The predator-prey interaction in freshwater ecosystems is a crucial area in the ecological study field and one of example to find such interaction is to investigate stomach contents. However, traditional method through visual inspection often induce misidentification, as it depends critically on intactness of physically visible data. In this study, we utilized Next-Generations Sequencing (NGS) technology to test the applicability stomach content analysis and overcome such limitation. NGS was applied to analyze the stomach contents of the Hemibarbus labeo, Tachysurus fulvidraco, and Plecoglossus altivelis collected in the lower part of Nakdong River. As a result, T. fulvidraco had a higher number of Animalia operational taxonomic units (OTUs) intake rate than H. labeo. At the same time, P. altivelis had higher number of Plantae OTUs intake rate than T. fulvidraco and higher Protozoa OTUs intake rate than H. labeo respectively. Therefore, NGS technology application enable to overcome traditional method’s limitation and discover hidden interspecific interaction which can further be used in appropriate habitat assessment.
Gut contents analysis is essential to predict the impact of organisms on food source changes due to variations of the habitat environment. Previous studies of gut content analysis have been conducted using traditional methods, such as visual observation. However, these studies are limited in analyzing food sources because of the digestive process in gut organ. DNA metabarcoding analysis is a useful method to analyze food sources by supplementing these limitations. We sampled marine fish of Pennahia argentata, Larimichthys polyactis, Crangon affinis, Loligo beka and Sepia officinalis from Gwangyang Bay and Yeosu fisheries market for analyzing gut contents by applying DNA metabarcoding analysis. 18S rRNA v9 primer was used for analyzing food source by DNA metabarcoding. Network and two-way clustering analyses characterized the relationship between organisms and food sources. As a result of comparing metabarcoding of gut contents for P. argentata between sampled from Gwangyang Bay and the fisheries market, fish and Copepoda were analyzed as common food sources. In addition, Decapoda and Copepoda were analyzed as common food sources for L. polyactis and C. affinis, respectively. Copepoda was analyzed as the primary food source for L. beka and S. officinalis. These study results demonstrated that gut contents analysis using DNA metabarcoding reflects diverse and detailed information of biological food sources in the aquatic environment. In addition, it will be possible to provide biological information in the gut to identify key food sources by applying it to the research on the food web in the ecosystem.
국제적으로 최근의 세계적인 축산 ICT 개발 추세는 음성, 맥박, 저작수, 호흡수, CCTV 영상인식 등 보다 다양하고 다중적ㆍ통합적인 센서기술을 접목하여 분만, 상해, 질병 감염, 발정, 반추 및 저작 등 가축의 중요한 생명ㆍ생산 활동을 판단하고 조기에 발견하는 연구들이 시도되고 있다. 이에 본 연구는 ICT 기술을 활용하여 농가 생산성 향상 방안의 일환으로 체류형 바이오캡슐 내 pH, 반추위 체온 및 활동성 센서를 활용한 생체정보를 수집하였고 도축등급과의 상관관계 여부를 파악하고자 수행하였다. 시험방법으로는 26개월령의 한우 거세우 10두를 공시하여 5개월간 바이오캡슐 자료들을 수집하였고 이후 도축하여 등급판정성적과의 연관성 여부를 분석하였다. 연구 결과 육량 등급과 관련이 있는 등심단면적, 등지방두께, 도체중과 생체형질인 반추위 pH, 체온 그리고 활동성과는 모두 정(+)의 상관을 보였다. 육질등급과 관련 있는 근내지방도 및 성숙도는 생체형질인 체온에서는 정(+)의 상관을, pH 및 활동성과는 부(-)의 상관을 나타낸 반면에, 조직감에 대하여 체온은 부(-)의 상관을, pH 및 활동성과 는 정(+)의 상관을 보였다. 특히, 활동성과 근내지방도간의 상관계수가 –0.65로 통계적 유의성을 보였는데 (p<0.05), 이러한 결과는 소의 활동성이 낮으면 근내지방도는 높아진다는 것을 제시하여 준다. 반면에 pH와 도체중 간의 상관계수는 0.50으로 나타나 정(+)의 상관을 보였다. 이는 반추위의 pH가 낮아지면 체중도 작아진다는 것으로 분석된다. 본 연구 결과를 확대하여 계절 및 시간대별 생체정보가 도축성적에 미치는 요인에 대하여 추가적인 분석이 필요하며, 이를 근거로 한우 생산성 향상을 위한 생체정보를 활용할 수 있는 정보를 제공해 줄 것으로 판단된다.
