Adoxophyes paraorana는 배, 사과 등의 주요 해충으로, 국내에는 A. honmai 및 A. orana와 혼재되어 있다가 2012년에 들어서야 새로운 신종으로 보고되었다(Byun et al., 2012). 이에 따르면 A. paraorana는 국내에 기 보고된 A. orana, A. honmai와 매우 유사한 형태적 특징을 가지고 있어 구분이 쉽지 않고, COI 바코드를 이용한 분자생물학적 연구에서는 약 5% 정도의 염기서열상의 차이를 보이고 있다. 그러나 최근 종간 구분 및 분류에 COI 바코드 유전자를 이용하는데 대한 문제점이 거론되고 있고, 특히 COI 유전자보다 다른 mtDNA 유전자에서 종간 구분에 필요한 차이가 더 많이 나타나기도 하여 이에 대한 비교연구가 진행되고 있는 상황이다. mtDNA 상의 12 가지 대표적인 단백질 발현 유전자들을 대상으로 Adoxophyes complex내 세 종의 염기서열의 차이를 비교하였다. 그 결과, COI에 비해 더 큰 차이를 나타내는 유전자들이 확인되었으며, 이를 속내 변이 수준에서 Cameron (unpubl. data)의 데이터와 비교한 결과, 서로 다른 속에서도 일정하게 큰 종간 차이를 나타내는 유전자는 COI 보다는 ND6, CytB, 그리고 ND5인 것으로 확인되었다. 따라서 Adoxophyes complex와 같은 유사 해충 종간의 구분을 위한 specific primer set의 개발은 ND6와 같은 유전자를 대상으로 하는 것이 COI에 비해 더 명확한 결과를 나타낼 것으로 판단된다.

스트레스 음파(5,000 Hz, 95 dB)는 아메리카잎굴파리(Liriomyza trifolii) 번데기의 성충 발육을 억제시켰다. 이러한 발육 교란에 대한 생리적 원인을 규명하고자 이 곤충의 스트레스 음파에 대한 발현 유전체를 무처리 곤충과 비교 분석하였다. 발현유전체는 전사체를 대상으로 하였으며, 이는 전체 RNA를 Illumina HiSeq2000을 이용한 차세대우전체 염기서열 분석 기술을 이용하였다. 처리구와 무처리구에서 전체 전사체의 분석염기수는 약 16 Gb였고, 이를 토대로 77,553개의 contig가 규명되었다. 이 contig들을 대상으로 스트레스 음파 처리에 따라 발현량 차이를 보인 비율은 약 62.8%를 차지하였다. 이 가운데 대조구에 비해 10배 이상 발현량이 감소한 contig 숫자는 3,994개이고, 증가한 contig 숫자는 1,120개를 나타냈다. 특별히 성장과 변태와 관련된 insulin 및 ecdysone 신호 유전자의 발현이 영향을 받았다. 또한 일반 물질대사와 관련된 유전자들의 발현이 스트레스 음파 처리에 따라 감소를 보였다. 그러나 스트레스 관련 유전자인 지질동원호르몬 신호전달과정 유전자들은 발현량이 증가하였다. 이상의 스트레스 음파에 따라 아메리카잎굴파리의 유전체 발현량 변화는 이 곤충의 정상적 성충 발육에 교란을 주었을 것으로 추정된다. 향후 스트레스 음파에 처리에 따라 발현에 교란을 받은 유전자들의 성충 발육 연관성에 대한 기능 분석이 필요하다.

