This study evaluated genetic parameters of direct and maternal effects for calving ease in Hanwoo. A total of 2,102 records for calving ease were collected from 2018 to 2020 from the Hanwoo Genetic Improvement Center in Korea. The calving ease score was rated from 1 to 4 (1=unassisted delivery, 2=assisted easy calving, 3=assisted difficult calving, 4=mechanical or caesarean section) as categorical data, and the data were converted using a truncated normal distribution for linear model analysis. To evaluate the genetic parameters, the birth year-season of calving, the sex of the calf, parity, and the age of the dam at calving were considered as fixed effects, and genetic and maternal effects were considered random effects. The genetic parameters were evaluated using the program BLUPF90. The calving ease scores for male calves, first parity cows, and currently calving cows were much higher than for females, later parities, and past calving cows. The direct genetic variance (0.0164) was higher than the maternal genetic variance (0.0018), and the estimated heritabilities of the direct and maternal effects were 0.055 and 0.006, respectively. The parameters determined here should help with the genetic evaluation of calving ease in Hanwoo.
본 연구는 한우 경락가격과 지육가격에 대한 각 형질별 기여도를 알아보기 위해 한국종축개량협회에 등록되고 축산물품질평가원에서 등급판정 결과 및 경락가격이 있는 한우 거세우 166,918두의 자료를 이 용하여 분석하였으며, 이를 통해 향후 한우산업 발전의 도움이 되는 자료로 활용하고자 실시하였다. 한 우 거세우의 경락가격에 대한 도체중, 배최장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도의 준부분상관자승값 은 각각 0.001, 0.010, 0.031 및 0.435로 나타났고 지육가격에 대한 준부분상관자승값은 각각 0.153, 0.007, 0.021 및 0.274로 나타났다. 이를 바탕으로 경락가격에 따른 도체중, 배최장근단면적, 등지방두 께 및 근내지방도의 기여도는 각각 0.17%, 2.02%, 6.52% 및 91.30%로 나타났으며 지육가격에 따른 기 여도는 각각 33.54%, 1.54%, 4.69% 및 60.23%로 나타났다. 따라서 이러한 경락가격과 지육가격에 대 한 각 형질별 분석 결과를 바탕으로 향후 개량방향 설정에 반영하고 우수한 품질의 고급육 생산으로 국 가경쟁력을 강화해야 할 것으로 사료된다.
본 연구에서는 현재 국가단위 개량체계에서 이용하는 도체형질 및 12개월령 체중과 부분육간의 유전 모수추정을 통하여 각 형질별 상관관계를 조사하였다. 분석에 이용된 형질은 1996년도부터 2013년까지 당·후대 검정한 한우 수소 및 거세우 총 10,351두의 부분육 중량 및 수율, 도체형질 그리고 12개월령 체중측정 자료이다. 유전모수 추정을 위하여 부분육 형질에는 차수, 검정지, 도축일의 고정효과와 도체 중을 공변량으로 포함하였으며, 도체형질은 동일한 고정효과에 도축일령을 공변량으로 하였다. 유전모 수 추정 결과 부분육 수율(%)의 유전력은 안심, 등심 및 채끝이 각각 0.53, 0.58 및 0.65였다. 등심수 율은 12개월령 체중, 도체중, 등심단면적, 등지방두께 그리고 근내지방도와 유전상관이 각각 0.13, 0.15, 0.61, -0.44 그리고 0.37이었다. 따라서 등심단면적이 크면 10가지 대분할육 중 경제적가치가 가장 높은 형질인 등심의 비율이 증가 할 것으로 사료되며, 도체의 육질을 결정하는데 주요한 형질인 근내지방도의 등급도 다소 높아질 것으로 사료된다.
