을CHEF gel electrophoresis 방법으로 분석 하였다. 그 결과4종류의 균주 모두 chromosome의 전체 길이가 달랐으며,chromosome의 개수 또는 특정 chromosome의 길이가 다른 것을 확인하였다. 특히 Fv 3-6의 경우에는 다른 3 종의 균주와 비교했을 때 Fv 0-1, Fv 11-4 보다는 2개의chromosome이 더 존재하였고 Fv 1-5 보다는 1개의chromosome이 더 존재하였으며 핵형패턴이 유사한 일본수집 균주들과는 다른 핵형패턴을 나타내었다. 이러한 CHEF gel electrophoresis 방법은 품종간의 차이를 SSR이나 ITS 정보를 이용한 방법보다 더 정확하게 구분할 수있을 것이라고 생각한다.
한국산 은방울꽃의 형태와 핵형의 특징을 분석하고, 분류학적으로 검토하였다. 은방울꽃은 2엽식물이 70%, 1엽 식물이 30%로 출현하였으며, 3엽 식물은 매우 드물었다. 체장은 평균 34.4±4.6cm이고, 장타원형의 잎은 외엽보다 내엽이 좁고 길었다. 은방울꽃의 개화율은 조사된 식물 1,346개체 중에 평균 3.7%에 불과하였다. 화경은 대개 잎의 하부에 있으나, 드물게는 잎의 상부까지 자라기도 하였으며, 5~10개의 꽃이 총상화서를 이루었다.
The karyotype analysis of various Lilium species native to Yun nan, Northeast China, viz., L. sulphureum, L. nepalense var, L. wenshanense, L. nepalense and L. brownie var. were observed through ordinary tablet compressing method. The results indicated that the chromosome number was 2n=2x=24 in all the species studied. The karyotype formula was 2n=2x=24=2m + 6sm (2SAT) + 4st+12t (4SAT) for Lilium sulphureum; 2n=2x=24=2m + 10st (2SAT) + 12t (4SAT) for Lilium nepalense var.; 2n=2x=24=2m + 2sm+8st (6SAT) +12t (2SAT) for Lilium wenshanense; 2n=2x=24=4m (4SAT) + 10st (4SAT) + 10t for Lilium nepalense; 2n=2x=24=2m + 2sm+10st + 10t for Lilium brownii var. The As.K value (the ratio between long arm and total chromosome length) and the ratio of the length of the longest and the shortest chromosome were recorded as 78.25%~83.71% and 1.83~2.18 respectively. The karyotype of all the species was 3B except for L. nepalense which was 3A. Comparatively, the karyotype analysis of Lilium nepalense var. and Lilium nepalense were similar and genetically close to each other. A great diversity in chromosome morphology was existed among different populations or cultivars of the same species. The genetic diversity of different species or populations could be discriminated thru the number and position of different kinds of chromosomes, as well as the difference of satellite number and positions.
xBrassicoraphanus, a new synthetic intergeneric hybrid between Brassica rapa L. ssp. pekinensis and Raphanus sativus L., also locally known as ‘Baemoochae’, is an interesting subject for studying polyploidy and genome plasticity in the family Brassicaceae, but very few genomic and cytogenetic information. Here, we analysed the chromosome complements and pairing of the most fertile lines, BB1 and BB5, using dual-color fluorescence in situ hybridization (FISH) and genomic in situ hybridization (GISH) to check their chromosomal segregation stability. The somatic chromosome complement of B. rapa was confirmed to be 2n=20 (2.8~4.8μm), of R.sativus, 2n=18 (2.0~3.3μm), and of xBrassicoraphanus, 2n=38 (2.2~5.0μm). There were eight, eight, and seventeen metacentric pairs and two, one, and two submetacentric pairs in B. rapa, R. sativus, and xBrassicoraphanus, respectively. Additionally, three, two, and five pairs of 5S rDNA and five, three, and eight pairs of 45S rDNA were observed in B. rapa, R. sativus, and xBrassicoraphanus, respectively. This suggests that both B. rapa (AA) and R. sativus (RR) genomes, particularly the rDNA arrays, co-exist in xBrassicoraphanus (AARR) genome. In meiosis I, nineteen bivalents were most frequent, and GISH analysis showed ten bivalents from the A genome. This study would provide a useful information for further genomic study of xBrassicoraphanus and its improvement as a new promising breeding variety.