본 리뷰의 목적은 벼 종자 저장단백질 구조분석 및 발현특성분석 결과 종합화를 통하여 종자형질 개선 등의 실용화연구를 위한 기반구축을 모색하는데 있다. 최근 벼 염색체염기서열완전해독 연구 결과를 이용한 유용형질 유전자 분리 및 실용화 연구가 많이 진행되고 있다. 특히 벼 종자 저장단백질은 인류에게는 주요 영양원으로 사용되어지며 종자 발아시에는 식물체 성장을 위한 질소원으로 사용되어진다. 벼 종자 저장단백질의 분류는 용매에서의 용해도에 따라 약산성 및 알카리 용해성의 glutelin, 알코올 용해성의 prolamin, 염 용해성의 globulin으로 나눈다. 벼 염색체 상에는 11개의 glutelin 유전자와 33개의 prolamin 유전자가 존재하며 prolamin 유전자의 경우 5번 염색체 15 Mb 부위에 15개의 유전자가 위치하였다. 이와 같이 종자저장단백질 유전자들이 동일 염색체 부위에 위치하고 있는 것은 진화학적으로 동일 염색체에서 유래하였거나 유사한 유전자발현 조절영역을 가지고 있음을 의미한다. Globulin 유전자는 5번 염색체에 단일 유전자로 존재하였다. 마이크로어레이를 이용한 종자저장 단백질 관련 유전자의 조직 특이 발현 양상을 분석한 결과 glutelin과 대다수의 prolamin 합성 유전자는 종자배유에서만 발현을 하였으며 소수의 prolamin과 globulin 합성 유전자는 종자배유와 발아종자에서도 발현을 나타내었다. 종자 저장단백질의 프로모터부위를 분리한 후 종자에서의 발현 양상을 분석한 결과 glutelin type C1 프로모터가 종자의 전체 부위에서 발현을 나타내었으며 glutelin type B5와 α-globulin 프로모터가 많은 양의 발현을 나타내었다. 본 리뷰를 통하여 벼 종자 저장단백질의 구조및 발현특성 연구 진행사항을 살펴보았다. 이러한 연구 동향분석은 종자형질 개선 및 물질생산 등의 실용화 연구를 수행하는 연구자들에게 최근의 연구 현황을 제공할 수 있을 것으로 생각된다.

The bovine fatty acid binding protein 4 and 5 (FABP4 and 5) is a major positional and physiological candidate gene for the bovine marbling and carcass weight. The aim of this study was to evaluate the association between economic traits of Korean cattle (Hanwoo) and genetic variation in fatty acid binding protein 4 and 5 (FABP4 and 5) genes within carcass/meat quality traits and the before/after of fatting in breed Hanwoo. Here, we characterized the nucleotide polymorphism of FABP4 and 5 in 86 cattle. We were detected the variability of three types (GG, AG, and AA) by PCR, and economic traits were analyzed by the mixed regression model implemented in the ASReml program. As the result of statistical and supersonic analysis, FABP4 gene was highly showed significant effect (p<0.006) on marbling score (MS), in contrast FABP5 gene was lowed (p<0.084) on MS before fatting. But, FABP4 gene was highly showed significant effect (p<0.0054) on MS, in contrast FABP5 gene lowest (p<0.0899) on MS in the after of fatting. Compare to supersonic result before fatting in FABP4 gene, it was detected type GG: (p<7.18), AG: (p<8.50), and AA: (p<10.50) (n=50), showed type GG: (p<4.88), AG: (p<2.33), and AA: (p<0.00) after weed out (n=20). Futhermore, it was detected type GG: (p<9.30), AG: (p<7.95), and AA: (p<7.40) (n=50) before fatting in the FABP5 gene. It was shown type GG: (p<2.67), AG: (p<3.50), and AA: (p<5.00) after weed out (n=50). Our results indicate that FABP4 and 5 gene transcription is regulated by the environment of feeding and management, and suggest that feeding and management could be potential key in determining FABP4 and 5 genes transcription for carcass/meat quality traits in breed Hanwoo.

Stearoyl-CoA desaturase (SCD1) gene plays important role in fatty acid composition. In order to find marker-assisted selection (MAS) for improving the economic trait, this study was performed to identify the 878T>C single nucleotide polymorphism (SNP) on SCD1 gene. Three genotypes (CC, CT, and TT) were detected in 878T>C SNP of SCD1 gene from 103 Hanwoo population by polymorphism chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and economic traits were analyzed by general linear model. The frequency of allele C and T was 0.534 and 0.466, also the genotype frequency of CC, CT and TT was 0.252, 0.563, and 0.184, respectively in the Hanwoo population. The TT genotype of SCD1 gene showed a significantly higher measures (p<0.05) of carcass weight (CW) than CT, CC genotype. No significant association was detected between genotype and other economic trait (marbling, backfat thickness, and longissimus muscle area) in this study. The results revealed that SCD1 gene 878T>C SNP could be useful for effective MAS to increase the economic quality in Hanwoo population.