The incidence of stomach cancer has been found to be gradually decreasing; however, it remains one of the most frequently occurring malignant cancers in Korea. According to statistics of 2017, stomach cancer is the top cancer in men and the fourth most important cancer in women, necessitating methods for its early detection and treatment. Considerable research in the field of bioinformatics has been conducted in cancer studies, and bioinformatics approaches might help develop methods and models for its early prediction. We aimed to develop a classification method based on deep learning and demonstrate its application to gene expression data obtained from patients with stomach cancer. Data of 60,483 genes from 334 patients with stomach cancer in The Cancer Genome Atlas were evaluated by principal component analysis, heatmaps, and the convolutional neural network (CNN) algorithm. We combined the RNA-seq gene expression data with clinical data, searched candidate genes, and analyzed them using the CNN deep learning algorithm. We performed learning using the sample type and vital status of patients with stomach cancer and verified the results. We obtained an accuracy of 95.96% for sample type and 50.51% for vital status. Despite overfitting owing to the limited number of patients, relatively accurate results for sample type were obtained. This approach can be used to predict the prognosis of stomach cancer, which has many types and underlying causes.
Purpose: The purpose of this study was to understand and describe the experiences of stomach cancer patients in South Korea. Methods: Secondary analysis of qualitative data was designed. The data were analyzed via the Phenomenological Method, using the data of 12 stomach cancer patients, from the original data collected by narrative interviews in 2013. Results: Seven theme clusters emerged from the analysis. Beginning with: ‘Facing Life Threats from Cancer,’ this describes how the participants experience between cancer diagnosis and treatments. ‘Crossing the Boundary between Life and Death’ deals with desperate struggle to overcome medical treatments, such as gastrectomy and chemotherapy, while ‘Adjusting to Weakened Body’ illustrates the continuous daily struggle to follow dietary treatments after operation. ‘Dilemmas in Interpersonal Relationships’ illustrates the sensitivity of relationships from the cancer stigma, with predicaments rising in collective dining situations. ‘Encountering: Hidden Me, Inside Me’ describes changes in values of life and a matured self. ‘Supporters for Hope’ illustrates driving forces to keep hope alive in everyday lives. Lastly, ‘Happiness of Everyday Life Rescued from Misery’ describes how life turned into blessings from cancer after all. Conclusion: The results of this study would help oncology professionals to develop patient-centered cancer survivorship interventions, by understanding and gaining insights about the lived experience of stomach cancer patients.
Dang, jonghae had written five books on chinese medicine, 『Hyeoljeungron』 is his most important work. He wanted to correct the fallacies of the theory of Jang(臟) and Bu(腑) by comparing with chinese and western medicine. He distinguished Bi(脾) from Cheomyuk(甛肉) by comparing the spleen with the pancreas. He recognized Stomach as the warehouse of foods, and explained that Bi took charge of digestion actually. Bi charged the function of Transportation(運化) and Blood-govering(統血) in addition to plain digestion, he wrote. Dang, jonghae regarded the metabolism of the human body as the interaction of Gi(氣), Blood (血), Water(水) and Fire(火). And he explained that Bi adjusted them. He classified Syndrome of Blood(血證) into five sorts of syndrome and presented four kinds of treatment. Especially he took a serious view of the treatment connected with Bi and Stomach. He set up the theory of Bi and Stomach(脾胃論) practically on basis of anatomy, but he didn't assorted the physiology and pathology of each organ clearly. However he proved the importance of Bi and Stomach by treating Syndrome of Blood and provided with the foundation of merging chinese and western medicine.
