본 연구는 제주지역에서 사육되고 있는 제주 재래돼지기반의 제주흑돈(제주재래돼지 합성돈)에 대하여 산육형질인 등지방 두께, 일당증체량, 90 kg 도달일령에 대한 후보유전자 탐색을 위해 전장유전체 분석을 실시하였고, 유전체 육종가의 정확도 비교를 위해 베이지안 방법(BayesB, BayesC), π(0.00, 0.50, 0.90, 0.99)값과 개체 자신과 후대의 정보만 포함하고 조상의 정보에 대해 정보를 보정한 DEBVexcPA (Deregressed EBV exlude parents average)와 부모 평균을 포함한 DEBVincPA (Deregressed EBV include parents average)의 반응변수를 이용하였다. 산육형질에 대한 전장유전체 분석을 실시한 결과 등지방두께는 KIAA1549 유전자(SSC18 at 11Mb region), 일당증체량과 90 kg 도달일령에서 POLD3(SSC9 at 9Mb region), STX6(SSC9 at 134Mb region) 유전자가 공통적으로 탐색되었다. 유전체의 정확도 범위는 일당증체량 BayesB의 경우 DEBVexcPA와 DEBVincPA에서 각각 0.285~0.305와 0.497~0.510과 BayesC에서 0.287~0.296와 0.499~0.511으로 추정되었다. 90 kg 도달일령은 BayesB에서 DEBVexcPA와 DEBVincPA는 각각 0.284~0.305와 0.497~0.510, BayesC에서는 0.284~0.296와 0.498-0.511로 추정되었다. 특히, 등지방두께의 유전체 정확도가 BayesB방법론의 DEBVincPA에서 0.625로 가장 높게 추정되었다. 제주흑돈의 산육형질에 대한 유전적인 개량 속도를 가속화하기 위해 유전체 선발법을 적용하는데 있어 부모 평균을 포함한 DEBVincPA (Deregressed EBV include parents average)의 반응변수를 이용하는 것이 바람직하다고 판단된다.
본 연구는 한우농가에서 직접 사육되어 도축되어진 한우 거세우 전체의 도축성적 및 혈통자료를 수집하여 한우 암소의 유전능력평가를 위한 유전모수를 추정하고 농가에서 직접적으로 활용 가능한 유전능력 추정을 위한 기초자료로 제공하고자 하였다. 본 연구를 위해 검증된 970,141두의 도축기록으로부터 60,000두 이상의 표현형 표본을 추출하기 위해 전체 4,040농가 중 600농가를 단순임의추출(Simple Random Sampling)하여 선정된 농가의 도축기록을 모두 추출하는 방식으로 10회 반복하여 표본을 생성하였다. 본 연구에서 추정된 도체형질에 대한 유전력은 도체중에서 0.24-0.30, 등심단면적에서 0.24-0.31, 등지방두께에서 0.31-0.39, 근내지방도에서 0.38-0.58로 추정되었으며, 10회 반복 추정된 유전력의 평균값은 도체중, 등심단면적, 등지방두께 및 근내지방도에서 각각 0.28, 0.28, 0.35 및 0.48로 추정되었다. 추정된 결과가 기존에 한우에서 보고된 유전력에 비해 다소 낮게 추정되었으나 실제 농가에서 사육되어 도축된 전체 자료가 표본이 된 만큼 본 연구 결과는 전국단위의 도축자료를 이용한 결과로서 암소개량을 위해 직접적으로 활용 가능한 자료가 될 수 있을 것으로 기대된다.
본 시험은 성 성숙기의 한우 암송아지 18두(14개월령, 평균체중 251kg)를 이용하여 저 수준의 농후사 료 급여에 따른 성장과 번식능력에 미치는 영향을 규명하기 위하여 실시하였다. 공시축은 시판 한우 번 식우용 배합사료를 체중의 0.8%(T1) 및 1.2%(T2)씩 총 30개월(사양시험 20개월, 번식능력시험 10개월) 동안 섭취하였으며, 처리구당 9두를 2우리에 완전임의 배치를 하였다. 본 시험의 사양시험 결과를 한국 가축사양표준의 영양소 요구량과 비교해 볼 때, T1구에서 성장이 제대로 되지 못한 이유는 에너지 보다 는 단백질 섭취부족 때문인 것으로 나타났다. 공시축의 체형변화에서 저 영양수준으로 인하여 영향을 가장 많이 받는 부위는 흉폭과 체장이었으며 특히, 흉폭은 시험시작시보다도 종료시 측정치가 오히려 3.7% 작았다. 난소의 크기는 T1구가 T2구의 약 63%수준밖에 되지 않았으며, 수태율(33.3% : 77.8%)과 송아지의 생시체중(22.5kg : 29.5kg)도 T1구에서 심각하게 저하되었다. 따라서 한우번식우 사양에 있 어서 성성숙기 이후에도 에너지보다는 단백질 공급수준에 의해 사양성적 및 번식능력에 많은 영향을 끼 치는 것으로 나타났다.
The relationship of several candidate genes polymorphisms with breeding values of economic traits were investigated in Korean Native Pigs. Record (2001-2006) of 546 Korean native pigs were obtained from National Institute of Animal Science, Korea having data on average daily gain (ADG), age at 70 kg (D70 kg) and backfat thickness (BF). The data's obtained were analyzed by the DF-REML (Derivative-Free Restricted Maximum Likelihood) program of Boldman using a single-trait animal model to analyse the genetic parameters. The analysis of restriction fragment length polymorphism (RFLP) was conducted on 68 Korean native pigs (KNP) using single nucleotide polymorphism (SNP). Different genotype frequencies of 5 candidate genes such as MC4R, PRKAG3, FABP3, ESR and PRLR3 were observed in KNP. Significant relationship of AA and AB genotype between MC4R polymorphic site and breeding value for average daily gain (ADG, p<0.05) was observed. PRKAG3 polymorphic sites were also found to be significantly related to breeding values for ADG, AA, AB genotype (p<0.05) and also, for Backfat thickness (BF), days to 70 kg and BB genotype (p<0.05). In conclusion, selection method would be more effective if it encompasses significant genotype for performance traits and that would further aid in the selection of seed stock in KNP.