한우 고급육 생산을 위해 종모우의 개량과 선발이 이루어지고 있으나 좀 더 효율적인 개 량을 위해서는 고급육을 생산할 수 있는 한우 암소의 개량이 필수적이다. 따라서 본 연구는 경기도 안성지역 한우의 육질 개량을 위해 지역 한우농가의 소를 대상으로 육질 초음파 측 정과 육질관련 유전자와의 비교 분석을 하기 위해 실시하였다. 육질분석을 위해 3산 이상 한우 번식우 86두를 대상으로 초음파로 등심단면적, 등지방두께, 근내지방을 측정하였다. 각 개체별로 혈액을 채취하여 유전자를 분석하였으며, 유전자 분석은 육질관련 유전자로 알 려진 FABP4와 FABP5-1, FABP5-2를 이용하였다. 개체별로 고급육 생산을 위한 사양관리 전과 사양관리 후 표현형과 유전자와의 상관 관계를 분석하였다. 번식우의 일반 사양관리 조건(비육전)에서 FABP4는 육질초음파 측정 결과와 유전자 분석과의 상관 관계가 0.006으 로 매우 높은 것으로 나타났다. 그러나 FABP5는 상관 관계가 0.084로 비교적 낮은 결과를 보였다. 그러나, 비육후 도축하였을 때 FABP4는 육질초음파 측정 결과와 유전자 분석과의 상관 관계가 0.0054로 매우 높은 것으로 나타났다. 그러나 FABP5는 상관 관계가 0.0899로 비교적 낮은 결과를 보였다. FABP4 유전자에서 비육전 초음파 측정 결과와 비교하였을 때 GG type은 7.18, AG type은 8.50, AA type은 10.50이었으나(n=50), 비육후 도축한 결과 GG type에서 4.88, AG type은 2.33, AA type은 나타나지 않았다(n=20). FABP5 유전자에 서 비육전 초음파 측정 결과와 비교하였을 때, GG type은 9.30, AG type은 7.95, AA type 은 7.40이었으나(n=50), 비육후 도 축결과는 GG type에서 2.67, AG type은 3.50, AA type 5.00으로 나타났다(n=20). 두 가지 유전자에서 비육전과 비육후 유전자와 표현형과의 관계 가 반대로 나타났음을 알 수 있었다. 즉, 이 결과를 통해 육질관련 유전자를 보유하고 있더 라도 비육을 하지 않고 일반 번식우 사양관리를 하였을 때 육질이 떨어진다는 것을 알 수 있었다.

Antibiotic resistance in animal isolates of enterococci is a public health concern, because of the risk of transmission of antibiotic-resistant strains or resistance genes to humans through the food chain. This study investigated phenotypic and genotypic resistances profile of tetracycline in 245 Enterococcus isolates from bovine milk. A total of 245 enterococci were isolated from 950 milk samples. The predominant strain was E. faecalis (n = 199, 81.2%) and E. faecium (n = 25, 10.2%). E. avium (n = 7, 2.9%), E. durans (n = 6, 2.5%), E. gallinarum (n = 4, 1.6%), and E. raffinosus (n = 4, 1.6%) were also isolated. Of the 245 enterococcal isolates 76.3% (n = 187) displayed tetracycline resistance (≥ 16 μg/ml). Of the 187 tetracycline-resistant isolates, 83.4% (n = 156), 16.1% (n = 30), and 26.7% (n = 50) possessed the genes tet(M), tet(L), tet(S) respectively. While 3.2% (n = 6) of the tetracycline- resistant isolates possessed all three genes tet(M) + tet(L) + tet(S), 8.6% (n = 16), 16.0% (n = 30), and 2.7% (n = 5) of them possessed two genes tet(M) + tet(L), tet(M) + tet(S), and tet(L) + tet(S) respectively. The tetracycline resistance pattern investigated in this study was attributable mainly to the presence of tet(M).