This morphological study was performed on the stomach of ducks at 6, 12, 18 months after feeding the 6% of sulfur in diet and control fed the same diet without sulfur. After weighting of body of 36 ducks, we sacrificed the ducks and harvested stomach. Then we check the fed materials and the lumen of stomach. H-E, alcian blue - PAS (pH 1.0), and alcian blue - PAS (pH2.5) stains were used to histological and histochemical observation for the mucus The body weights decreased dependent upon the duration of feeding sulfur statistically, however, the stomachs kept their weight except the 18 month fed group. Ulcerative papillae containing caseous necrotic region were conspicuous on the lumen of proventriculus of sulfur-fed ducks. In addition, some lobules of proventricular glands adjacent to the papillae were observed with severe atrophy. mucus secreted from mucous epithelium showed same pattern between control and sulfur-fed ducks, but the ducts of proventricular glands in 12, 18 months groups had nonsulfated mucopolysaccharides. Gizzard had no pathological changes, however, ingested feed were mixed with re-fluxed bile juice from duodenum. Gastric glands in the gizzards of sulfur-fed ducks had increased the number of acidic mucin positive cells as well as surface cells containing PAS positive materials, which were thought to bring the change of matrix that observed with strong purple color. These data suggest that sulfur feeding for long term causes the damage on the proventriculus mucosa and its glands and also the change on the cuticle secreted from giazzard glands. These changes may be related to decrease of body weight.
The southern rough shrimp Trachysalambria curvirostris (Stimpson) was monthly sampled from the coastal area of Yeosu, Korea from June 2000 to May 2001 and its stomach contents were investigated. Mysids and amphipods were the most dominant prey, comprising
Ghost fishing으로 추정되는 유실된 플라스틱 붕장어 통발에 어획된 붕장어의 섭이 상태와 개체의 성장에 대해 조사하기 위하여, 통발 조업선에 어획된 붕장어와 트롤 그물에 어획된 붕장어를 이용하여 비교 분석하였다. 어획된 붕장어의 평균 전장은 연안 통발 조업선과 시험 조업에서 어획된 것이 33.6cm, 트롤 그물에 어획된 것이 48.9cm 그리고 수거된 유실 통발에 어획된 것이 45.6cm이었다. 이러한 체장의 분포는 붕장어가 성장하면서 연안에서 외양으로 나간다는 사실과 일치한다. 위내용물 조사에서 먹이를 섭이하지 못해 위내용물이 전혀 없었던 붕장어의 비율은 통발 조업선 5.0%, 트롤 4.2% 그리고 유실 통발 87.6%로 유실 통발에서 17~20배 높게 나타났다. 먹이로써 어류를 섭이한 붕장어의 비율은 통발 조업선이 98.7%, 트롤이 78.8% 그리고 유실 통발이 63.3%로 나타났으며, 그 외의 먹이 생물은 갑각류와 두족류 등이었다. 순체중과 전장을 이용하여 계산한 비만도는 트롤 어획물이 1.514이고, 유실 통발 어획물이 1.292로서 약 15%의 차이가 있었으며, 이들 자료에 대한 공 분산분석에서 실시한 t검정 결과 5% 유의수준에서 위치의 차이가 있는 것으로 나타났다.