The objective of this study was to identify the phenotypic relationships among calving difficulty, calf birth weight and gestation length of Holstein dairy cattle under the environment of Korea. A total of 1,834 calving records collected by Dairy Science Division of National Institute of Animal Science, RDA from 2000 to 2014 was analyzed. General linear multivariate models for calving difficulty scores (CD: 1=no assistance, 2=minor assistance, 3=two to three persons assisted, 4=more than three persons assisted, 5=cesarean section), calf body weight at birth (BW), and gestation length (GL) included fixed effects of year and season (spring, summer, autumn, winter) of births (YS), sex of calves, and parity. For GL and BW, all three fixed effects (YS, sex of calves, parity) were significant (p<0.05). For CD, the effects of YS and sex of calves were significant (p<0.05). Bull calves were born with heavier BW by 3.18 kg, with greater CD by 0.18 point and with longer GL by 0.6 days than heifer calves. The least squares mean of BW was the heaviest at the third parity (44.1 kg) compared to those at the first, the second and the fourth parities or later (41.3-41.9 kg). The least squares mean CD at the first parity was 1.74 point, which was higher than CD at the second and later parities (about 1.68 points). Phenotypic correlation (partial residual correlation) between GL and BW was 0.36. But those between GL and CD and between BW and CD were -0.03 and 0.04, almost zeros. To conclude, we observed higher incidence of calving difficulty in the first calving than in the later ones. Further investigation on the relationships between calf’s birth weight and calving difficulty is needed
본 연구는 한우 능력검정체계에 이용되는 선발형질에 따른 부분육 중량 및 수율의 간접선발반응을 파 악하고 부분육 형질을 선발형질로 포함하였을 경우 선호부위의 유전적 개량량 변화를 파악하기 위하여 시뮬레이션 프로그램인 ZPLAN+를 이용하였다. 분석에 이용한 자료는 1996년도부터 2013년까지 농협 중앙회 한우개량사업소, 도 축산연구센터, 국립축산과학원, 한우육종농가에서 당·후대 검정한 한우 수 소 및 거세우 총 10,351두의 자료를 이용하였다. 그 결과 후보 및 보증씨수소 선발가중치와 동일조건 하에서 등심단면적의 가중치를 각각 1, 3, 6으로 하였을 때 등심수율의 연간 유전적 개량량은 각각 0.222%, 0.282%, 0.328%로 증가하는 결과를 보였다. 현재 선발가중치와 동일한 조건에서 부분육 형질 을 선발형질로 포함하여 등심수율에만 가중치를 주었을 경우 갈비, 채끝수율은 등심수율과 함께 증가하 는 것으로 나타났으나 안심수율의 연간 유전적 개량량의 변화는 미미하였다. 또한 안심, 등심, 채끝 등 의 선호부위에 8가지의 경우의 수(가중치: 1 또는 2)로 그룹별 가중치를 주었을 경우, 가중치가 각각 2:2:2인 그룹에서 선호부위의 연간 유전적 개량량이 가장 높았다. 따라서 선호되는 부위의 생산량 증대 를 위해서는 이들 부위에 상대적으로 높은 가중치를 동일하게 적용하는 것이 한우의 선발에 효과적인 방법이라 사료된다.
두 개의 형질 사이에 유전상관이 존재하면 제 1의 형질을 선발함으로써 다른 중요한 형질의 간접선발도 가능해 진다. 따라서 부분육 형질 중 선호도가 높은 안심과 등심에 대한 생산량 증대를 위해서 생체 상태에서 부분육과 상관도가 높은 체형형질을 발굴하여 개량함으로써 고가이며 선호도가 높은 안심과 등심 등의 생산량을 높일 수 있을 것이라 사료된다. 분석에 이용한 데이터는 1998~2012년도에(23~53차) 후대검정한 5,001두의 후대검정우 자료이며 조사형질로는 대분할육 10개의 형질과 18개월령 체형형질을 이용하였다. 유전모수 추정은 WOMBAT 6.0 software package를 이용하여 실시하였다. 분석에 이용된 모형은 부분육 중량의 경우 도축일을 범주형 변량으로 도축 전 생체중을 공변량으로 하였으며 체형형질의 경우에는 차수, 출생지 및 검정소를 범주형 변량으로 측정일령을 공변량으로 하였다. 분석 결과 안심, 등심 및 갈비중량의 유전력은 각각 0.53, 0.50 및 0.14로 나타났다. 등심과 안심은 체고, 십자부고 및 곤폭과 유전상관이(0.34~0.53) 비교적 높게 나타났으므로 이러한 체형형질을 간접선발 함으로써 선호되는 부위의 생산량을 늘릴 수 있을 것이라 사료된다.
