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        1.
        2024.09 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        한반도의 Donacia속에는 2아속에 속하는 6종이 있다(An, 2019). 이 중 Chujo (1941)는 북한 함경북도 웅기에서 채집한 표본을 D. aquatica (Linnaeus, 1758)로 보고하였고, Kimoto and Kawase (1966)는 D. japana로 표기하여 보고하였다. 그리고 Hayashi (2020)는 한국에 기록된 D. japana가 D. aquatica로 오인되었을 수 있다고 밝혔다. 이러한 혼란을 해결하기 위해 본 연구는 한국(포천과 울산)에서 채집한 표본과 D. japana에 대한 기재문, 수컷생식기와 같은 형태적인 부분(Hayashi, 2020), COI 유전자 염기서열을 비교하였다. 그 결과로 한반도에 기록된 D. japana은 D. aquatica로 대체되고, D. japana는 일본 고유종이라고 결론을 내리고자 한다.
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        2.
        2024.06 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        This study investigated the microscopic characteristics and genetic relationships of Ganoderma applanatum fruiting bodies. Basidiospores were brown, ellipsoid, and had one or two large vacuoles and a double wall. The surface of basidiospores was smooth or wrinkled and most had numerous small and shallow holes. The length and width of basidiospores of Ganoderma applanatum isolates GBGA-01, GBGA-02, ASI 50167, ASI 52821, ASI 52822, ASI 52823, and ASI 53399 were on average 7.6×4.8 mm, 7.9×4.6 mm, 7.7×4.9 mm, 8.2×5.3 mm, 7.7×5.0 mm, 8.0×4.9 mm, and 7.9×4.9 mm, respectively. In contrast, the basidiospores of Ganoderma lucidum isolate ASI 7125 were 7.7×5.2 mm. Using the universal ITS1/ITS4 primer set, the ITS region of the isolates were amplified and sequenced. The ITS sequences were very closely related to G. applantum isolate GBGA-01, GBGA-02, ASI 50167, ASI 52821, ASI 52822, ASI 52823 and ASI 53399, but were not the same species. Whereas, G. lucidum isolate ASI 7125 belongs to different group.
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        3.
        2024.06 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        To understand the detrimental effects of triclosan on Java medaka (Oryzias javanicus) embryos, fertilized embryos were exposed to different concentrations (1, 10, 50, 100, 200, 400, 600, 800, and 1,000 μg l-1) of triclosan until hatching. Then, we examined the survival rate and developmental parameters as well as alterations in antioxidant constituents and DNA damage markers. The results showed dose-dependent mortality, hatching delays, and developmental abnormalities in the embryos. Additionally, there were significant increases in oxidative stress parameters and antioxidant responses, along with elevated DNA damage. These findings suggest that sublethal concentrations of triclosan induce toxic effects through oxidative stress on Java medaka embryos, as evidenced by changes in in vivo parameters and biochemical constituents.
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        4.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        This research introduces the subfamily Catotrichinae to the South Korean fauna for the first time. Within the globally recognized 6,651 Cecidomyiidae species, only ten are categorized under the Catotrichinae subfamily. Notably, this subfamily, which ingests fungi during larval development, is among the most primordial lineages of the Cecidomyiidae, both in morphological and molecular terms. The species Catoricha nipponensis of Catotrichinae was newly observed in Yeongwol, Gangwon-do, in October 2021. It was recorded for the first time in Korea, with its holotype initially collected in Honshu, Japan, in November 1923. This study provides the diagnosis, photographs of distinguishing characteristics, and the DNA barcode sequences for Catotricha nipponensis. This work was supported by a grant from the National Institute of Biological Resources (NIBR), funded by the Ministry of Environment (MOE) of the Republic of Korea.