본 연구는 전이인자 Ac/Ds를 이용하여 세계적인 경쟁력을 갖춘 삽입변이 집단을 구축하고 Ds 삽입에 대한 분자학적 정보를 획득하여 database 화에 이용하는 것을 목적으로 하였다. 또한 농업적 유용유전자들의 생물학적 기능을 구명하고 생명공학적 방법을 통하여 새로운 작물 창출에 활용하고자 한다. 본연구를 통하여 얻을 수 있는 자료와 정보는 벼의 유전자 기능분석을 보다 효율적으로 실시하고 유용 유전자를 선발하여 육종에 이용함과 아울러 또한 이들의 지적 소유권 획득에 기초자료로 이용될 수 있을 것이다. 1. T1 진전에 의한 대량 고정종자 생산 확보를 위해 Largescale screening 활용하고 발아 활력 유지를 위해 종자를 장기보존하였다. 그 결과 Ds Knockout 육종소재의 안정적 재료공급 체계 확립하였는데 종자 증식용 파종상의 규격화를 통한대량 증식 방법 확립였고 증식계통의 목적에 맞는 재배 방법채택을 통한 편의성을 증진하였다. 2. 변이체의 선발은 각 생육 시기별 변이체 특성검정 및 선발하였으며 2008년도에는 변이율이 5.15%를 보였으나 2009년에는 4.34%로 낮았으며 평균 4.75%의 변이율을 나타냈다. 2010년 증식계통은 생육이 불량하여 표현형 조사는 불가하여 바로 이앙하여 증식하였다. 특히 spotted leaf(spl)의 형태를 나타내는 변이형이 우점하였다. 유묘기의 Ds 증식 집단에서의 표현형 변이는 주로 엽록소 이상을 보이는 변이체가 많이 관찰되었다. 3. 흑미 삽입변이체의 종자특이 전사인자의 발현 분석을 수행하기 위하여 컴퓨터 분석법을 이용하여 흑미 종자의 안토시아닌 생합성 발현 유전자를 동정하고 안토시아닌 생합성 유전자의 발현 분석을 통한 합성 기작 연구를 수행하였다. 그 결과 흑미 종자 삽입변이체 선발하였는데 115,000점의 Ac/Ds 삽입변이체 중 흑미 9계통을 선발하였다. 4. 흑미 종자의 유전자 발현 분석을 연구하기 위하여 Microarray 통계분석을 실시하였는데 672개의 안토시아닌 생합성 관련 유전자 중 전이인자 hyper-geometric 통계 분석으로 12개 전이인자 분류별 82개의 생합성 관련 전이인자 유전자 선발하였다. 5. 최근 기능유전체 연구의 효율을 높이기 위하여 변이체에대한 총체적인 해석과 함께 변이체의 표현형 변이와 삽입염기서열 분석의 연관성을 데이터 베이스화하는 이른바 Phenome 데이터베이스로 가는 추세이다. 이러한 Phenome 분석에 삽입변이집단의 데이터베이스가 활용될 것으로 기대된다.

Myopalladin (MYPN) is an important expression gene associated with regulation of Z-line structure in muscle and maintains sarcomeric integrity. In this study, we investigated the association between MYPN A1795G SNP (single nucleotide polymorphism) and carcass traits (LMA, longissimus muscle area; CW, carcass weight; BF, backfat thickness; MS, marbling score) in Korean cattle. The MYPN A1795G SNP was genotyped in 212 steers and analyzed the associations with carcass traits by PCR-RFLP (Restriction fragment length polymorphism) method. The allele frequencies were 0.566 for G allele and 0.434 for A allele. And the genotype frequencies of GG, GA, and AA genotype were 32.1%, 49%, and 18.9%, respectively. Association analysis indicated that the A1795G SNP of MYPN gene showed a significant association with LMA (p<0.05). The steers with GG genotype had higher LMA than those with the genotypes AA. But no significant associations were observed in other carcass traits (CW, BF, MS). The steers with the GG genotype showed higher CW and BF than those with the genotypes AA and GA. These results suggest that the A1795G SNP of the MYPN gene is associated with LMA and may be useful for candidate marker-assisted selection to increase the levels of LMA in Korean cattle.