The objective of this study was to estimate genetic parameters for 18 linear conformation traits and overall conformation score in Holstein cattle. A total of 376,606 records for type traits were collected from 2001 to 2011 from Korea Animal Improvement Association. The model of estimation of variance components and correlations among lactations using VCE included both fixed effects (herd-year-season and stage of lactation parity-wise) and random effect (animal additive genetic). The estimated heritabilities (h2) for capacity class, such as stature, chest width, body depth, angularity, and body condition score were 0.32, 0.16, 0.27, 0.12, and 0.19, respectively. Rump angle and width from rump class also showed h2 of 0.31 and 0.17, respectively. The heritabilities in udder class were mostly low to medium; in which traits were fore udder attachment (0.13), rear udder height (0.17), udder support (0.11), udder depth (0.33), front teat placement (0.17), front teat length (0.21), and rear teat placement (0.21). For feet and legs composite class, the estimated heritabilities for rear leg set, foot angle, rear leg rear view, and locomotion were 0.12, 0.07, 0.08, and 0.03, respectively. The h2 estimated for overall conformation score was 0.16 in the study. The genetic and environmental variance components estimated from this study would be helpful to change from single lactation animal models to multiple lactation animal models in the national genetic evaluation system for the improvement of linear type traits. Moreover, The breeding values obtained using these variance components would be able to be used in the calculation of Korean type production index (KTPI), udder composite (UDC) and, feet and legs composite (FLC).
본 연구는 한우암소검정사업을 통하여 수집된 자료를 이용하여 한우 집단의 근교계수 및 혈통구조를 분석함으로써 한우 집단의 유전적 다양성 정도를 알아보고자 실시하였다. 한우 암소 데이터는 9개 도에서 2000년부터 2012년에 출생한 228,177두에 대한 정보 및 이들과 혈연관계가 있는 440,429두에 대한 혈통정보를 이용하여 분석하였다. 각 지역별 평균 근교계수는 강원도 0.63%, 경기도 0.46%, 경상남도 0.49%, 경상북도 0.48%, 전라남도 0.71%, 전라북도 0.51%, 충청남도 0.40%, 충청북도 0.61%, 제주도 0.55%로 나타났으며, 선조 3세대까지의 조상을 알고 있는 개체의 비율은 동일한 지역에서 각각 80.0%, 79.3%, 75.5%, 76.8%, 77.3%, 71.6%, 75.4%, 79.3% 및 73.3%였다. 또한 아비에서 딸소까지 평균 세대간격은 7.63년으로 나타났으며, 어미에서 딸소까지 평균세대간격은 4.11년으로 나타났다. 근교계수 및 세대간격의 정보를 이용하여 유효집단의 크기를 추정한 결과 2000년생부터 2005년생까지가 215두, 2006년생부터 2010년생까지가 140두, 2011년생부터 2012년생까지가 77두로 추정되어 시간이 지남에 따라 유효집단의 크기가 감소는 것으로 추정되었다. 따라서 한우 집단의 근교율을 감소시키면서 유전적 개량량을 극대화 할 수 있는 한우 암소 맞춤형 교배 전략 및 모니터링 시스템이 필요할 것으로 사료된다.
본 연구는 젖소 종모우 973두의 국내 추정 육종가, 국제유전능력평가에 의한 육종가 그리고 MACE proof를 이용한 DRP를 비교하여 종모우 선발의 정확도 향상을 위한 방안을 제시하기 위하여 수행하였다. Interbull의 국제유전능력평가는 유량 형질 기준으로 32개국 31개 집단과 총 134,533두의 종모우가 참여하는 것으로 조사되었다. 국내 추정 육종가와 interbull 추정 육종가 상관계수는 0.925로 나타났으며, 육종가에 대한 산지별 상관은 캐나다, 미국 및 국산에서 각각 0.917, 0.910과 0.996으로 나타났다. 충분한 딸소 수를 보유하여 신뢰도가 높은 경우에는 국내산이나 수입산 모든 종모우에서 신뢰도의 변화량이 크지 않으나, 국내에서는 EDC가 낮지만 해외 자료에서 EDC가 높은 경우 43까지 신뢰도가 증가하였다. 973두 종모우들의 경우 신뢰도의 평균은 87.16±10.62이며, 51~99의 범위를 나타내었으며, deregressed MACE proof와 MACE proof의 상관계수는 0.945로 높게 나타났다.