        5.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        줄수염나방아과는 나비목 중에서 가장 큰 분류군 중 하나인 밤나방과에 속한다. 분류군 내에서 날개무늬가 비슷한 경우가 있어 동정에 어려움이 많은 그룹 중 하나이다. 또한, 이 들은 산림 지역, 초지 및 물가 등 다양한 환경에 서식하며, 생활 습성에 따라 일부는 임업 및 농업에 피해가 큰 해충으로 알려져 있는 중요한 경제곤충 그룹이라 할 수 있다. 본 연구는 이와 같이 분류동정이 어려운 줄수염나방아과 곤충을 대상으로 야외채집조사, 표본제작, 생식기 해부검경 및 DNA 바코드 등을 수행하여 최종적으로 분류학적 동정지침서를 작성하고자 수행 되었다. 연구결과 19속 63종으로 정리되었다. 본 연구를 통해 확보된 DNA바코드 데이터는 정확한 바코드를 활용한 진단 및 동정 연구 등에 활용되고, 이들의 분포정보 구축, 형태적 특징 및 분자분석 연구의 기초데이터 확보를 통한 관련 분야 활성화 등에도 기여할 수 있을 것으로 기대된다.
        6.
        2024.04 구독 인증기관·개인회원 무료
        국내에서 유통되는 한약재 오공(蜈蚣)의 정·위품 유통 현황 파악과 유전자 감별법 개발을 위해 서로 다른 6개 유통사에서 오공으로 판매중인 전형약재를 구매하여 각 약재 포장 단위별 크기, 색깔, 무늬 등 형태적으로 차이가 있는 개체를 분류하여 국내에서 채집된 왕지네 표본 2개체를 포함 총 30개 시료를 대상으로 DNA 바코드 분석을 실시하였다. 확보한 미토콘드리아 COI 염기서열 정보와 기 등재된 NCBI GenBank 염기서열 정보를 이용하여 계통 분석을 실시한 결과, 28개 약재 시료 중 국산 및 중국산 전형약재 유통품 13 개체는 모두 대한민국약전외한약 (생약)규격집에 정품 기원종으로 수재된 Scolopendra subspinipes mutilans로 확인되었으며, 이들은 국내 채집 왕지네 개체들과 함께 하나의 단계통군을 형성하였다. 하지만 인도네시아산 전형약재 유통품 15 개체의 경우 4개의 그룹으로 구분되었는데, 그 중 3개 그룹은 S. dehaani, S. subspinipes, 그리고 명확한 종을 알 수 없는 Scolopendra sp.로 Scolopendra 속으로 확인되었고 나머지 그룹을 형성하는 한 개체는 Scolopendra 속에 속하지 않고 Rhysida singaporiensis와 89%의 유사도를 보였다. COI 바코드 분석을 통해 국내 유통되는 오공은 원산지가 한국 또는 중국인 경우 모두 정품 기원종으로 확인되었으며, 원산지가 인도네시아인 경우에는 모두 위품인 것으 로 확인되었다. 또한 위품으로 확인된 유통약재는 총 4개의 종으로 분류되었고, 대부분은 정품인 Scolopendra속 의 분류군이었으며 Rhysida속과 가까운 분류군도 오공으로 수입되어 유통되고 있는 것으로 확인되었다.
        7.
        2023.12 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        River estuaries are dynamic and productive ecosystems with high regional biodiversity. Environmental DNA (eDNA) has become a useful approach to assessing biodiversity in aquatic ecosystems. This study was conducted to investigate fish community characteristics and species diversity in two river estuary ecosystems, the Taehwa River and Changwon Stream. We further compared conventional and eDNA metabarcoding analyses of the fish communities. The conventional survey was performed in May, July, and October 2022, while the eDNA analysis was conducted only in May. We observed various fish species with different life histories, including carp, goby, and marine fish. We also found that migratory fish, such as dace Tribolodon hakonensis, sweetfish Plecoglossus altivelis, and eel Auguilla japonica, occurred in the Taehwa River, suggesting high river connectivity. Marine fish species were predominant in the Changwon Stream, as this river is located close to the sea. The diversity indices showed that the Taehwa River generally had higher species richness, evenness, and diversity values than the Changwon Stream. A total of 9-19 species were detected in the conventional survey for the three sites, whereas 11-18 species were found from eDNA analysis. The findings indicate that the sensitivity of eDNA was similar to or higher than that of the conventional method. Our study findings suggest the efficiency and efficacy of eDNA-based fish community monitoring, although with some shortcomings in applying the genetic marker to Korean fish, including no clear-cut distinction for Korean endemic species and/or genetically closely related species groups.