Soybean [Glycine max (L.) Merr.] seed is an important dietary source of protein, oil, carbohydrates, isoflavones, and other nutrients for humans and animals. Raffinose and stachyose are the main antinutritional factors in soybean seed. They are carbohydrates belonging to the raffinose family of oligosaccharides, which are not readily digested in humans and cause flatulence or diarrhea. The genetic reduction of the raffinose and stachyose contents in mature soybean seeds will improve the nutritional value of soybean. The objective of this research was to evaluate agronomic traits with 10 F6 strains selected from breeding populations derived from a cross among seven parents. The contents of raffinose and stachyose in mature seeds were detected by high-performance liquid chromatography. Agronomic traits such as flower color, flowering date, harvesting date, lodging, plant height, seed coat color, hilum color, 100 seed weight, and yield were evaluated. Ten intermediate parents showed low raffinose and stachyose contents. The intermediate parent 883-1 had a small seed size, six intermediate parents (15A1, 15D1, RS-5, RS-33, RS-64, and RS-70) had a medium seed size, and two intermediate parents (14G20 and RS-21) had a large seed size. The intermediate parent RS-21 had a black seed coat and a green cotyledon. Four intermediate parents (883-1, 14G20, RS-5, and RS-21) had elite agronomic traits. The new intermediate parents developed through this study will be used to develop improved soybean cultivars with low contents of raffinose and stachyose.
Genetic resources play a great role in crop breeding because of containing a broad array of useful genes. Currently, the harder are rice breeders trying to develop new rice cultivars with the improved traits, they are more often handicapped by the limited availability of germplasm resources. Thus, a desirable core or heuristic (HS) set of germplasm with maximum genetic diversity can be usefully exploited to breakthrough the present and future challenges of the rice breeding. As such we previously developed the rice HS sets of 166 diverse accessions out of a total 24,368 rice germplasms. Here, we report a large-scale analysis of the patterns of genome-wide genetic variations accumulated in the HS as well as Korean rice over the time. We characterized a total of about 11.8 millions of single nucleotide polymorphisms (SNPs) across the rice genome from resequencing a total of 295 rice genomes including 137 HS and 158 KB rice sets, with an average of approximately 10x depth and > 90% coverage. Using about 460,000 high-quality SNPs (HQSNPs), we specified the population structure, confirming our HS set covers all the rice sub-populations. We further traced the relative nucleotide variabilities of HQSNPs and found the level of the diversity was dynamically changing across the KB genome, which reveals the selection history of KB lines in the past and present. In addition, the results of our genome wide association study (GWAS) suggests that our HS can be also a good reservoir of valuable alleles, pinpointing those alleles underlying the important rice agronomical traits. Overall, the resequencing of our HS set re-illuminates the past, present of the germplasm utilization, which will support the Korean rice breeding in the future.
Arabidopsis thaliana Ca2+/H+ 수송체 유전자인 CAX 1(cation exchanger 1)이 도입된 벼 형질전환체에 대한 연구결과를 요약하면 다음과 같다. Agrobacterium 이용 형질전환 CAX 1 벼 T5 세대를 대상으로 CAX 1밴드가 도입되었음을 확인하였다. 농업적인 특징인 수장, 수수 및 간장은 모품종(일품)과 유사하였으며, 종자의 칼슘 함량도 높았다. 미립의 크기와 천립중은 모품종보다 약간 크나 거의 일치하고, 저온저항성과 도열병에 대한 내병성이 나타났다. T5 세대에서 형질이 안정적으로 발현되면서 모품종과 유사하고 농업적 형질이 우수한 3 계통을 선발하였다. 앞으로 T6 세대에 대한 특성조사를 거쳐 Ca2+ 함량이 안정적으로 높게 유지되는 계통을 선발하여 세대육성하면 칼슘과 관련된 유전자의 내재해성 작물의 기초자료 이용되어 질 수 있을 것으로 사료된다.
This study was carried out to develop a prom ising japonica rice variety resistant to brown planthopper(Bph) through marker-assisted selection(MAS) and backcross breeding methods. 'Milyang 64' which is known as resistant japonica variety to Bph used as a
맥관맥 품종육성을 위한 기초자료를 얻기 위하여 보리 장려품종 16품종을 공시하여 발아관련형질들의 품종간 차이를 구명코자 실험한 결과는 다음과 같다. 1. 물의 양에 따른 발아율 비교에서 대체로 4.5 cc에서 가장 발아율과 발아세가 높았으며, 2. 저장조건 및 물의 양에 따른 발아세, 발아율, PI 및 수감수성의 차이는 품종간 유의성을 보였고, 3. 저장조건 및 물의 양에 따른 발아세, 발아율 및 수감수성간의 상관은 발아세, 발아율, PI들 간에는 정의 상관을 보였고 이들 형질과 수감수성과는 부의 상관을 보였다. 4. 수감수성에 대한 비교에서 피맥<과맥<맥주맥 순으로 큰 차이를 보였으며, 5. 발아세, 발아율, PI 및 수감수성에 대한 유전력은 높아 맥주맥 품종육성을 위한 고려 형질로서 이용할 수 있을 것으로 사료되었다.