The objectives of this study were to estimate genetic parameters for 10 linear conformation traits and final score in Hanwoo cows. A total of 53,277 records for type traits of Hanwoo cows were collected from 2008 to 2012 from Korea Animal Improvement Association. Ten linear traits studied were stature, body length, chest depth, body rump angle, rump length, pin bone width, udder volume, foot angle, rear legs side view, and rear legs rear view. The model included the fixed effects of herd-year-classifier, age at measurement and age after calving, the random animal additive genetic effect and residual effect. Heritability estimates for linear type traits were ranged from 0.003 for rear legs side view to 0.213 for final score. Genetic correlations among linear type traits were ranged from -0.068 (for rear legs side view and rear legs rear view) to 0.982 (for body length and rump length). The final score was found to be in a strongest genetic correlation with rear legs rear view (0.947), followed by pin bone width (0.918), body length (0.887), rump length (0.883), chest depth (0.883), udder volume (0.811), stature (0.802), rump angle (0.637), foot angle (0.519) and rear legs side view (0.176). Corresponding phenotypic correlations for pairs of linear type traits were mostly similar in direction, but smaller than the genetic correlations.
The objective of this study was to estimate genetic parameters on days to 90 kg body weight and ultrasound measured traits (back fat thickness, eye muscle area, retail cut percentage) and predict genetic progress when the weights for selection on the paternal traits of Duroc, which can be incorporated into sire line selection indexes. A simulation program, ZPLAN+, was used for the simulation. Genetic parameters of days to 90 kg body weight (D90KG), back fat thickness (BFT), eye muscle area (EMA) and retail cut percentage (RCP) used in the simulation were estimated from 27,972 heads of farm tested Duroc pigs from 2005 to July, 2012. Parameters of simulation used genetic parameters with parturition rates, ratios of test pigs and replacement rates that were dependent on selection protocols of simulated farms. Different weights of selection for traits of days to 90 kg and backfat thickness were compared. Estimates of heritability were 0.406, 0.355, 0.159 and 0.379 for D90KG, BFT, EMA and RCP, respectively. Genetic correlation of D90KG with BFT, EMA and RCP were –0.043, 0.049 and 0.021, respectively. Genetic correlation of BFT with EMA and RCP were –0.394 and –0.937. And genetic correlation between EMA with RCP were 0.524. Simulation result showed that index weight of 3:1 on D90KG and BFT was effective to shorten days to 90 kg without any significant changes in backfat thickness. Generally the genetic changes were greater as parturition rate and ratios of test pigs increased. Increase in replacement rate had a small effect on genetic changes in negative way. Thus, we recommend that index weight of 3:1 on days to 90 kg and backfat thickness could be utilized for sire line selection.
본 연구는 가상의 국내 젖소유전체 데이터를 생성하여 통계분석방법별, 유전력의 크기별, 참조집단 크기에 따라 유전평가의 정확도 변화에 대해 알아보고자 연구를 실시하였다. 모의실험 데이터 생성은 QMSim프로그램을 이용하였으며, 유전력의 크기(0.1, 0.3, 0.5) 및 참조집단의 크기를(420두, 630두, 1,050두) 달리하여 총 9가지 형태의 데이터를 생성하였고 각 형태별 10회 반복 모의실험을 수행하였다. 통계분석방법간 육종가 정확도 비교 결과 표현형정보, 혈통정보 및 유전체 정보를 모두 이용하여 개체의 유전능력을 평가하는 GBLUP이 유전체 정보 없이 분석하는 BLUP방법에 비해 육종가 정확도가 높게 나타났으며, 특히 자신의 표현형 정보를 갖지 않는 검정집단축군에서 통계분석방법간 육종가 정확도의 편차가 크게 나타났다. 검정형질의 유전력에 대한 크기별 육종가 정확도를 비교한 결과 BLUP과 GBLUP에서 모두 유전력이 높을수록 육종가 정확도가 높게 나타났다. 또한 참조집단크기별 육종가 정확도를 비교한 결과 참조집단축군에서 참조집단크기별 차이가 크게 나타나지 않는(0.02 - 0.03) 반면 검정집단축군의 경우 참조집단크기별 육종가 정확도는 0.02 - 0.10로 표현형 정보가 없을 경우 참조집단 크기에 더 크게 영향을 받는 것으로 나타났다. 본 연구결과를 통해 얻어진 결과는 젖소 유전체 선발을 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.