The objective of this study was to find out candidate genes associated with litter size trait in pigs of inbred Large Yorkshire and Landrace populations. 86 sows were screened for candidate genotypes along with litter size data recordings. Association of litter size with genotypes of candidate genes were investigated to verify the usefulness of each gene's genotypes as markers for the trait. For the lines of Large Yorkshire, PRLR3 and RBP4 genes were genotyped. Frequency distribution of PRLR3 with genotypes AA, AB and BB were each 0.14, 0.44 and 0.42. And the average litter size by PRLR3 genotypes were 8.83, 10.81 and 10.70 piglets per litter, the average estimated breeding values of which were 0.243, 0.332, 0.365, respectively for AA, AB and BB genotypes. Genotypic frequencies of RBP4 by AA, AB and BB genotypes were 0.10, 0.44 and 0.46. The average litter size by genotypes of RBP4 were 10.40, 10.57 and 10.35 piglets per litter and their corresponding average estimated breeding values were 0.451, 0.353 and 0.261, respectively for genotypes AA, AB and BB. Significance in differences among genotypes were not observed, but B allele of RBP4 seems to be associated with litter size. In Landrace lines, frequencies of RBP4 genotypes, AA, AB and BB were 0.29, 0.55 and 0.16. And the average litter size of these genotypes were 10.50, 11.08 and 11.00 piglets per litter. The corresponding averages of estimated breeding values of each genotypes were 0.172, 0.135 and 0.104. In Landrace lines, allele A was more likely to be associated with litter size, even if differences among average litter size were not significant. We conclude that genotyping of two candidate genes is a helpful tool to identify genetic potentials of litter size in pigs.

The relationship of several candidate genes polymorphisms with breeding values of economic traits were investigated in Korean Native Pigs. Record (2001-2006) of 546 Korean native pigs were obtained from National Institute of Animal Science, Korea having data on average daily gain (ADG), age at 70 kg (D70 kg) and backfat thickness (BF). The data's obtained were analyzed by the DF-REML (Derivative-Free Restricted Maximum Likelihood) program of Boldman using a single-trait animal model to analyse the genetic parameters. The analysis of restriction fragment length polymorphism (RFLP) was conducted on 68 Korean native pigs (KNP) using single nucleotide polymorphism (SNP). Different genotype frequencies of 5 candidate genes such as MC4R, PRKAG3, FABP3, ESR and PRLR3 were observed in KNP. Significant relationship of AA and AB genotype between MC4R polymorphic site and breeding value for average daily gain (ADG, p<0.05) was observed. PRKAG3 polymorphic sites were also found to be significantly related to breeding values for ADG, AA, AB genotype (p<0.05) and also, for Backfat thickness (BF), days to 70 kg and BB genotype (p<0.05). In conclusion, selection method would be more effective if it encompasses significant genotype for performance traits and that would further aid in the selection of seed stock in KNP.

Bone morphogenetic proteins (BMPs) are known to promote osteogenesis, and clinical trials are currently underway evaluating the ability of BMPs to promote bone formation in grafting procedures and fracture healing. Some studies, have independently reported that sulfated polysaccharides particularly heparin, enhance the osteoblastic differentiation induced by BMPs in vitro, and another study demonstrated that heparin enhanced the bone formation induced by BMP‐2 in vivo. This study was performed to examine adipose stem cell responses to rhBMP‐2 alone and rhBMP‐2 with heparin at 0.25, and 25 μg/㎖ concentrations, respectively, in culture media. Adipose stem cells were cultured for 2, 4, and 8 days toward the osteoblastic differentiation in rhBMP‐2 alone and rhBMP‐2 with heparin at 0.25, and 25 μg/㎖ concentrations, respectively, in culture media. Verification of the stem cell lineage was performed in two ways. The first method was a continuous sequential culture until 5th generation. The second method was using monoclonal antibodies for STRO‐1 and CD 90. Naphthol AS phosphate‐fast blue BB staining for alkaline phosphatase was used for verifying osteoblastic differentiation because Alkaline phosphatase activity had been used as an osteoblastic differentiation marker and degree of osteoblastic activity. Alizarin red staining was also used as an osteoblastic differentiation marker because it quantifies the calcium levels in cells or tissues. During the 5th generation culture, cultured cells actively proliferated, and these cultured cells showed a positive reaction to STRO‐1 and CD90 cell surface molecules. Naphthol AS phosphate‐fast blue BB staining and Alizarin red staining were positive in most samples of each group at 2, and 4 days and positive reaction was proportioned to degree of morphological differentiation. In the concentration of 25 μg/ml of heparin, the ALP activity was highest at the 2nd day in the culture, and then the activities of ALP were decreased significantly at 4, and 8 days. The ALP activity was greatest at the 4th day of the culture, and then decreased significantly at the 8th day in 0 μ g/ml and 0.25 μg/ml of heparin concentrations, Adipose stem cells could be differentiated in rhBMP‐2 in culture media, and the addition of heparin to BMP‐2 promoted differentiation of osteoblasts. Moreover, morphological differentiation was associated with the activity of osteoblasts. This study was shown that, when heparin concentration increases, the early differentiation of the cells was brought about, but the early differentiated cells were rapidly progressed to degenerative changes