Radish, Raphanus sativus L., is an annual vegetable of the family Cruciferae. Radish has RR genome with 18 somatic chromosome numbers (2n=2x=18). Until now, detailed karyotypic analysis is not only constructed only by conventional staining techniques but also other method. Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a powerful molecular cytogenetic technique using chromosomal markers that reveal the positions of specific genes, such as ribosomal DNAs, thereby making it easy to identify individual chromosomes. We have constructed detailed karyotypes of four different local and wild varieties of radish, based on the chromosome arm length and fluorescence in situ hybridization (FISH) with the 45S rDNA and 5S rDNA as probes. As for the karyotype of radish, 9 pairs of chromosomes were extremely small in size with about 1 to 3 um in length at mitotic metaphase having metacentrics or submetacentrics. Three pairs of 45S rDNA signals and two pairs of 5S rDNA signals were observed in four radish species. One pair of 45S rDNA signal was located on terminal region of short arm chromosome, while two pairs were in interstitial region. Two pairs of 5S rDNA signals were located on interstitial region of chromosome. In conclusion, it was feasible to identify the radish by karyotype and physical mapping analyzed using ribosomal DNA.
Conventional staining and fluorescence in situ hybridization (FISH) karyotypes of the non-genetically modified (GM) parental rice line, 'Nakdong' (Oryza sativa L. japonica), and its four GM rice lines, LS28 (event LS30-32-20-1), Cry1Ac1 (event C7-1-9-1), and LS28 × Cry1Ac1 (events L/C1-1-3-1 and L/C1-3-1-1) were analyzed using 5S and 45S rDNAs as probes. Both parental and transgenic lines were diploids (2n=24) with one satellite chromosome pair. The lengths of the prometaphase chromosomes ranged from 1.50 to 6.30 μm. Four submetacentric and eight metacentric pairs comprised the karyotype of 'Nakdong' and its four GM lines. One pair of 5S rDNA signals was detected near the centromeric region of chromosome g in both the parental and transgenic lines. The 45S rDNA signals were detected on the secondary constrictions of the satellite chromosome pair in both the parental and transgenic lines. There was no significant difference in chromosome size, length, and composition between 'Nakdong' and its four GM lines. This research was conducted as a preliminary study for chromosomal detection of transgenes in GM rice lines and would be useful for their breeding programs.
본 실험은 곡류 작물중에서 육종의 소재로써 많은 장점을 지닌 호밀을 Gimsa C-분염법과 FISH기법을 이용하여 구성이질 염색질과 5S와 18S-26S rRNA 유전자의 염색체상의 위치를 확인하고자 본 실험을 수행하였다. 그 결과를 요약하면 아래와 같다.
1. C-분염의 분석 결과 7쌍의 호밀의 염색체 중에서 1, 2, 3과 7번 염색체는 중부염색체 이었고, 4, 5과 6번 염색체는 차중부염색체 이었다. 1번 염색체는 2차 협착부위로 동원체를 지니고
New somatic chromosome numbers and karyotype analyses of 33 medicinal herbs (30 genera, 23 families) in Korea were investigated. The chromosome numbers of 4 taxa, Euryale ferox, Rodgersia podophylla, Cirsium japonicum var. ussurience, Eehinops setifer, showed results that are different from previous reports. Among 33 taxa, 23 taxa were reported for the first time, and karyotype analyses were newly conducted for 2 taxa (Tiarella polyphylla, Crepidiastrum denticulatum) in Korea. In addition, we observed for the first time the new chromosome numbers for 4 taxa distributed evenly over the world (Lindera erythrocarpa, Corylopsis glabrescens var. gotoana, Ardisia crenata, Callicarpa japonica var. luxurians).
헐떡이풀은 다년생 초본으로 중국, 일본, 대만 그리고 한국에 분포한다. 특히 우리나라에서는 울릉도에서만 분포하는데, 천식 치료, 타박상 그리고 청각장애의 치료에 사용된다. 약용작물로써의 높은 가치에도 불구하고 염색체 수를 제외한 다른 세포유전학적인 연구가 거의 이루어지지 않았다. 따라서 핵형분석 뿐만 아니라 bicolor FISH를 통한 5S 와 45S rDNA의 물리적 지도작성에 관한 연구가 수행되었다. 체세포 염색체 수는 2n=2x=14로 염색체의 길이는 1.66~3.50μm 이다. 또한 염색체의 구성은 4쌍의 차중부 염색체(염색체 1, 2, 3, 6)와 2쌍의 차단부 염색체(염색체 5, 7)그리고 1쌍의 단부 염색체(염색체 4)로 확인되었다. 또한 4번 염색체가 부수체 염색체로 관찰되었다. Bicolor-FISH를 통해 각각 1쌍의 5S와 45S rDNA 위치를 확인하였는데, 5S rDNA의 경우 염색체 3번의 동원체 부위에서 확인되었고, 45S rDNA는 염색체 4번의 단완 말단 부위에서 관찰되었다. Bicolor-FISH는 헐떡이풀 염색체상에 rDNA 유전자의 위치 확인에 매우 유용한 정보를 제공하는 기술로 사용되었다.