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        8.
        2023.12 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        eDNA (environmental DNA)란 특정 환경에 서식하는 생물로부터 유래한 DNA를 의미한다. 환경 시료로부터 추출한 eDNA를 활용하면 해당 환경에 서식하는 생물들의 효율적이고 정확한 모 니터링을 수행할 수 있다. 해수 시료로부터 얻은 eDNA를 기반으로 해양생물 다양성 연구를 수행할 수 있다. 해수 시료를 채집하고 이로부터 eDNA를 추출한 뒤, metagenome 분석을 통 해 서식하는 해양생물의 종 동정과 다양성 분석이 가능하다. 본 리뷰에서는 이처럼 해수의 eDNA를 활용하여 해양 지역의 생물 다양성 연구를 수행하는 전체적인 과정을 제시하고 있다. 아직 국내에는 해양생물 다양성 연구를 위해 eDNA를 적용하는 방법이 보편화 되어있지 않으 며, 본 리뷰를 기반으로 이와 같은 eDNA 연구 방법을 정립하는데 도움을 줄 수 있을 것이다.
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        9.
        2023.10 구독 인증기관·개인회원 무료
        The family Crambidae, so called as Grass moths, have been known as a difficult group in identification due to their similar wing patterns among the allied species. Some species are well known as pests to the agricultural and ornamental plants of economic importance. Therefore, this study was carried out to provide the DNA barcode and related information for distinguishing the complex species among Crambidae. In this study, we extracted and analyzed the DNA barcodes from 185 specimens of 76 species in the family Crambidae. Based on the result, one species of the genus Schoenobius, Pagyda, Neoanalthes, Palpita, Ecpyrrhorrhoe and Paratalanta area reported for the first time from Korea.
        10.
        2023.10 구독 인증기관·개인회원 무료
        As a result of our taxonomic study of the genus Epistrophe (Walker) in Korea, we recognized a total of 16 species including seven putative new species (code names are temporarily given from A to F). We also conducted a DNA barcoding analysis of 25 nominal species and 130 samples of Epistrophe. In our barcoding analysis, despite insufficient bootstrap support, Epistrophe formed a cluster with two genera, Epistrophella and Leucozona, topologically supporting their close relationships. Our analysis also showed some interesting results worthy of attention: First, at least two distinct cryptic species were found within the E. grossulariae cluster. Second, the taxon identified as E. nitidicollis seems to represent at least three distinct species. Third, three BOLD-deposited European samples listed as E. olgae showed almost identical barcode sequences with the European E. nitidicollis.
        13.