본 연구는 농촌진흥청 국립축산과학원에서 사육중인 제주재래돼지와 랜드레이스의 상호교차교배를 통해 생산된 417두의 F2집단을 대상으로 성장형질(생시체중, 3주령 체중, 10주령 체중, 20주령 체중)을 측정하고, 개체별 혈액으로부터 Illumina Porcine SNP 60k BeadChip을 이용하여 유전자형 분석을 실시하여 성장형질과 유전체 전장의 단일염기다형의 유전자형 간에 연관성을 알아보았다. 단일연기다형의 유전자형 분석은 돼지의 성염색체를 제외한 18개의 상염색체 내에 나타난 52,574개의 SNP표지인자 중다형성이 나타나지 않은 7,564개의 표지인자, 모든 개체에서 이형으로 나타난 47개 표지인자 및 결측률이 10 % 이상인 1,830개의 표지인자가 나타나 분석에 앞서 사전 제거를 실시하였으며, 남은 44,133개의 표지인자를 체중형질과 표지인자간 연관성 분석하는데 이용하였다. 체중에 영향하는 고정효과에 대해 일반선형모형을 설정하여 사전 보정을 실시하였으며, 여기서 얻어진 잔차값을 이용하여 표지인자와 월령별 체중간의 연관성 분석을 실시하였다. 분석결과 전장의 유전체 정보 중 통계적 판단의 오류를 고려하여 연관성이 강한(p <10-6)표지인자가 생시(BWB), 3주령(BW3), 10주령(BW10) 및 20주령(BW20) 체중에서 각각 657개, 846개, 49개, 122개로 추정되었다. 생시와 3주령 체중에 공통으로 유의적 영향을 하는 표지인자가 286개로 나타났으며, BWB와 BW10에서 5개, BWB와 BW20에서 8개, BW3와 BW10에서 13개, BW3과 BW20에서 11개, BW10과 BW20에서 1개로 나타났다. 또한 염색체별 성장형질에 영향하는 표지인자의 분포를 조사한 결과, 주령별 체중에 영향하는 표지인자는 전장의 유전체에 고르게 분포하는 것으로 조사되었으며, 특히 생시 및 3주령 체중에 영향하는 표지인자는 특정 염색체(SSC9)에서 고도의 통계적 유의차(p <10-15)를 나타내는 유전자 좌위가 있는 것으로 추정되었다.
본 연구는 2004년부터 2011년까지 한국종축개량협회에서 듀록 품종에 대하여 수집된 40,657두의 검정기록 및 이들과 혈연관계가 있는 47,974의 가계혈통정보를 이용하여 산육형질에 대한 유전모수를 알아보고자 연구를 실시하였다. 듀록의 산육형질에 대한 유전모수 추정은 고정효과로써 성, 동기우 그룹, 산차 및 검정종료시 개체나이(공변이), 임의효과로써 개체의 상가적 유전효과 및 잔차효과를 포함한 혼합모형방정식을 구성하였으며, 분석은 리눅스 기반의 REMLf90 프로그램을 이용하여 다형질 분석을 실시하였다. 유전력은 90 kg 도달일령, 일당증체량, 등지방두께 및 등심단면적에서 각각 0.334, 0.340, 0.335 및 0.200로 추정되었다. 또한 형질간 유전상관의 결과를 살펴보면, 90 kg 도달일령과 일당증체량, 등지방두께 및 등심단면적에서의 유전상관이 각각 -0.992, 0.130, 0.358, 일당증체량과 등지방두께, 등심단면적에서의 유전상관은 각각 -0.142, -0.361, 등지방두께와 등심단면적간에는 -0.243로 나타났다. 90 kg 도달일령과 일당증체량간에 고도의 부의 상관을 보였으며, 90 kg 도달일령과 등지방두께, 등심단면적은 중저도의 정의 상관을 보였으며, 나머지 형질간에는 부의 상관을 보였다. 듀록 선발시 산육형질간 유전상관을 고려한 개량목표 설정이 필요할 것으로 사료된다.