우리나라 토양으로부터 분리된 (주와 김 2009) poly (butylene succinate-co-butylene adipate; PBSA) 분해균 Burkholderia cepacia PBSA-7, Bacillus licheniformis PBSA-8 및 Burkholderia sp. PBSA-9에서 PBSA 분해효소를 암호화하는 유전자를 분석하였다. PCR을 수행하여 B.cepacia PBSA-7과 Burkholderia sp. PBSA-9는 약

This study aimed at investigating the gene expression profile in basal ganglia of hexa-valence chromium exposed rat based on cDNA array analysis. For cDNA array, Sprague-Dawley male rats (300 ± 25 g) were administrated with 15 mg/kg B.W/day of potassium dichromate by gavage (0.3 ml) dissolved in saline for 10 days (n=5). For dose-related gene expression analysis, rats were administrated with 0, 1, 5 mg/kg B.W/day of potassium dichromate for 10 days. Control rats were administrated with equal volume of saline (n=5). For cDNA array analysis, RNA samples were extracted from brain tissue and reverse-transcribed in the presence of [α³²P]-dATP. Membrane sets of the Atlas array II and Toxicology array kits were hybridized with cDNA probe sets. RT-PCR and Northern blot hybridization methods were employed for validation and assessment of the dose-related gene expression profile, respectively. Among the 2352 cDNAs, 43 genes showed significant (>two-fold) changes in expression. 22 genes were up-regulated and 21 genes were down-regulated in the 15 mg/kg B.W/day hexa-valence chromium treated group than control. According to the Northern blot hybridization analysis, heat shock protein 47, neurodegeneration associated protein 1 and pituitary specific growth factor 1a genes were up-regulated, but Gamma-aminobutyl-acid a1 subunit, neuroligin2, brain calcium-transporting plasma membrane type ATPase genes were down-regulated even in the low-dose of hexa-valence chromium exposed group (1 mg/kg B.W/day) than control. Genes that detected in this study may be closely related to the hexa-valence chromium-induced neurotoxicity in the rat basal ganglia and addition study of these genes can give some more useful information about the neuro-toxic mechanism by hexa-valence chromium.

This paper considers how the optimal export level is influenced by export risk, the degree of risk-averseness for exporting firms, and those firms' cost structure. In addition, export insurance is incorporated into some simple theoretical model to analyze

Nuclear factor I-C (NFI-C) null mice demonstrated aberrant odontoblast differentiation, abnormal dentin formation, and thus molar lacking roots. However, the mechanism by which the disruption of NFI-C gene affect the expression of other genes in dental pulp cells remains unknown. In this study, in order to understand this mechanism, the gene expression of pulp cells in NFI-C deficient mice were compared to those of wild-type mice by cDNA microarray analysis. According to the cDNA microarray profile comparison, the disruption of NFI-C gene increased the expression of TGF-β and TGF-β receptor, whereas it decreased the expression of Smad proteins. Interestingly, most of the FGF-related genes were down-regulated in pulp cells by NFI-C gene disruption. Among the cell cycle-related genes, the expression of p16 and p18 were increased by NFI-C disruption, but the expression of cy clin E1 and cy clin D1 were decreased by NFI-C disruption. These results indicate that the disturbance of NFI-C gene suppressed the proliferation of pulp cells and up-regulated the expression of TGF-β and its downstream signaling molecules during root formation, contributing to the formation of short root containing abnormal dentin.