보호식물이며, 약용식물인 깽깽이풀 (Jeffersonia dubia)을 대상으로 핵형 분석과 McFISH 기법을 이용한 염색체 분석을 수행하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 체세포 염색체 수는 2n=2x=12였으며, 2쌍의 중부 염색체 (염색체 1, 3), 2쌍의 차중부 염색체 (염색체 2, 4) 그리고 2쌍의 차단부 염색체 (염색체 5, 6)로 구분되었고, 염색체의 평균 길이는 1.95~3.50μM이었다. McFISH기법을 이용하여 45S와 5S rDNA의 염색체상의 위치를 확인한 바, 3쌍의 45S rDNA signal은 4번, 5번 그리고 6번 염색체의 단완 말단 부위에서 관찰되었고, 한 쌍의 5S rDNA signal은 2번 염색체의 동원체 부위에서 관찰되었다.
Karyotypes were established in the eight Korean native species of the genus Iris. Chromosome numbers were 2n=50 in I. koreana and 2n=42 in I. uniflora var. carinata and their karyotype formulas were K = 2n = 50 = 14m + 28sm + 8st and K = 2n = 42 = 16m + 26sm, respectively. I. dichotoma and I. pseudoacorus were diploids of 2n=34. However, they showed different karyotype formulas: K = 2n = 34 = 26m + 6sm + 2st in I. dichotoma and K = 2n = 34 = 8m + 24sm + 2st in I. pseudoacorus. I. setosa, and I. pallasii var. chinensis carried the same chromosome numbers of 2n=40, but they showed different patterns of karyotype formula: K = 2n = 40 = 22m + 14sm + 4st in I. setosa and K = 2n = 40 = 26m + 12sm + 2st in I. pallasii var. chinensis. I. sanguinea was a diploid of 2n=28 and the karyotype formula was K = 2n = 28 = 14m + 14sm. I. ensata var. spontanea was a diploid of 2n=24 and the karyotype formula was K = 2n = 24 = 10m + 14sm. Each species showed characteristic chromosome composition with a pair of satellite chromosome except I. koreana with three pairs of satellite chromosomes. The chromosomes of I. dichotoma and I. uniflora were comparatively short, while the chromosomes of I. ensata were remarkably bigger than those of other species. These cytological data will give a useful information for the identification and breeding program of the Iris plants.
개시호 (Bulpleurum longeradiatum)를 대상으로 상염 색법과 FISH기법을 통한 염색체 분석을 통하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 개시호의 체세포 염색체 수는 2n=12이었으며, centromeric index를 전중기 염색체를 이용한 핵형 분석에서 염색체 조성은 3쌍의 중부 염색체 (3번, 4번 및 6번)와 3쌍의 차중부 염색체 (1번, 2번 및 5번)로 구분되었다. 염색체의 길이는 2.55~5.05 μm로, 전체 길이는 18.15 μm로 나타났다. 5S 와 45S rDNA를 탐침으로 FISH를 수행한 결과 4번 염색체의 동원체 부위 에서 한 쌍의 5S rDNA signal이 확인되었고, 2번 염색체의 부수체에서 한 쌍의 45S rDNA signal이 관찰되었다.
약용으로 재배되고 있는 지모의 세포유전학적인 연구인 핵형 분석 결과는 다음과 같다. 지모의 체세포 염색체 수는 2n=22였으며. 외형으로 비교해 보았을 때, 3쌍의 상대적으로 길이가 긴 염색체와 길이가 짧은 8쌍의 염색체로 구별이 되었다. 염색체의 평균 길이는 염색체의 길이는 1.27-3.80 μm로 관찰되었다. Armatio 비교를 통한 핵형 분석에서는 8쌍의 중부 염색체 (염색체 2, 3, 6, 7, 8, 9, 10 및 11), 2쌍의 차중부 염색체 (염색체 4와 5) 그리고 1쌍의 차단부 염색체 (염색체 1)로 구분되었다.