        2023.06 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        본 연구에서는 수산물 시료 중 Salmonella spp. 검출을 위해 단시간의 전배양(2시간 이내)과 탈염과정을 포함한 DNA 추출법을 사용하여 분자생물학적 검출을 위한 수산 물 전처리 방법에 대해 연구하였다. 배양 시간에 따른 증 균 효율을 탐색하기 위해 100, 101 및 102 CFU/mL농도 의 Salmonella spp. 5종을 NB 0.5에 접종하여 증균 전, 1시간 및 2시간 동안의 증균 효율을 비교하였다. 그 결 과, 2시간 동안 모든 농도에서 약 1 log CFU/mL가 증균 되어 초기 농도와 유의적인 차이가 나타났다. 또한 지역 별 패류시료에 S. Typhimurium을 인위적으로 감염시킨 뒤 DNA를 추출하여 염농도를 측정한 결과, 모든 시료의 염농도가 0%로 DNA 추출과 동시에 탈염이 이루어진 것 을 확인하였다. 이후 추출한 DNA를 사용하여 PCR을 수 행한 결과 모든 시료에서 S. Typhimurium의 특이적 양성 밴드가 확인되었다. 다음으로 수산물 시료 중 Salmonella spp. 검출을 위한 증균 과정과 탈염을 포함한 DNA 추출 방법의 검증을 위해 멸균 홍합시료 및 비멸균 홍합시료 에 Salmonella spp. 5종을 인공적으로 약 100, 101, 102 CFU/g의 농도로 오염시켜 전배양과 DNA를 추출하여 PCR로 특이적 증폭 밴드의 여부를 확인한 결과, 모든 농 도의 Salmonella spp. 5종에서 특이적 밴드가 확인되었다 . 결과적으로 본 연구에서 제시한 전배양 및 DNA 추출 방법을 포함한 전처리 방법과 PCR을 사용하여 수산물 시 료에서 10 CFU/g 미만의 Salmonella spp.를 검출하였으 며, 시간과 비용면에서 효율적이며 과정이 복잡하기 않기 때문에 수산물의 처리 현장에 활용될 수 있을 것으로 기 대된다.
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        14.
        2023.06 KCI 등재 구독 인증기관 무료, 개인회원 유료
        본 연구에서는 남극 로스해 연안에 서식하는 아델리펭귄(Pygoscelis adeliae)과 황제펭귄 (Aptenodytes forsteri)의 분변 시료를 기반으로 펭귄 장내 미생물 메타지놈 연구를 수행하였 다. Taxonomy 분석 결과, 아델리펭귄과 황제펭귄의 장내 미생물에는 주로 7개의 문(phylum), 18개의 과(family)가 존재하는 것으로 나타났다. 또한 미생물 다양성을 평가하기 위해 Alpha diversity 및 OTU abundance 분석을 수행한 결과, 전반적으로 아델리펭귄의 장내 미생물 다양 성이 황제펭귄보다 높은 것을 확인하였고, PCoA를 기반으로 한 Beta diversity 분석을 통해 두 개체군 간 장내 미생물 군집에 차이가 존재함을 확인하였다. PICRUSt를 활용한 기능적인 차원의 KEGG pathway 분석을 통해서는 아델리펭귄과 황제펭귄 시료에서 nucleoside and nucleotide biosynthesis pathway가 가장 많이 존재하는 것을 확인하였다. 본 연구를 통해 남극 아델리펭귄과 황제펭귄의 장내미생물 구성과 다양성을 비교분석 할 수 있었다. 본 연구 결과 는 향후 펭귄의 먹이 섭식 관련 연구에 활용될 수 있으며, 더 나아가 다양한 남극 생물의 장내 미생물 메타지놈 분석에 대한 기초가 될 수 있을 것이다.
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        15.
        2023.05 구독 인증기관·개인회원 무료
        Electricity generation using nuclear power has various advantages, such as carbon reduction, but the treatment of nuclear waste is emerging as a big issue in many countries. The development of technology that can selectively remove radionuclides from liquid radioactive waste is one of the ways to reduce nuclear waste. Here, we assessed a new way of removing radioactive cobalt from a liquid using an aptamer. Aptamers specifically binding cobalt ions were selected through systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX). Their binding strength and stability of their complexes with cobalt were analyzed through surface plasmon resonance assay and 2D program Mfold, respectively. The optimal aptamer/bead conjugate conditions for binding cobalt were established using a FA-C1 aptamer with the strongest binding to cobalt. Under these conditions, more than 80% of radioactive cobalt was removed, and more than 99.95% of removed cobalt was recovered. These results proved that radioactive cobalt removal using this aptamer can effectively reduce liquid radioactive waste. This means that the aptamer/bead complex can be utilized to remove various radioactive metal ions.
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