본 연구는 스트레스에 의해 발생하는 위궤양에 대한 Opuntia dillenii Haw.(선인장)의 효과를 관찰하고자 시행되었다. 실험동물로는 Sprague-Dawley계 수컷 흰쥐 48마리를 사용하였며, 대조군(CO)과 3개의 투여군(E-1, E-2, E-3)으로 나누어 1996년 7월 29일부 1996년 8월 25일까지 4주간 실험을 수행하였다. Opuntia dillenii Saw.(선인장)는 1일 1회 경구투여하였으며, 각각 30 mg/kg BW(E-1) 및 120 Mg/kg BW(E-3)의 농도를 투여하였다. 결과느 s다음과 같다. 1. 체육은 전 군에 걸쳐서 고르게 증가되었으며, 특히 실험시작 후 13일째 체중증가량은 대조군에 비하여 Opuntia dillenii Haw.(선인장)를 투여한 실험군 실험군에서 유의한 차이는 관찰되지 않았다. 4. Alcian bule staining을 통한 위점액량 산출 결과 Opuntia dillenii Haw.(선인장)를 투여한 실험군이 대조군에 비해 전 농도에서 점액량이 높게 나타났으며, 실험군 E-1군은 유의하게 높았고(p<0.05), 실험군 E-2의 경우 그 증가가 현저하였다(p<0.01). 이로서 Opuntia dillenii Haw.(선인장)가 위의 점액생성을 촉진시키거나 위에 보호막을 형성함으로서 위궤양 발생저하에 기여하는 것으로 보여진다. 5. shear rate 11.25, 45.0, 90.0 및 225.0 sec^(-1)에서 전혈점도 및 혈장점도를 측정한 결과 모든 shear rate에서 C군>E-3군>E-1군>E-2군의 경향성을 보였다. E-1(30 mg/kg BW)군의 전혈점도는 대조군에 비하여 shear rate 11.25, 45.0 sec^(-1)에서는 매우 유의하게 감소하였고(p<0.01), shear rate 90.0, 225.0 sec^(-1)에서도 유의하게 감소되었다(p<0.05). E-2(60 mg/kg BW)군의 전혈점도는 대조군에 비하여 매우 유의하게 감소하였고(p<0.01). E-3(120 mg/kg BW)군의 전혈점도는 대조군에 비하여 shear rate 11.25 sec^(-1)에서 매우 유의하게 감소되었고 (p<0.01), shear rate 45.0, 225.0 sec^(-1)에서도 유의하게 감소되었다(p<0.5). 동일한 shear rate에서의 혈장점도는, E-1(30 mg/kg BW)군은 대조군에 비해서 shear rate 90.0 sec^(-1)에서 유의하게 감소되었다(p<0.05). E-2(60 mg/kg BW)군의 혈장점도는 대조군에 비해 shear rate 90.0, 225.0 sec^(-1)에서 유의하게 감소되었다(p<0.05). E-3(120 mg/kg BW)군은 대조군에 비해 전 shear rate에서 모두 감소하였으나 유의한 차이는 보이지 않았다. 이러한 결과로부터 Opuntia dillenii Haw.(선인장)가 스트레스하에서 발생하는 위의 미세혈관 협류흐름장애를 개선시켜 위게양 발생저하에 기여하는 것으로 보여진다. 6. 전 실험군의 위를 조사한 결과 출혈을 동바한 궤양이 형성되었음을 관찰할 수 있었다. Opuntia dillenii Haw.(선인장)투여군에서는 대조군에 비해서 궤양의 면적과 깊이가 다소 적은 경향을 나타내었다. 7. 위조직에 대한 병리조직학적 검사를 시행한 결과 Opuntia dillenii Haw.(선인장)을 투여한 실험군에 비하여 대조군의 궤양이 매우 심함을 관찰할 수 있었고, E-2군의 경우 궤양이 경미한 정도였다. 8. 위궤양의 지표로 사용한 pH, 위점액량, 전혈점도, 혈장점도, 조직병리학적소견 등을 종합한 결과, Opuntia dillenii Haw.(선인장)를 투여한 실험군이 대조군에 비해서 항궤양효과가 있는 것으로 나타났으며, 치료양의 2배를 투여한 E-2(60 mg/kg BW)군에서 효과가 가장 뛰어났다.
본 논문에서는 의용영상의 병소부위 특징을 추출하는 알고리즘을 제시하였다. 특징 추출을 위해 위장영상을 입력하여 DCT계수 행렬을 구하였다. DCT계수 행렬은 저주파 영역으로 에너지가 집중되기 때문에 저주파 영역에서 128개의특징 파라미터를 추출하였다. 추출된 특징 파라미터를 이용하여 질환영상과 정상영상을 비교하여 그래프로 나타내었다. 특징 파라미터는 PACS의 차등압축과 CAD를 위한 입력 파라미터로 활용될 수 있을 것이다.